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生信技能树

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RNA-seq入门实战（零）：RNA-seq流程前的准备——Linux与R的环境创建

ubuntu linux windows

连续两次求贤令：曾经我给你带来了十万用户，但现在祝你倒闭，以及生信技能树知识整理实习生招募，让我走大运结识了几位优秀小伙伴！大家开始根据我的ngs组学视频进行一系列公共数据集分析实战，其中几个小伙伴让我非常惊喜，不需要怎么沟通和指导，就默默的完成了一个实战！

生信技能树

2022-06-27

2.2K0

Rstudio Server 不同R版本配置和切换

https 网络安全 shell ubuntu linux

Rstudio Desktop for Windows/Mac 切换不同R版本非常简单，Tools→Global Options→General→Basic→R Sessions→R version→Change：

生信技能树

2021-04-29

11.5K0

在ubuntu20上面安装R4

ubuntu linux https 网络安全访问管理

使用root权限（系统管理员）安装最新版的R，我们的ubuntu是20，所以选择focal这个代号，然后是cran40，全部的代码如下：

生信技能树

2020-08-11

1.4K0

底层架构真的折磨死个人（急，在线等）

ubuntu linux windows bash bash 指令

本来是4~8个小时就可以跑完的，在Windows的内置ubuntu子系统运行了30个小时还看不到希望，果断杀掉进程！

生信技能树

2020-08-07

1.5K0

参考基因组用错了单细胞转录组流程照样可以走通

当然，这不是重点，麻烦的事情是粉丝仅仅是寄给我数据和md5，我校验后文件都是完整的，就直接上流程了，结果，打开一个运行日志后才发现不太对劲额。

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2020-08-07

7890

clusterProfiler到底有多难安装呢

r 语言 windows ubuntu linux

但是最近频繁看到粉丝留言表明安装clusterProfiler包失败，这个clusterProfiler是大名鼎鼎的Y叔开发，基本上是每个做生物信息学数据分析的人都会使用它的，做超几何分布检验（富集分析），而且内置了很多数据库，好用的函数。

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2020-07-30

3.5K0

windows的Ubuntu子系统ssh和ftp

ubuntu tcp/ip ssh linux windows

但是很多时候，我们可能并没有Linux服务器，这个时候其实自己的个人电脑也可以勉强成为Linux服务器：

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2020-07-29

3.5K0

遇事不慌，控制变量法帮助你

ubuntu 编程算法 centos python windows

学习过TCGA数据挖掘课程的朋友们都应该是知道，可以使用GDC工具来进行TCGA数据下载，首先需要下载一个编译后的二进制可执行的GDC工具软件文件，简单的bing搜索就可以找到官方链接，如下：

生信技能树

2020-06-28

5110

生信第一步-购买腾讯云服务器搭建自己的生信分析环境

https 网络安全 ubuntu html linux

现在因为疫情，就不去实验室了，小命要紧，居家办公，笔记本就不够看了。一遍操练下来，发现光看不练完全没用。。。学了不操练，等于没学。买服务器这一步我就不写了，直接进入正题。

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2020-04-02

3.7K0

在Ubuntu18安装rJava

linux ubuntu java 命令行工具

既然报错日志指出来了我们应该使用root权限，运行命令：R CMD javareconf

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2019-11-20

7780

为什么清华源的R镜像恰好缺了rvest包呢

ubuntu rvest tidyverse 镜像入门

然后发现诡异的报错，是这个包无法被下载，这个时候我没有紧张，下意识的认为是清华镜像问题，所以我重新下载;

生信技能树

2019-11-20

2.2K0

在Ubuntu下安装旧版seurat

云服务器 https ubuntu http 网络安全

这里首推华为云：https://www.huaweicloud.com/pricing.html#/ecs

生信技能树

2019-07-30

1.9K0

ubuntu上R语言安装gsl包

ubuntu 程序员解决方案

报错如下： * installing *source* package ‘gsl’ ... ** package ‘gsl’ successfully unpacked and MD5 sums ch

生信技能树

2019-07-30

2.4K0

在Ubuntu下安装单细胞3大R包

ubuntu linux https http 网络安全

通常来说，很多R包的安装对R版本是有要求的，比如BiocManager需要 R (≥ 3.5.0)，但是并不需要最新版R语言。

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2019-07-26

2.3K0

在ubuntu使用apt install的fastqc是有bug的

所以我就去了我的生物信息学常见1000个软件的安装代码：https://www.jianshu.com/p/ae28e8e3e9f5 找到了fastqc软件下载安装方法：

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2018-12-05

1.1K0

跟着jimmy学docker系列之第3讲：为何不创建自己的docker容器呢？

容器镜像服务容器 ubuntu .net

前面我们说到，在docker仓库下载的那个容器是错误的，因为它配置的Ubuntu库文件不够，所以我更新了，形成了自己的容器

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2018-10-25

5330

跟着jimmy学docker系列之第2讲：一个软件一个容器

容器镜像服务容器 ubuntu git

✎✎✎ 回过头来看当初在生信技能树发布的docker教程已经是2017-07-07的事情了，那是一个好日子?：我学会docker啦！希望你也可以学会其实当时只是为了写教程而学习

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2018-10-25

9850

blast2go本地化-2017教程

go http 数据库云数据库 SQL Server ubuntu

通常我们上游分析得到的蛋白序列需要和主流的数据库进行比对，完成功能注释。常用数据库一共有以几种：

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2018-09-21

3.8K0

生信技巧第5课-生信人必须安装的软件

markdown r 语言 html ubuntu

不知不觉就第5讲了，本次视频没有干货，只是为了保证入门系列视频的完整性而录制的，没啥事就不用看了，反正你需要安装一些软件就可以了。

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2018-07-27

1.8K0

使用pip安装python包的时候会多次安装依赖包

python ubuntu numpy

问题描述：我使用的是ubuntu18系统自动的py2.7还有pip9，还算是方便，在安装以前的基于pytho的软件的时候发现使用pip安装python包的时候会多次安装依赖包，虽然我设置了豆瓣镜像，安装速度非常快，但是这样重复安装基础包是不是有点浪费呢？比如使用代码： pip install --index-url https://pypi.douban.com/simple cnvkit pip install --index-url https://pypi.douban.com/simple HTS

生信技能树

2018-07-27

2.5K0

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