Cython尝试编译两次，但都失败了
Cython尝试编译两次，但都失败了
提问于 2018-05-21 19:36:50
我有一个与此处所示非常相似的setup.py文件：https://stackoverflow.com/a/49866324/4080129。它看起来是这样的：
from distutils.core import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize
import numpy
sources = ["hs/subfolder/detect.pyx",
"hs/subfolder/Donline.cpp",
"hs/subfolder/Handler.cpp",
"hs/subfolder/Process.cpp",
"hs/subfolder/Filter.cpp",
"hs/subfolder/Localize.cpp"]
exts = [Extension(name='hs.detect',
sources=sources,
extra_compile_args=['-std=c++11', '-O3'],
include_dirs=[numpy.get_include()])]
setup(
ext_modules=cythonize(exts),
include_dirs=[numpy.get_include()]
)有一个包含一些纯Python的包，还有一个包含Cython文件的子模块。setup.py在父文件夹中，而不是Cython文件夹中：
setup.py
hs/
some_python.py
subfolder/
detect.pyx
Donline.cpp
...etc现在，setup.py正确地编译了module/submodule/file1.cpp等所有文件，并将构建保存到build/temp.linux-x86_64-3.6/module/submodule/file1.o。然而，在那之后，它尝试编译一个名为file1.cpp的文件，这个文件并不存在(正确的文件是module/submodule/file1.cpp，并且已经被编译)。
gcc -pthread -Wno-unused-result -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -Ihs/subfolder -I/[...]/python3.6/site-packages/numpy/core/include -I/[...]/python3.6/site-packages/numpy/core/include -I/[...]/include -I/disk/scratch/miniconda/envs/my_default/include/python3.6m -c Donline.cpp -o build/temp.linux-x86_64-3.6/Donline.o -std=c++11 -O3
gcc: error: Donline.cpp: No such file or directory
gcc: fatal error: no input files
compilation terminated.
error: command 'gcc' failed with exit status 4我很困惑，这完全阻止了我的代码编译...
回答 1
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2018-06-03 21:35:11
结果是.pyx文件包含一行
# distutils: sources = Donline.cpp Handler.cpp Process.cpp Filter.cpp Localize.cpp它告诉distutils要编译什么。我没有意识到这一点，而且因为它看起来非常像一个注释掉的行，所以我没有意识到它在那里。
除了包含在setup.py文件中的那些之外，Cython还会尝试编译这些源代码，即两个源代码列表中的任何一个都不会覆盖另一个。显然，尽管这些源文件列在pyx文件中，但它们应该位于相对于setup.py文件所在文件的路径中，或者可能是相对于我从中调用python的文件夹的路径。
不管怎样，删除这行代码就解决了问题。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/50448026
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