【系统性红斑狼疮研究】SYSCID：一个总结了SLE、RA和IBD分子机制图形交互式网站

SYSCID网站介绍

URL：https://syscid.elixir-luxembourg.org/

全称：A Systems medicine approach to chronic inflammatory diseases 描述：SYSCID图谱是一个涵盖IBD（炎症性肠病）、RA（类风湿性关节炎）和SLE（系统性红斑狼疮）之间的分子交互。该图谱可作为IBD、RA和SLE分子机制的交互式图形综述，并帮助理解多组学数据的复杂性。 成立年份：2023年 最后更新：2023年11月 可访问性：开放访问，国内可访问，目前可用，无需注册。 国家/地区：卢森堡

网站探索SLE分子机制实操

1.登录网站https://syscid.elixir-luxembourg.org/，网页界面如下。交互式图形界面，用鼠标滚轮可以放大缩小。不同色块代表着组织、细胞类型或者分子通路名称。如果要看更细致的分子机制，则需要通过Backgroud来调整图形显示。

2.将背景调整Network,然后点击2所在的Overlays，出现3所在界面，选择SLE MECHANISMS View。3所在Downlad只是文献PubMed ID号。不是下载图片。

3. 当我们选择只看SLE机制通路时候，其分子通路用橙色加粗。

4.我们可以放大查看具体的分子与分子，细胞与细胞之间的相互作用。

5.点击分子，可以查看分子名称注释ID以及靶向药物与化合物信息。1选择所在位置的分子。2. 分子名称。3 分子所在的细胞区域。 4.分子名称各种类型ID。5-6靶向的药物与化合物。7 是橙色是SLE分子机制相关的通路。

6.搜索基因：可以在1所在搜索框进行这个分子机制图中搜索感兴趣的基因所在位置。如输入Bcl6,点击Q。然后2所在位置出现搜索结果，点击3所在位置。即可见分子机制图中BCL6所在位置。

7.搜索细胞或者通路：实际上在这个分子机制图上，凡是出现的文字都可以被搜索到。只要在输入框输入关键字，其自动匹配相关内容。如输入Treg,就出现两个结果，一个细胞类型，一个相关生物学过程。

后记：自身免疫性疾病专门网址非常少，之前推荐过ADEX数据库，是专门分析自身免疫性疾病基因转录与DNA甲基化网址。这个总结SLE，RA，IBD分子机制的网址，对于研究自身免疫相关研究者来说极具价值。本网站也是迅速学习了解SLE分子机制的很好途径。虽然对于SLE分子机制总结没法做到100%细致，但是比较重要经典的分子与信号通路做了尽可能的概括，值得研究者探索找到新的研究思路。