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生信了

专栏作者
117
文章
130479
阅读量
43
订阅数
PaperR-(4)-2022-10
Nature Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids
一只羊
2022-11-30
3730
PaperR-(3)-2022-09
Automated reconstruction of whole-embryo cell lineages by learning from sparse annotations
一只羊
2022-11-30
3370
单细胞组学简介
我们知道生命过程是建立在细胞时空动态调控的基础上的。比如,胚胎发育过程中,随着时间推进,细胞不断分裂、分化、成熟;其过程同时也受到空间信息的调控,比如周边细胞的细胞间通讯。
一只羊
2022-11-30
7760
R记录 - 最近在学习写一个R包
因为课题需要,最近需要实现一个数据可视化的功能。因为ggplot2提供了扩展接口,所以就想着基于ggplot2实现这个功能。看了一些文档之后(见文末),就开始动手实现了。
一只羊
2022-08-30
2080
R语言作图入门——软件安装,数据导入
小仙最近受到了一个打击,之前小仙以为自己写的教程已经比较适合入门了,初学的选手就跟着就能画出图。但是小仙却忽略了一点,粉丝们可能来自不同的行业,拥有不同的专业背景。有些同学可能在特定的情况下接触到了R语言,在下定决心要自己试试的时候,却不知如何入手。
一只羊
2022-04-19
5950
FAQ about PBS
Portable Batch System (or simply PBS) is the name of computer software that performs job scheduling. Its primary task is to allocate computational tasks, i.e., batch jobs, among the available computing resources. It is often used in conjunction with UNIX cluster environments. (fromPBS Wiki page [1])
一只羊
2020-11-05
1.3K0
R语言模拟疫情传播-RVirusBroadcast
前几天微博的一个热搜主题是“计算机仿真程序告诉你为什么现在还没到出门的时候!!!”,该视频用模拟的疫情数据告诉大家“不要随便出门(宅在家)”对战胜疫情很重要,生动形象,广受好评。
一只羊
2020-02-26
7970
R语言模拟疫情传播-gganimate包
前文《R语言模拟疫情传播-RVirusBroadcast》已经介绍了一种用R语言模拟疫情传播的方法,不过当时为了实时模拟数据(没有事先准备好的数据集可用)的动态展示效果,笔者在RVirusBroadcast中使用的是R中的基础作图功能,在本文中我们将用gganimate包来生成动态图。
一只羊
2020-02-26
1.3K0
Python+selenium自动下载xml或exe文件
笔者最近在写一个小工具,需要从pubmed上批量下载包含文献信息的xml文件。很明显,这是一个爬虫任务,笔者选用了python+selenium的组合。代码写好后运行一切都很顺利,直到最后Chrome出现了警告信息,提示我是否要保留文件:
一只羊
2019-12-05
1.8K0
生信(三)(转载)HLA-typing软件
表格来源:https://www.nature.com/articles/jhg2015102/tables/2
一只羊
2019-07-27
7910
使用Python去爬虫
爬虫,简单说就是规模化地采集网页信息,因为网络像一张网,而爬虫做的事就像一只蜘蛛在网上爬,所以爬虫英文名就是spider。
一只羊
2019-07-27
1.5K0
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