生信技能树 R习题 11-20

11 使用R语言获取人类所有基因的名字，ID，symbol以及别名

倒是没想到18年的时候还要纠结基因名转换的问题

不过这个内容现在已经被生信马拉松最新分享的代码替代了

12 R语言读书笔记以及为什么发读书笔记

“ 我再次强调一下，我会的所有知识，我都看过5本以上的书，甚至把一本书看五遍，这个我觉得没有任何难道，任何事情想学会学好，本来需要付出的。 ”

“ 反正如果你真想学到东西，还是得买本书仔细阅读的。 ”

“ 假如你接受了我的建议，把一本书看五遍，同一个领域的书籍至少看5本，那么希望你也记录一下读书笔记与我分享，欢迎来信交流，我的邮箱是 jmzeng1314@163.com ”

太神奇了，竟然还有这样的内容

正文是R语言的基础内容

13 强行解锁R语言入门新姿势

这一篇分享了《R数据科学》（特别是英文版的链接），另外开启了一个本书的学习小组（没想到当时还有这样的活动，现在基本上是直接教其中精华的活动）

14 一文掌握SVM用法（基于R语言）

支持向量机的代码（包括基本的二分类变量，拓展的多分类变量+预测连续变量）

“ 共有9 种核函数，常用的为其中的前四个：linear，Polynomial，RBF，Sigmoid 其中 RBF 适用于因变量比较少，而 linear适用于因变量非常多，也就是本例子里面的基因非常多 ”

比较有趣的是一条评论的内容，来自王晓哲：linear kernel只能给出线性决策边界，对复杂问题拟合能力较差；对原始问题没有前提假设的情况下用rbf kernel可以拟合任意形状的决策边界，就是训练非常慢……

15 R语言学习入门导航-特别版

这篇是R语言学习的导航内容

文末给出了一些R语言的练习题（要求很高呢，至今就在第一步？）

练习（编程题）

比较R语言中apply, sapply, lapply等函数的异同；比较paste和sprintf的异同；以及其他你觉得可以比较的函数。并用R markdown展示他们的区别（可能需要你花一点时间学习Markdown以及R markdown）。

什么是正则表达式？R里面有哪些函数和第三方包（没有数量限制）可以使用正则表达式。

完成你的第一个R包（建议你先阅读与构建R包相关的资料，比如《R packages》这本书），并使用Git进行版本管理，同时上传至GitHub仓库（可能需要一些时间同时学习它）。如果你觉得你构建的R包非常有用，可以尝试提交并分享至CRAN。

完成你的第一个Shiny应用。

使用blogdown构建你的第一个博客应用。

使用xaringan构建你的第一个Web PPT。

使用bookdown构建你的第一本书。

16 芯片的探针ID找到基因名-基于R语言-一文就够

这一篇分享了芯片的注释包，不过现在有小洁老师的tinyarray了，也不用这么麻烦

17 R语言练习题10道，有答案代码，还有视频

很基本的一些题目，真正的入门R语言生信分析题目，值得做

18 使用methods函数来查看R语言里面的对象的操作方式

介绍了一个methods函数，不过好像现在没有什么实际用处

19 生信人应该这样学R语言系列视频学习心得笔记分享

12年底分析的R语言生信马拉松笔记，对所有内容提了一个详细的大纲

最后还有一些基因在TCGA数据库表达情况和生存分析的代码分享

２０　生信工程师全套教学视频之R语言专辑纪念版

非常入门的题目，高级版也是入门版

生信技能树