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问如何从GEO数据库中提取单细胞RNA测序数据？
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Stack Overflow用户

提问于 2020-04-14 01:03:37

回答 1查看 234关注 0票数 0

我是R和计算生物学的新手。我正在尝试查看已发布的数据集，以便为我自己的项目检查基因表达。我很难找到教我如何从GEO NCBI数据库中分析R上的单细胞RNA测序数据的材料。

如果您对教程有任何指导或建议，我将非常感谢。

谢谢!

发布于 2020-05-02 20:58:34

您可能想查看一下BioConductor package。

安装使用

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("GEOquery")

有关如何使用此包以及从GEO读取数据的详细信息，请参阅vignette

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/61192842

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