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生信了
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生信(十)利用kseq.h和regex.h实现类似grep查找fastq reads功能的示例(C语言)
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做生信的朋友应该都很熟悉类Unix系统中的grep命令,该命令可以快速查找并输出包含目标字符串的行。在对fastq文件进行处理时,我们有时候需要查找包含特定字符串的reads。因为一个reads包含了多行,所以grep命令不能完全适用。那有没有其它命令或者工具可以实现快速简便地实现上述查找特定reads的功能呢?就像grep快速查找行一样。
一只羊
2020-02-18
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