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对层级聚类树进行模块分割,定位基因在哪个模块中
图像处理
拷贝数据到 ImageGP(http://www.ehbio.com/Cloud_Platform/front/#/analysis?page=b%27Ng%3D%3D%27),并设置参数. ```
生信宝典
2022-03-27
232
0
这篇文献总结了常见的中式英语写法,来看看有没有中枪?
linux
javascript
编程算法
图像处理
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The Most Common Habits from more than 200 English Papers written by Graduate Chinese Engineering Students
生信宝典
2022-01-19
390
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画个火山图,标记下基因的名字
图像处理
Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图 一文解释了火山图如何解读。不太难看懂,而一旦看懂了,图也就知道怎么绘制了。
生信宝典
2022-01-19
894
0
轻轻松松画个热图
http
图像处理
编程算法
热图是很常见的图形展示方式,在◾图形解读系列 | 给你5个示例,你能看懂常用热图使用吗?有详细描述。热图基本原则是用颜色代表数字,让数据呈现更直观、对比更明显。常用来表示不同样品组代表性基因的表达差异、不同样品组代表性化合物的含量差异、不同样品之间的两两相似性。实际上,任何一个表格数据都可以转换为热图展示。
生信宝典
2022-01-18
610
0
热图绘制一个快乐五一
图像处理
五一假期了,来一点趣味性的。热图就是把数字转成颜色,我们去网上拿一张五一的图片,转成矩阵,存储到`wuyi.txt`文件。然后就可以用我们的热图工具定制自己的“五一快乐了”。
生信宝典
2022-01-18
227
0
BIC无代码绘制差异基因火山图
图像处理
Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图 一文解释了火山图如何解读。不太难看懂,而一旦看懂了,图也就知道怎么绘制了。
生信宝典
2021-04-29
857
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翻车实录之Nature Medicine新冠单细胞文献|附全代码
html
图像处理
github
https
git
NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述))、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集)等内容。
生信宝典
2020-05-26
1.3K
0
让你的单细胞数据动起来!|iCellR(一)
图像处理
数据分析
今天在翻阅single cell 的github时候,我看见了这个R包,允许我们处理各种来自单细胞测序技术的数据,如scRNA-seq,scVDJ-seq和CITE-Seq。
生信宝典
2019-11-22
2.1K
0
Matplotlib绘制的27个常用图(附对应代码实现)
r 语言
图像处理
python
matlab
numpy
https://nbviewer.jupyter.org/github/matplotlib/AnatomyOfMatplotlib/blob/master/AnatomyOfMatplotlib-Part2-Plotting_Methods_Overview.ipynb
生信宝典
2019-11-22
963
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gggenes绘制多物种基因结构比较
编程算法
图像处理
gggenes是ggplot2的扩展包,用于绘制基因结构图、多物种基因比较图的很好玩的工具。
生信宝典
2019-11-07
4.1K
0
万能转换:R图和统计表转成发表级的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等
windows server
图像处理
R包export可以轻松的将R绘制的图和统计表输出到 Microsoft Office (Word、PowerPoint和Excel)、HTML和Latex中,其质量可以直接用于发表。
生信宝典
2019-09-04
3.4K
0
一个震撼的交互型3D可视化R包 - 可直接转ggplot2图为3D
图像处理
github
git
开源
虽然3D的plot见得比较多了,但是看见这样的R包,我的心还是砰了一下,这个简直不能再好看了!
生信宝典
2019-07-22
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