卵巢癌突变过程驱动位点特异性免疫逃避（突变 + scRNA + 空间）

作者，Evil Genius

时间很快，马上国庆了，国庆前我们要把单细胞空间外显子的课程上完，希望大家都能学到真本事，发好的文章，这样我就可以写大家的文献推文了。

不得不说现在真的是单细胞+时代了。

虽然我们都是小人物，但是都身处在时代的洪流，我们都面临着不同的机遇和挑战。

就像数码宝贝那样，为什么都是亚古兽第一个进化？ 因为，无论做什么事，先用勇气开道。 为什么巴达兽总是最后一个进化？ 因为当你的友情，诚实，爱心，知识，纯真和光明都被现实无情的击碎后，千万别忘了，仍要心存希望！

今日参考文献

知识积累

• 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)是一种典型的基因组不稳定性癌症，由不同的突变过程、肿瘤异质性和腹腔内扩散组成。
• 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)的主要特征是拷贝数改变和基因组重排形式的深刻结构变异，这是在几乎普遍存在的TP53突变的遗传背景下产生的。
• 在大约一半的HGSOC病例中，同源重组(HR)修复途径基因如BRCA1和BRCA2的体细胞和种系改变导致HR缺乏症(HRD)。
• WGS中捕获突变过程，从单细胞RNA测序(scRNA-seq)中捕获细胞表型 + 空间数据
• 从WGS数据中推断出16个HRD- dup, 6个HRD- del和14个FBI肿瘤

结果1、Site-specific TMEs

• 淋巴细胞和髓细胞的表型免疫状态分化与肿瘤部位密切相关，这是患者内部和患者之间TMEs差异的基础，并提供了腹水免疫表型组成不代表实体肿瘤的明确证据。

• 患者体内和患者之间实体瘤和腹水的组成存在很大差异

结果2、肿瘤细胞表型多样化

• 癌细胞中的突变过程如何影响癌细胞的内在信号传导和免疫表型。
• 癌细胞cluster的差异在于主要组织相容性复合体(MHC)编码基因的表达
• 癌细胞在迁移到远端位点时具有更大的表型多样性能力。

• 由于突变特征的作用，观察到幼稚T细胞和功能失调T细胞的明显组成差异，在HRD-Dup肿瘤中发现了更高的表型T细胞状态多样性，并伴有非常一致的患者内部布雷-柯蒂斯指数，这表明多样化过程在患者中反复发生

结果3、突变过程驱动免疫编辑

• HLA等位基因LOH与JAK-STAT信号和T细胞功能障碍升高的关联表明，HRD-Dup肿瘤中6p缺失的“早期”免疫介导的进化选择，与FBI肿瘤中6p LOH的进化“晚期”克隆扩增形成对比。

结果4、微环境的空间拓扑结构

• 单细胞分析将免疫表型变异与突变特征和肿瘤部位联系起来。空间 + 肿瘤特征
• 空间分析进一步强调了位点和突变特征依赖的TMEs与基于scrna序列的观察结果一致。

小结

HGSOC TMEs的细胞成分，并将它们与突变过程和空间背景联系起来。研究结果表明，即使是个性化的治疗方法也可能对患者体内广泛存在的异质性疾病无效，因此迫切需要在扩散到腹腔之前进行早期检测。

我们简单分享一下，生活很好，有你更好