这是最初在这里提出的问题的重复:Indicating the statistically significant difference in bar graph,但要求使用R而不是python。
我的问题很简单。我想在R中生成条形图,如果可能的话,使用ggplot2,并显示不同条形图之间的显著差异,例如,生成以下内容。我已经找过了,但找不到另一个问题,问的是完全相同的事情。
发布于 2013-02-19 21:18:53
您可以使用geom_path()
和annotate()
来获得类似的结果。对于这个例子,你必须自己确定合适的位置。在geom_path()
中,提供了四个数字来获取用于连接线的小刻度。
df<-data.frame(group=c("A","B","C","D"),numb=c(12,24,36,48))
g<-ggplot(df,aes(group,numb))+geom_bar(stat="identity")
g+geom_path(x=c(1,1,2,2),y=c(25,26,26,25))+
geom_path(x=c(2,2,3,3),y=c(37,38,38,37))+
geom_path(x=c(3,3,4,4),y=c(49,50,50,49))+
annotate("text",x=1.5,y=27,label="p=0.012")+
annotate("text",x=2.5,y=39,label="p<0.0001")+
annotate("text",x=3.5,y=51,label="p<0.0001")
发布于 2017-04-05 20:39:09
我知道这是一个古老的问题,Didzis Elferts的答案已经为这个问题提供了一种解决方案。但我最近创建了一个ggplot扩展,它简化了添加重要性条的整个过程:ggsignif
无需繁琐地将geom_path
和annotate
添加到绘图中,只需添加单个图层geom_signif
即可
library(ggplot2)
library(ggsignif)
ggplot(iris, aes(x=Species, y=Sepal.Length)) +
geom_boxplot() +
geom_signif(comparisons = list(c("versicolor", "virginica")),
map_signif_level=TRUE)
有关该软件包的完整文档,请访问CRAN。
发布于 2016-10-18 04:48:18
我使用了上面建议的方法,但我发现annotate函数比geom_path函数更容易换行。只需使用“段”而不是“文本”即可。您必须按线段拆分,并为每个线段定义开始和结束的x和y值。
生成3条线段的示例:
annotate("segment", x=c(1,1,2),xend=c(1,2,2), y= c(125,130,130), yend=c(130,130,125))
https://stackoverflow.com/questions/14958159
复制相似问题