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文章/答案/技术大牛

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Y大宽

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Linux的cut,split,paste,grep,sed和awk命令总结

javascript linux unix grep

这是linux文本操作常用的几个命令，现在进行总结下命令常用用法参数意义/示例常用作用 cut cut -d '分隔符号'-f fileds cut -d ":" -f 3,5 切，纵向切，切列，相当于剪切,取的是某1列或某几列 cut -c 字符范围 cut -c 12- 切割排列整齐的信息 paste paste [-d] file1 file2 -d后面是分隔符，默认[tab]分隔追加列，纵向添加，和cut反向对应 cat file1|paster file2 - -如果是管道命令，fi

2019-06-15

3.3K0

3 wes测序质量的控制

grep ls sh trim 视频

没有原视频中文件，我用了下载的三个文件做例子。乳腺癌的组织样本。所以原视频中命令我也用不上，但是还是列出来

2019-06-03

5250

一堆文件中查找指定文件的N种方法

grep for循环函数

比如我现在有sra转换来的几百个fq文件，现在想找出SRR8708660-SRR8707702之间的样本。

2019-05-23

9770

Linux 正则表达式基本语法详解

grep 正则表达式其他

正则表达式处理文件内容都是字符，非numeric数据字符串匹配的作用。几乎所有语言都支持正则表达式。基础正则grep 扩展正则egrep egrep=grep -E 基本语法

2019-05-22

9660

Linux sed命令详解

sed意为“流编辑器(stream editor)” 字符串筛选工具。对一个文档中的行进行操作和vi编辑很相似。可以查看vim使用命令详解 1 sed基本格式第一种 sed 参数 '脚本语句(

2019-05-22

3.3K0

linux全套教程【黑马】:3 文件查找和内容检索

grep 编程算法

想知道哪个文件里有什么样的字符串，需要找到包含字符串的文件也就是按文件内容查找

2019-05-21

1.6K0

kill命令批量终止后台进程

因为数据量太大，大概一次执行太多了，总共727个样本，.sra文件每个平均大概5个G。一次批量转成200个样本到fq格式，结果内存爆了。所以需要终止进程。

2019-05-21

2.4K0

linux之grep命令

grep 正则表达式

输出文件中包含'Kell'的文件。.为任意字符，所以合计5个字符,其中第五个字符为任意字符。

2019-05-15

5.6K0

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