MIT开源BoltzGen：迈向AI驱动的通用型结合剂设计

BoltzGen是MIT团队打造的一个全原子生成模型，能够设计涵盖所有模态的蛋白质和多肽，以结合各类生物分子靶标。BoltzGen在其生成式设计过程中构建了关于靶标-结合剂相互作用的强大结构推理能力。这是通过统一设计与结构预测来实现的，从而产生了一个同样能达到最先进折叠性能的单一模型。BoltzGen的生成过程可以通过一套灵活的设计规范语言进行控制，该语言支持共价键、结构约束、结合位点等多种设定。作者通过在总计八项不同的湿实验室设计项目（涵盖26个靶点的功能和亲和力检测）中对这些能力进行了实验验证。这些实验涵盖的结合剂模态从纳米抗体到二硫键环肽，靶标范围包括从无序蛋白质到小分子。例如，作者针对九个与任何已知结合结构蛋白相似度低的新靶标，分别测试了15种纳米抗体和蛋白质结合剂设计。对于这两种结合剂模态，作者均在66%的靶标上获得了纳摩尔级结合剂。 模型权重、数据、推理及训练代码均已发布在：https://github.com/HannesStark/boltzgen

原文模型描述图

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参考文献：HannesStark, BoltzGen: Toward Universal Binder Design, bioRxiv 2025.11.20.689494

YouTube链接：https://www.youtube.com/watch?v=9d_QWUUI1Qo