对Spatial ATAC–RNA-seq技术,研究人员使用甲醛固定的冰冻组织切片,首先用预装有DNA adapter的Tn5转座酶复合物进行处理,随后将同一组织切片在包含生物素,连接序列和poly-T的DNA adapter中孵育以启动逆转录。之后,在组织切片上依次放置两个方向垂直的微流控芯片,分别引入空间编码Ai(i=1−50或100)和Bj(j=1−50或100),从而形成一个二维的、由空间编码定义的组织像素网格,每个像素点由Ai和Bj编码(总编码像素数=2500或10000)。最后,组织在反向交联后释放编码的cDNA和基因组DNA(gDNA)片段,将cDNA使用链霉亲和素珠富集,gDNA片段保留在上清液中。分别构建gDNA和cDNA的文库用于下一代测序。
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