问如何对dCHIP处理的芯片数据进行差异分析？

提问于 2024-02-29 11:01:47

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第一次从GEO上下载dCHIP（PM-MM model）算法处理的患者生物芯片数据（之前都是RMA处理的），dCHIP处理的数据能够直接进行差异分析吗？我看到有许多四位数的负值，请教一下应该用什么工具或者代码来处理以便后续对基因表达差异进行分析 ？