经常要配置生物信息/深度学习电脑环境？一文少花90%看教程的时间

由于本人对Linux系统学艺不精，在摸索的过程中多次由于不明原因搞崩系统，包括但不限于：低估数据分析的过程性文件大小，储存溢出；没有安装虚拟环境，软件包、脚本之间不兼容，项目被迫shutdown。

并且，中间又穿插了笔记本CPU烧掉、换电脑、装机等过程。因此在此过程中积累了丰富的Linux幼崽配置经验，为了方便日后再出现此类情况，故把完整流程附上，以节约时间。

声明：本教程为一系列繁琐过程的整合，适用于有一定环境配置基础的，但又不想花时间再过一遍网上教程的人，如有步骤表达不明确请自行到各大平台检索。

Python环境安装

官网下载anaconda3，安装过程选择默认，记得勾选将anaconda放入环境变量。

在开始菜单搜索anaocnda prompt

创建一个环境

conda create -n py39 python=3.9
conda create -n py39 python=3.9 -c #网络差时用于指定channel
conda remove -n py39 --all #删除环境
conda config --add channels 持久通道地址，记得加s！！
conda config --remove channels 去除持久通道地址，记得加s！！
conda list  #查看该环境下的包

如果想看详细的配置文件里面有什么

conda config --show #查看配置文件的所有信息
conda config --get #查看配置文件里channel的信息

通道（channel），其实就相等于下载地址

上pytorch官网，点击get started按照自己的配置来复制安装命令，stable为稳定版本，preview为抢先版。有独立显卡才安装cuda版本。

确保CUDA Driver版本领先于CUDA Runtime版本，否则Runtime的新功能有可能无法在显卡上实现

确定自身GPU cuda，命令行输入：nvidia-smi

如果没有显示东西，有可能是没安装显卡驱动，请到对应官网安装

验证pytorch是否安装成功

conda activate 环境名字
python
import torch
torch.cuda.is_available()

安装pytorch，勾选全部，包括环境变量。

新建project时依次选“custom environment”，“generate new”，base python的位置“E:\develop\anaconda\env\py39\tools\python.exe”（anaconda中tools里面有启动项）

在选择环境的时候，请坚定不移地选择绿色的圆圈所标示的conda environment，不要碰其他的

否则你就会无缘无故的下载多了两个什么也没有配置好的环境

jupyter环境配置

如何把默认路径改为自己的开发环境

jupyter在7.*以上的，修改配置文件，已经没有c.notebook.dir。需要查找The directory to use，对root_dir进行修改（记得去掉注释和注释前的空格）

删环境变量的时候不要删错了

教程参考

https://www.cnblogs.com/zwt20120701/p/11253297.html#:~:text=%E8%8F%9C%E5%8D%95%E4%B8%AD%E6%89%93%E5%BC%80Anaconda%20Prompt%20%E8%BE%93%E5%85%A5%E5%91%BD%E4%BB%A4%20jupyter%20notebook%20--generate-config%20%E6%A0%B9%E6%8D%AE%E4%B8%8A%E9%9D%A2%E8%BF%90%E8%A1%8C%E5%A4%84%E7%9A%84%E8%B7%AF%E5%BE%84%E6%89%93%E5%BC%80C%3AUsersHS.jupyterjupyter_notebook_config.py%E6%96%87%E4%BB%B6%20%E7%AC%AC%E4%BA%8C%E6%AD%A5%EF%BC%9A%E6%9B%B4%E6%94%B9%E9%85%8D%E7%BD%AE,c.NotebookApp.notebook_dir%20%3D%20%27%27%20%EF%BC%8C%E5%8E%BB%E6%8E%89%E8%AF%A5%E8%A1%8C%E5%89%8D%E9%9D%A2%E7%9A%84%E2%80%9C%23%E2%80%9D%EF%BC%88%20%E6%B3%A8%E6%84%8F%EF%BC%9A%E8%BF%99%E8%A1%8C%E5%89%8D%E9%9D%A2%E4%B9%9F%E4%B8%8D%E8%83%BD%E6%9C%89%E7%A9%BA%E6%A0%BC%E5%93%A6%20%EF%BC%89%EF%BC%9B%20%E5%9C%A8%E6%89%93%E7%AE%97%E5%AD%98%E6%94%BE%E6%96%87%E4%BB%B6%E7%9A%84%E4%BD%8D%E7%BD%AE%E5%85%88%E6%96%B0%E5%BB%BA%E4%B8%80%E4%B8%AA%E6%96%87%E4%BB%B6%E5%A4%B9%EF%BC%88%E5%BE%88%E9%87%8D%E8%A6%81%EF%BC%8C%E6%9C%80%E5%A5%BD%E6%98%AF%E8%8B%B1%E6%96%87%E7%9A%84%EF%BC%89%20%EF%BC%8C%E7%84%B6%E5%90%8E%E5%B0%86%E6%96%B0%E7%9A%84%E8%B7%AF%E5%BE%84%E5%A1%AB%E5%9C%A8%E5%8D%95%E5%BC%95%E5%8F%B7%E4%B8%AD%EF%BC%8C%E4%BF%9D%E5%AD%98%E9%85%8D%E7%BD%AE%E6%96%87%E4%BB%B6

各软件官方网站

https://www.anaconda.com/download/

https://www.jetbrains.com/edu-products/download/#section=pycharm-edu

https://pytorch.org/get-started/locally/

https://www.nvidia.cn/drivers/lookup/

各类镜像

清华镜像

https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main

北京外国语大学镜像

https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main

阿里巴巴镜像

http://mirrors.aliyun.com/anaconda/pkgs/main

自己看过的优秀网络教程

https://www.bilibili.com/video/BV1S5411X7FY?p=23&vd_source=091ff76baf38fbce1e367eb6b6daace7