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生物信息云

旨在传播生物医学科研实验技能和生物信息学基础知识及应用技巧
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一篇9分的miRNA文章了解一下!
大约70%的多囊卵巢综合征 (PCOS) 妇女存在与体质量相关的高于或超过体质量的内在胰岛素抵抗 (IR),包括脂肪组织 (AT) 的糖代谢功能失调。在AT中,对 IRS/pi3k/AKT 通路信号成分的分析发现,仅 GLUT4 在 PCOS 患者和 IR 对照受试者中的表达显著降低。我们检测了 miRNAs 的作用,特别是在调节 GLUT4(胰岛素敏感葡萄糖转运蛋白)在 PCOS 和匹配对照组的 AT 中的作用。PCOS AT 被确定为有差异表达的 miRNA 谱,包括上调的miR-93、-133 和-223。GLUT4是miR-93的高度预测靶点,而miR-133和miR-223已被证实可调节心肌细胞中GLUT4的表达。miR-93的表达揭示了体内IR稳态模型评估值与人 AT 中 GLUT4和miR-93表达之间的强相关性,而非 miR-133和miR-223表达。过表达miR-93 通过直接靶向GLUT4 39UTR 导致脂肪细胞中GLUT4基因表达下调,同时抑制 miR-93 活性导致GLUT4表达增加。这些结果指出了一种通过miR-93调节胰岛素刺激的葡萄糖摄取的新机制,并证明在所有PCOS和非 PCOS 妇女 IR中miR-93表达上调,可能解释了该综合征的 IR。相反,miR-133 和 miR-223 在 PCOS 的 IR 中可能有不同的作用,尽管尚未明确。
DoubleHelix
2019-12-13
9630
R语言Circlize包绘制和弦图
和弦图可用于表示数据间的关系和流量。外围不同颜色圆环表示数据节点,弧长表示数据量大小。内部不同颜色连接带,表示数据关系流向、数量级和位置信息,连接带颜色还可以表示第三维度信息。首尾宽度一致的连接带表示单向流量(从与连接带颜色相同的外围圆环流出),而首尾宽度不同的连接带表示双向流量。外层加入比例尺,还可以一目了然的发现数据流量所占比例。
DoubleHelix
2019-08-07
12K0
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