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生信修炼手册

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深度学习基本概念｜张量tensor

深度学习编程算法存储数据结构数据分析

深度学习常用于处理图像，文本，语音等数据，在计算机中，需要将这些数据用合适的数据结构来存储。以图像为例，每一幅图像可以看作由像素点构成的二维数组，而每个像素点又可以表示成RGB对应的3元组，经过这样的嵌套之后，每一幅图像实际上变成了一个高阶数组, 图示如下

生信修炼手册

2021-07-06

7930

使用biopython可视化染色体和基因元件

对象存储数据结构数据分析

基因组结构元件的可视化有多种方式，比如IGV等基因组浏览器中以track为单位的展示形式，亦或以circos为代表的圈图形式，比如在细胞器基因组组装中，基因元件常用圈图形式展示，示例如下

生信修炼手册

2021-01-11

9270

使用python collections模块中提供的数据结构

数据结构 python 数据分析

这些基础的数据结构已经能够满足开发中的大多数需求，但是针对某些特殊场景，用基本的数据结构来实现，还是不够简便。为此，python内置了collections模块，在基本数据结构的基础上进行了扩展，提出了以下几种更具针对性的数据结构

生信修炼手册

2020-05-25

4130

KEGGgraph : 根据kgml 文件从pathway中重构出基因互作网络

编程算法 node.js 数据结构

KEGGgraph 包可以解析kgml 文件，从中得到不同对象之间的网络结构，并在此基础上进一步挖掘其中的信息。

生信修炼手册

2020-05-09

1.8K1

miRWalk:综合型的miRNA靶基因数据库

数据库 sql tcp/ip 数据结构

miRWalk是一个综合性的miRNA靶基因数据库，收录了人，小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息，和mirDIP类似，也是一个整合型数据库，整合了来自miRDB, TargetScan, miRTarBase等数据库中的信息，网址如下

生信修炼手册

2020-05-08

9210

如何从PPI网络进一步挖掘信息

数据结构 unity 编程算法

从数据库中得到蛋白质的相互作用信息之后，我们可以构建蛋白质间的相互作用网络，但是这个网络是非常复杂的，节点和连线的个数很多，如果从整体上看，很难挖掘出任何有生物学价值的信息，所以我们需要借助一些算法来深入挖掘。

生信修炼手册

2020-05-08

1.1K0

人生苦短，我用python

python 容器镜像服务容器数据结构

python的火热是大家有目共睹的，在生物信息领域也不例外，近几年新开发的软件中python的出现频率越来越高，学习和掌握python, 是大势所趋。

生信修炼手册

2020-05-07

4800

dbCoRC:核心转录因子数据库

数据结构数据库 sql

在人和小鼠中，已经识别到的转录因子有几百种之多。众所众知，转录因子的调控作用是具有细胞或者组织特异性的，在某种特定的组织或细胞中，发挥调控功能的只是一小部分转录因子。

生信修炼手册

2019-12-19

9080

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