如何在R中永久更改.libPaths()？
如何在R中永久更改.libPaths()？
提问于 2014-06-24 21:15:34
每当我使用.libPaths()函数更改库路径顺序时，如果我重新启动R，它将恢复为默认顺序。我如何永久地更改此顺序？我正在Linux计算集群上工作(我没有管理员权限)，所以我想永久地将我的本地库添加到R中。
每次启动R时，我都必须这样做
.libPaths(c("/home/...","/home...","/local/library"))回答 2
Stack Overflow用户
发布于 2020-06-10 06:57:24
在R安装文件夹中找到Rprofile文件(没有点
find -name Rprofile
#Getting something like:
#lib/R/library/base/R/Rprofile打开文件并搜索：
invisible(.libPaths(c(unlist(strsplit(Sys.getenv("R_LIBS"), ":")),
unlist(strsplit(Sys.getenv("R_LIBS_USER"), ":") )
)))注释其他路径并添加所需路径
invisible(.libPaths(c(#unlist(strsplit(Sys.getenv("R_LIBS"), ":")),
#unlist(strsplit(Sys.getenv("R_LIBS_USER"), ":") )
"/home/users/username/R/4.0.1/lib/R/library" # desired path
)))这也很有用：(对于.bashrc文件)
export R_LIBS='/home/users/username/R/4.0.1/lib/R/library'
export R_LIBS_USER='/home/users/username/R/4.0.1/lib/R/library'Stack Overflow用户
发布于 2020-06-10 04:11:41
在Mac上，我发现在“全新”安装中没有用户库，软件包都安装在特定版本的系统库中。最终，将创建一个用户库(可能是意外创建的，也可能是通过RStudio提示符创建的)，并将其设置为将来安装包时的默认位置。因此，如果您没有密切关注，最终会得到一些安装在系统库中的包和一些安装在用户库中的包。
首先列出用户库，然后列出系统库：
.libPaths()
> [1] "/Users/<username>/Library/R/3.6/library"
> [2] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library"我喜欢把所有东西都放在一个地方(系统库)，所以为了(永久地)实现这一点，我执行以下操作：
在终端窗口中，在用户目录中创建一个.Rprofile文件：
nano ~/.Rprofile在该文件中，添加以下R代码行：
.libPaths( c(.libPaths()[2], .libPaths()[1]) )或者，添加类似的R代码行，但具有硬编码路径：
.libPaths( c("/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library", "/Users/<username>/Library/R/3.6/library") )将<username>替换为您的实际用户名。然后Ctrl-O (保存)和Ctrl-X (退出)该文件。
每一行都会切换上面列出的路径的顺序，因此路径[2] (system)是第一个(默认)，路径[1] (user)是第二个。
重要的是，通过将这行代码放到用户的.Rprofile中，它将在R每次启动时运行，您(希望)不必再担心这一点。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/24387660
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