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单细胞学习小组第三天

原创

用户11167001

发布于 2024-06-19 22:09:30

550

发布于 2024-06-19 22:09:30

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文章被收录于专栏：单细胞学习

今天的学习内容：

1.加载数据

2.makergene

2.1 R语言知识补充☞github的R包安装

2.2 取每个细胞簇logFC排名前n的marker基因

3.makergene的五种可视化

4.注释亚群

4.1 手动注释

4.2 自动注释

由于版本的问题，这里出现了报错！！！

那就换版本跑喽，V5和V4手动注释的结果来看，每个cluster对应的细胞还是一致的。

V5版本自动注释出图

原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。

如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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