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R中P值很小的情况如何解决?

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用户11845082
发布2025-09-21 10:58:22
发布2025-09-21 10:58:22
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小编正在学习生信基础部分,目前在对差异基因进行差异分析,到了做火山图的部分。

红色右上方P值太小了
红色右上方P值太小了
返回看了这个数据集
返回看了这个数据集

我用的limma包进行的差异分析,但是在做火山图的时候,发现了异常值,就是存在了P值无限接近0的基因,这使得我有点不知所措,看了一篇博主对此的解释谈谈那些R处理结果中非常小的p值-腾讯云开发者社区-腾讯云

但是还是不是很理解

是要用.Machine$double.xmin替换么?

所以我用.Machine$double.xmin替换了,并用BH矫正了P值,重新绘图 结果如图所示

但是我仍然觉得有问题 怪怪的 是否到时候投稿的时候是否投稿人会问?

求解决

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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