如何使树状图看起来比在Seurat更好？
如何使树状图看起来比在Seurat更好？
提问于 2020-06-05 00:42:50
我正在尝试从Seurat的聚类功能产生的聚类中创建一个层次聚类树。他们的函数BuildClusterTree和PlotClusterTree基于SNN (共享最近邻)算法生成了一棵丑陋的树，这是ggplot2无法处理的。我正在尝试找出如何使用其他函数来绘制已由Seurat生成的聚类，但我不知道如何或哪个R包最有效。有人对我有什么建议吗？
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2020-06-24 00:18:41
为此，我建议使用clustree包。
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https://stackoverflow.com/questions/62199890
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