Day 5

1. 记小本本

获取示例数据：在公众号后台回复：“数据类型”即可获得

（1）R的规范赋值符号是<-，也可以用=代替

（2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行

（3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。

（4）显示工作路径 getwd()

（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。

（6）表格在R语言中称为数据框^_^

（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。

（8）数据类型（重点只有两个，剩下的不看）

向量（vector）👈重要

矩阵（Matrix）

数组（Array）

数据框（Data frame）👈重要

List

2. 向量

2.1 标量和向量的区分

元素”：元素指的是数字或者字符串（用chr表示）等，根据它可以区分两个词：

①标量：一个元素组成的变量

②向量：多个元素组成的变量

（补充：一个向量是一排有序排列的元素，以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况。）

理解元素、向量和标量

使用时，一般都会直接给变量定义，也就是“赋值”，字面意思是赋予这个变量一个数值（其实也不一定是数值，还可以是字符串/数据框等等）。

x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。

x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数

x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）

x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

如果你把这几行代码都打过了，那么x就被你赋值了4次，结果就是，第一次赋值被第二次的覆盖了，第二次的赋值又被第三次的覆盖了，以此类推，以最后一次为准哦。

2.2 从向量中提取元素

2.2.1 根据元素位置

这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改

2.2.2 根据值

xx==10#等于10的元素

xx<0

xx %in% c(1,2,5)#存在于向量c（1，2，5）中的元素

3. 数据框

将示例数据放在你的工作目录下（！！！重要）

示例数据是如何获得的？

（1）新建doudou.txt，输入以下（如果教程里让你新建，又没说在哪里，你就默认在工作目录下新建。）

X1,X2

A,1

B,

C,

D,3

E,

小抄截图中显示的NA表示空值，所以新建的时候像我一样空着就好。

用以下命令即可获得示例数据框：X<-read.csv('doudou.txt')

3.1 读取本地数据

（huahua.txt在示例数据里有，记得一定要放在工作目录里，否则报错。）

获取示例数据：在公众号后台回复：“数据类型”即可获得

sep，header是比较常用的参数，可以看帮助文档尝试理解它们的意思

3.2 查看行名和列名、行数和列数

colnames(a) #查看列名

rownames(a) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...

dim(a)#几行几列

3.3 数据框的导出

write.table(a,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

3.4 变量的保存与重新加载

这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量

save(a,file="test.RData")#保存其中一个变量

load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

3.5 提取元素

(这里的X是的刚才的变量名，实际应用要懂得替换。刚才让师姐测试我教程的时候很担忧你们粗暴地复制我的代码，最后啥也没看懂。)

3.6 直接使用数据框中的变量

iris是R语言的内置数据，可以直接使用。提取某两列作散点图：

plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)

由于昨天没有用到脚本窗口，这里正好学习一下脚本的使用和保存：将上面的代码复制到一个新的R脚本中。

然后保存到工作目录下，用凡人的方式打开，你会看到它长这样。

后缀就是R，在R语言里还是很在意后缀的。很多复杂的代码都是大神写的，就是以脚本的形式给你，要用的时候直接找到他，用Rstudio打开就好。

4. 作业

save(a,file="test.RData")这句代码如果报错object a not found，是为什么，应该怎么解决？

报错显示没有找到a这个变量，原因可能是a没有被赋值，重新运行前面给a赋值的代码 a <-给a赋值，然后再保存即可