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社区首页 >问答首页 >安装Bioconductor软件包错误--> readRDS(dest)中的错误:从连接读取时出错

安装Bioconductor软件包错误--> readRDS(dest)中的错误:从连接读取时出错
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Stack Overflow用户
提问于 2021-05-09 15:02:25
回答 1查看 362关注 0票数 2

我一直在尝试在R(4.0.5版)中安装Bioconductor。每次我尝试插入下面的代码时,我都会得到一些错误,比如:

代码语言:javascript
运行
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>if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "3.12")

'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see
'?repositories' for details

replacement repositories:
    CRAN: http://cran.csiro.au/

Bioconductor version 3.12 (BiocManager 1.30.13), R 4.0.5 (2021-03-31)
Installing package(s) 'BiocVersion'
Error in readRDS(dest) : error reading from connection

我已经尝试了其他人herehere给出的解决方案。我还以管理员身份重新启动了它。但是什么都不起作用。

我可以使用'install.package()‘命令轻松地安装cran包。我也可以使用tar.gz文件安装软件包;但是,当我尝试安装Bioconductor软件包时,就会发生这个问题。此外,使用tar.gz文件安装包也不方便,因为在Bioconductor中有很多依赖包。直到昨天一切都很好,然后突然我的R崩溃了,我无法打开R,所以我决定重新安装它。在那之后,这个问题就会发生。任何形式的帮助都将不胜感激。

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回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2021-05-09 21:19:50

我在BioConductor包中也遇到了同样的问题。我找到了一个有效的解决方案here

代码语言:javascript
运行
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install.packages("devtools")    
devtools::install_github("Bioconductor/BiocManager", ref="ghost-binary-repo")
票数 2
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原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/67455099

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