我是一个编程新手,很少使用python,所以当我试图解释我想做什么时,请耐心等待我:)
我有以下XML:
<?xml version = "1.0" encoding = "utf-8"?>
<Patients>
<Patient>
<PatientCharacteristics>
<patientCode>3</patientCode>
</PatientCharacteristics>
<Visits>
<Visit>
<DAS>
<CRP>14</CRP>
<ESR/>
<Joints>
<DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE>
<SWOL28>20</SWOL28>
<TEN28>20</TEN28>
</Joints>
</DAS>
<VisitDate>2010-02-17</VisitDate>
</Visit>
<Visit>
<DAS>
<CRP>10</CRP>
<ESR/>
<Joints>
<DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE>
<SWOL28>15</SWOL28>
<TEN28>20</TEN28>
</Joints>
</DAS>
<VisitDate>2010-02-10</VisitDate>
</Visit>
</Visits>
</Patient>
<Patient>
<PatientCharacteristics>
<patientCode>3</patientCode>
</PatientCharacteristics>
<Visits>
<Visit>
<DAS>
<CRP>14</CRP>
<ESR/>
<Joints>
<DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE>
<SWOL28>34</SWOL28>
<TEN28>0</TEN28>
</Joints>
</DAS>
<VisitDate>2010-08-17</VisitDate>
</Visit>
<Visit>
<DAS>
<CRP>10</CRP>
<ESR/>
<Joints>
<DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE>
<SWOL28></SWOL28>
<TEN28>2</TEN28>
</Joints>
</DAS>
<VisitDate>2010-07-10</VisitDate>
</Visit>
<Visit>
<DAS>
<CRP>9</CRP>
<ESR/>
<Joints>
<DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE>
<SWOL28>56</SWOL28>
<TEN28>6</TEN28>
</Joints>
</DAS>
<VisitDate>2009-07-10</VisitDate>
</Visit>
</Visits>
</Patient>
</Patients>这里我要做的就是更新某些“SWOL28”值,如果它们与我存储在文本文件中的patientCode和VisitDate相匹配。据我所知,元素树不包含父引用,就像它包含了父引用一样,我可以从根中使用findall(),然后从根开始向后工作。这里是我的psuedocode:
但是我被困在了第五步,我怎样才能得到一个访问列表来迭代?很抱歉,如果这是一个非常愚蠢的问题,但我已经到处寻找答案,我向你保证!我已经将代码简化为下面需要修复的部分的简单示例:
import xml.etree.ElementTree as ET
tree = ET.parse('DB3.xml')
root = tree.getroot()
for child in root: # THIS GETS ME ALL THE PATIENT ATTRIBUTES
print child.tag
for x in child/Visit: # THIS IS WHAT I CANNOT FIND THE CORRECT SYNTAX FOR
# I WOULD THEN PERFORM STEPS 6, 7 AND 8 HERE我非常感谢你们中的任何一个人对此有什么看法。我不是一个编程的自然,这是肯定的!
谢谢你,莎拉
编辑1:
根据以下SVK的建议,我尝试了以下几点:
import xml.etree.ElementTree as ET
tree = ET.parse('Untitled.xml')
root = tree.getroot()
for child in root:
print child.tag
child.find( "visits" )
for x in child.iter("visit"):
print x.tag, x.text但我得到的唯一输出是:病人,病人,没有低标签。有什么想法吗?
发布于 2013-03-26 17:04:33
您可以直接在元素“元素”下遍历所有“访问”标记,如下所示:
for x in element.iter("visit"):您可以找到元素的第一个直接子元素,该元素与以下特定标记匹配:
element.find( "visits" )看起来,您首先必须找到“访问”元素,它是“访问”的父元素,然后遍历它的“访问”子元素。如果把它们加在一起,你就会得到这样的东西:
for patient_element in root:
print patient_element.tag
visits_element = patient_element.find( "visits" )
for visit_element in visits_element.iter("visit"):
print visit_element.tag, visit_element.text
# ... further processing of each visit element here通常,请参阅xml.etree.ElementTree:http://docs.python.org/2/library/xml.etree.elementtree.html#finding-interesting-elements文档中的“查找有趣元素”一节。
发布于 2013-03-26 17:09:23
您可以使用一个CssSelector从Patient元素获取您想要的节点:
from lxml.cssselect import CSSSelector
visitSelector = CSSSelector('Visit')
visits = visitSelector(child)您可以使用相同的方法获取patientCode标记和SWOL28标记,然后可以使用element.text访问和修改元素的文本。
发布于 2013-03-26 17:39:01
如果使用lxml.etree,则可以使用xpath查找需要更新的元素。
例如。
doc.xpath('Patient[PatientCharacteristics/patientCode=$patient]/Visits/Visit[VisitDate=$visit]',patient="3",visit="2009-07-10")所以
from lxml import etree
doc = etree.parse("DB3.xml")
changes = [
dict(patient='3',visit='2010-08-17',swol28="99"),
]
def update_doc(x,d):
for row in d:
for visit in x.xpath('Patient[PatientCharacteristics/patientCode=$patient]/Visits/Visit[VisitDate=$visit]',**row):
for swol28 in visit.xpath('DAS/Joints/SWOL28'):
swol28.text = row['swol28']
update_doc(doc,changes)
print etree.tostring(doc)应该给你一些东西,其中包含:
<Patient>
<PatientCharacteristics>
<patientCode>3</patientCode>
</PatientCharacteristics>
<Visits>
<Visit>
<DAS>
<CRP>14</CRP>
<ESR/>
<Joints>
<DAS_PROFILE>28/28</DAS_PROFILE>
<SWOL28>99</SWOL28>
<TEN28>0</TEN28>
</Joints>
</DAS>
<VisitDate>2010-08-17</VisitDate>
</Visit>
</Visits>
</Patient>https://stackoverflow.com/questions/15643094
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