生信分析中linux的使用2-文件管理

今天的是三周合计15天的数据挖掘授课学员一点一滴整理的授课知识点笔记哦，还有互动练习题哈，欢迎大家点击文末的阅读原文去关注我们学员的公众号哦！

生信技能树学习笔记

Linux里的文件

1.文件的传输

2.文件的表示

文件夹管理或路径有关的符号：

. 当前目录 .. 上一级目录

~ 家目录：每个用户的家目录都不同

/ 只有当 / 在路径的最前面时才是根目录，

其他位置的 / 都是目录层级分隔符

3

.

4.系统操作命令

例如

5.关于文件的操作命令

命令

常见用法：ls [参数] [路径/目录/文件名]

ls ## 列出当前目录的文件

ls ./ ## 同上，‘.’号代表当前目录

ls ./*txt ## 列出当前目录下以 txt 结尾的文件

ls ../ ## 列出上层目录的文件

ls -a ## 列出当前目录下的所有文件，包括隐藏文件

ls -l ## 列出当前目录下文件的详细信息

ll ## 等同ls -la ，自定义的别名

ls -lh ## 加上 -h 参数，以 K、M、G 的形式显示文件大小

ls -lh / ## 列出根目录下文件的详细信息

注意：* 匹配任意多个字符（0到正无穷）

？匹配任何单个字符

cd：change directory

常见参数：没有

常见用法：cd [路径/目录]

cd .. ## 切换到上层目录，相对路径

cd / ## 切换到根目录

cd /teach/ ## 切换到根目录下的teach，绝对路径

cd - ## 返回上一次的工作目录

cd ~ ## 回到用户家目录

cd ## 同上，回到用户家目录

注意：绝对路径：从根目录开始引起的全路径

相对路径：就是相对于当前工作目录的路径

mv：move.移动或者重命名

常见用法：mv 待移动的文件 移动到哪个目录

mv 待重命名的文件 重命名后的文件名

cp：copy and paste

常见参数：-r, copy directories recursively

常见用法：cp [OPTION] SOURCE DIRECTORY

要说明：1.拷贝谁2.到哪儿去

ln：link 链接，分软链接（常用）和硬链接（默认）.

常见参数：不加参数即为硬链接，加上 –s 参数即为软链接，

软链接的作用类似快捷方式

常见用法：ln –s TARGET DIRECTORY

压缩/解压缩

tar：tape archive 压缩或者解压文件.

常见参数：-c ## 创建一个新的tar归档文件（创建压缩文件）

-x ## 从已有tar归档文件中提取文件（解压缩）

-f ## 输出结果到文件或设备

-v ## 在处理文件时显示文件（显示处理进度）

-j ## 将输出重定向给bzip2命令

-z ## 将输出重定向给gzip命令

常见用法：

解压：tar [参数] [待解压包]

压缩：tar [参数] <压缩后文件名> [待压缩文件/目录]

打包是指将一大堆文件或目录变成一个总的文件

压缩是将一个大的文件通过一些压缩算法变成一个小文件。

Linux 中很多压缩程序只能针对一个文件进行压缩，这样当你想要压缩

一大堆文件时，你得先将这一大堆文件先打成一个包（tar命令），然后

再用压缩程序进行压缩（gzip、bzip2或zip命令）。

常用Linux快捷键

Ctrl+Z: 暂停任务

Ctrl+K:剪切光标位置到行尾的字符

Ctrl+W: 剪切一个单词

Ctrl+Y: 粘贴命令行剪切的内容

Ctrl+A: 回到行首

Ctrl+E: 回到行尾

Ctrl+C: 终止任务

Ctrl+L: 清屏

Ctrl+U: 剪切光标位置到行首的字符

Tab: 补全 两种使用方式：“按一下”和“多按几下”

文件名 不要用中文字符和空格，用下划线或点号代替

选中 双击选中一个单词，三击选中一行

Q1：有没有什么网站可以系统地查阅所有的linux命令及详细参数？

http://linux.51yip.com/

linux命令手册

Q2：有没有什么书籍可以系统地学习linux相关的知识？

https://wizardforcel.gitbooks.io/vbird-linux-basic-4e/content/

鸟哥的Linux私房菜：基础学习篇 第四版（在线阅读版）