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生信技能树

专栏作者
1910
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不止是NCBI的SRA可以下载测序数据
最近要开一个肿瘤外显子实战线下课程,想到了以前看到的发在 Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Nov的文章Extremely high genetic diversity in a single tumor points to prevalence of non-Darwinian cell evolution , 研究者对一个肿瘤 hepatocellular carcinoma (HCC) 样品测序超过300个部位,其中23个进行WES测序。但是研究者把数据上传到了GSA (Genome Sequence Archive),如下:
生信技能树
2019-08-22
2.1K0
ngs数据分析结果只占一篇science文章的一张大图的3张子图
保持遗传稳定性的两个关键机制包括DNA损伤修复 (调控基因组稳定性)以及有丝分裂检测点(调控染色体组稳定性)。
生信技能树
2018-12-19
1.2K0
下载文件一定要md5校验一下
因为要使用STAR-fusion软件,其GitHub主页里面提到了配置好的数据库文件,我就想直接下载,如下:
生信技能树
2018-09-21
2.4K0
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