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生信修炼手册

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机器学习专题
随着人工智能的火热,机器学习和深度学习技术再一次进入了大众的视野。python的scikit-learn模块专注于机器学习领域,提供了数据集构建,数据预处理,模型算法,效果评估等各个环节的接口,是入门机器学习的最佳模块。
生信修炼手册
2021-07-06
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spectral-cluster聚类算法详解
spectral clustering,称之为谱聚类算法,和近邻传播AP算法一样,也是基于图论的算法,都是将样本点两两相连,构成图这一数据结构,不同的是,谱聚类是通过切图的方式来划分不同的cluster, 其思想是使得子cluster内部边的权重之和尽可能高,而不同子cluster之间边的权重之和尽可能低。
生信修炼手册
2021-04-14
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Affinity Propagation聚类算法详解
Affinity Propagation简称AP, 称之为近邻传播算法, 是一种基于图论的聚类算法。将所有样本点看做是一个网络中的节点,图示如下
生信修炼手册
2021-04-14
1.8K0
K-means聚类:原理简单的聚类算法
对于监督学习而言,回归和分类是两类基本应用场景;对于非监督学习而言,则是聚类和降维。K-means属于聚类算法的一种,通过迭代将样本分为K个互不重叠的子集。
生信修炼手册
2021-03-25
1.5K0
BIRCH聚类算法详解
Balanced Iterative Reducing and Clustering Using Hierarchies
生信修炼手册
2021-03-24
1.4K0
使用seaborn绘制热图
除了统计图表外,seaborn也可以绘制热图,而且支持聚类树的绘制,绘制热图有以下两个函数
生信修炼手册
2020-10-19
1.6K0
使用Mfuzz进行时间序列表达模式聚类分析
在之前的文章中,我们介绍了STEM软件,针对时间序列的数据,可以进行基因表达模式聚类分析,本文介绍另外一个功能相同的R包Mfuzz。这个R包的地址如下
生信修炼手册
2020-05-08
3.3K0
采用igraph包分析网络数据
对于网络的可视化和数据挖掘,有很多图形界面的软件可供选择,比如cytoscape, gephi 等等,这些软件使用方便,操作简单,功能的强大,但是同时也有着一个缺点,就是无法自动处理,只能通过人工点击鼠标来操作,对于大批量数据的分析而言,依靠人工费事费力。
生信修炼手册
2020-05-08
3.9K0
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