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生信技能树

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类器官技术日新月异

医疗工具模型腾讯芯片

但是六年前的单细胞转录组并不流行，因为没有10x这样的商业化的仪器，所以那个时候的在每个癌症领域的类器官CNS文章都是做几十个或者上百个病人的类器官培养后，做常规的转录组和肿瘤外显子数据，来说明类器官能非常好的维持其来源的原位肿瘤，这样就说明了类器官可以成为肿瘤病人的精准医疗替身！过去的五年，虽然说单细胞转录组的大行其道，但是在类器官领域的应用仍然是很有限，单细胞时代到了仅仅是2019之后的类器官研究继续“复制粘贴一波”。但是我看到的这些肿瘤领域的类器官技术的单细胞研究，仍然是说明了类器官可以成为肿瘤病人的精准医疗替身，因为从原位肿瘤样品培养后的类器官其实是富集到了恶性肿瘤上皮细胞，这样就导致了它早期的“让人诟病”的缺点，丢失了肿瘤微环境。因为openai的chatGPT在中国大陆很难被直接访问，所以我测试了一下最新的国内大模型kimi的效果，让它整理了一下前类器官面临的主要缺陷：

生信技能树

2024-04-19

360

有了单细胞数据的类器官研究其实可以不做常规基因组和转录组啦

医疗工具函数数据统计

恰好单细胞时代到了，可以让之前的CNS类器官研究文章继续“复制粘贴一波”，比如2021发表Advanced Science期刊的类器官文章：《Single-Cell Transcriptome Analysis Uncovers Intratumoral Heterogeneity and Underlying Mechanisms for Drug Resistance in Hepatobiliary Tumor Organoids》，就已经舍弃了传统的常规的转录组和肿瘤外显子数据，仅仅是看单细胞转录组。详见：只有单细胞转录组数据的肿瘤类器官研究（肝癌）。但是它主要是关心的是肿瘤病人内部的异质性，每个病人内部降维聚类分群后看特征基因，做拟时序分析看变化趋势，并没有展示类器官培养的成功性。

生信技能树

2024-04-13

680

不同癌症的类器官培养后的单细胞转录组数据差异大吗（胰腺癌和胆管癌）

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样品数量并不多，但是还试图涉及两个癌症，可能是因为病人比较特殊吧，一个病人可以同时患胰腺癌和胆管癌。但是全文并没有过多涉及到胰腺癌和胆管癌的对比，主要是关注于类器官培养后的单细胞转录组数据差异。

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2024-04-13

550

肿瘤领域的类器官文献的单细胞转录组数据分析是很有限的（膀胱癌）

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但是六年前的单细胞转录组并不流行，因为没有10x这样的商业化的仪器，所以那个时候的在每个癌症领域的类器官CNS文章都是做几十个或者上百个病人的类器官培养后，做常规的转录组和肿瘤外显子数据，来说明类器官能非常好的维持其来源的原位肿瘤，这样就说明了类器官可以成为肿瘤病人的精准医疗替身！

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2024-04-13

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只有单细胞转录组数据的肿瘤类器官研究（肝癌）

医疗 cell 数据图表

我常见系统性梳理过 2014到2018期间的癌症领域的单细胞研究，可以说是少得可怜，都是broad研究所的基于smart-seq的，在脑瘤，黑色素瘤，头颈癌有CNS文章发表。同样的是这个时间段，类器官也是在每个癌症领域都有了CNS文章，比如：

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2024-04-13

750

类器官还得继续卷单细胞（上尿路尿路上皮癌）

数据图表芯片医疗集合

我常见系统性梳理过 2014到2018期间的癌症领域的单细胞研究，可以说是少得可怜，都是broad研究所的基于smart-seq的，在脑瘤，黑色素瘤，头颈癌有CNS文章发表。同样的是这个时间段，类器官也是在每个癌症领域都有了CNS文章，比如：

生信技能树

2024-04-13

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名校博士使用R语言大战医疗蛀虫

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然后就顺藤摸瓜搜索了一下这件事的前因后果，发现经济观察报在2023-12-03 发布的：《名校博士自述：我是怎样查出医院多收我爸10万医疗费的》，讲清楚了名校博士是如何与违法违规套取医保基金、侵害老百姓“救命钱”的医疗蛀虫战斗的。

生信技能树

2023-12-05

2490

PARP抑制剂初步了解

2005年：两篇Nature取得了突破性进展，单独使用PARP抑制剂可以杀死DNA修复缺陷型癌细胞，特别是BRCA1/2突变型癌细胞（BRCA参与DNA修复）；

生信技能树

2018-12-25

1.2K0

“精准医学研究”重点专项阶段性成果大揭秘

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自从2016年科技部公布了国家重点研发计划 “精准医学研究”重点专项，陆续有97（2016年第一批批准61个，2017年第二批批准36个）个项目获得支持。

生信技能树

2018-12-07

1.8K0

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