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问如何通过比较两个文件实现相同字符串的grep
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Ask Ubuntu用户

提问于 2017-05-17 05:14:11

回答 1查看 7.1K关注 0票数 9

我有两个文件A和B

文件A包含所有信息，而文件B包含唯一的信息ids。我想做的是比较两个文件和grep文件A中的is信息

文件A:

acb:A1S_1863    ncbi-proteinid:ABO12290
acb:A1S_1864    ncbi-proteinid:ABO12291
acb:A1S_1865    ncbi-proteinid:ABO12292
acb:A1S_0105    ncbi-proteinid:ABO10592
acb:A1S_0106    ncbi-proteinid:ABO10593

文件B:

A1S_1865
A1S_1774
A1S_1116
A1S_0106
A1S_2677

期望输出：

acb:A1S_1865    ncbi-proteinid:ABO12292
acb:A1S_0106    ncbi-proteinid:ABO10593

text-processing

command-line

回答 1

Ask Ubuntu用户

回答已采纳

发布于 2017-05-17 05:23:26

与grep：

grep -Ff fileB fileA

-f <filename>告诉grep从文件中读取模式，-F使其将模式视为固定字符串而不是正则表达式。(这是假设is没有出现在另一列中。)

票数 16

页面原文内容由Ask Ubuntu提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://askubuntu.com/questions/915973

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