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文章/答案/技术大牛

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Y大宽

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7 对比对和变异结果用IGV进行可视化

把上述文件下载到本地IGV查看注意，igv同时需要.bam和相应的.bai文件，所以需要把整个文件夹cp。

2019-06-13

1K0

外显子组及全外显子组测序WES

硬件开发数据分析

外显子是蛋白质的编码区域，是这和生物基因组的一部分。基因组中的全部外显子称为外显子组。人类基因组大约有1.8*10^5个外显子，30Mb，占人类基因组的1%。研究表明，人类85%以上的疾病基因都由外显子碱基突变造成。

2019-05-23

2.4K0

TBtools基因家族分析详细教程（1）

数据分析编程算法存储数据库

一共分为4个部分 TBtools基因家族分析详细教程(1) TBtools基因家族分析详细教程(2)基因家族成员的基本分析 TBtools基因家族分析详细教程(3)基因家族成员的进化分析1 TBtools基因家族分析详细教程(3)基因家族成员的进化分析2

2018-10-08

29.9K1

时间序列芯片数据分析极详细完整流程

数据分析 go erp

写在前面：从.CEL格式原始数据下载，到最终关键基因筛选（非hub基因）和初步验证，整个流程，目录还会增加。会涉及R及众多R包（最关键的是maSigpro和WGCNA），统计，ggplot2，cytoscape等。目标还是和前面的RNA-seq流程一样，你可以从头到尾一直重复下去。

2018-09-30

1.3K0

Cytoscape插件3：Enrichment Map(2)

数据分析数据库

所有的微阵列表达数据下载与GEO数据库。Raw.CEL文件用bioconductor的affy包进行RMA。数据集的选择依据以下几个质量控制标准：可靠的并且高覆盖率的微阵列平台（Affymetrix HGU-133 plus 2.0），清晰的实验设计，重复足够数目（细胞系>=3,病人样本>=5）,统一的cell composition，PCA结果和实验设计已知（比如样品可以从不同类进行清晰分类）。在从Affymetrix 向NCBI entrez-gene转换后，执行富集分析，使用的是bioconductor hgu133plus2 package。

2018-09-10

1.5K0

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