我一直在尝试在R(4.0.5版)中安装Bioconductor。每次我尝试插入下面的代码时,我都会得到一些错误,比如:
>if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "3.12")
'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see
'?repositories' for details
replacement repositories:
CRAN: http://cran.csiro.au/
Bioconductor version 3.12 (BiocManager 1.30.13), R 4.0.5 (2021-03-31)
Installing package(s) 'BiocVersion'
Error in readRDS(dest) : error reading from connection
我已经尝试了其他人here和here给出的解决方案。我还以管理员身份重新启动了它。但是什么都不起作用。
我可以使用'install.package()‘命令轻松地安装cran包。我也可以使用tar.gz文件安装软件包;但是,当我尝试安装Bioconductor软件包时,就会发生这个问题。此外,使用tar.gz文件安装包也不方便,因为在Bioconductor中有很多依赖包。直到昨天一切都很好,然后突然我的R崩溃了,我无法打开R,所以我决定重新安装它。在那之后,这个问题就会发生。任何形式的帮助都将不胜感激。
发布于 2021-05-09 21:19:50
我在BioConductor包中也遇到了同样的问题。我找到了一个有效的解决方案here。
install.packages("devtools")
devtools::install_github("Bioconductor/BiocManager", ref="ghost-binary-repo")
https://stackoverflow.com/questions/67455099
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