腾讯云
开发者社区
文档
建议反馈
控制台
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
文章/答案/技术大牛
搜索
搜索
关闭
发布
登录/注册
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
返回腾讯云官网
图形化开放式生信分析系统开发
专栏作者
举报
29
文章
28725
阅读量
22
订阅数
订阅专栏
申请加入专栏
全部文章
生物基因
容器镜像服务
sql
大数据可视交互系统
shell
node.js
数据库
python
bash
bash 指令
网站
ssh
pipeline
云服务器
java
c++
go
html
postgresql
ubuntu
windows server
centos
apache
文件存储
腾讯云测试服务
编程算法
自动化
网络安全
单元测试
https
云计算
panel
sample
排序
调试
Deepin
搜索文章
搜索
搜索
关闭
开箱即用版本 满分室间质评之GATK Somatic SNV+Indel+CNV+SV
生物基因
相关代码和workflow文件可以访问笔者github项目地址或这gitee项目地址
SliverWorkspace
2023-10-07
786
0
GATK Germline_SNP_INDEL_2.0 分析遗传病(耳聋)
容器镜像服务
生物基因
大数据可视交互系统
备注:docker运行的操作系统,推荐为Linux,windows,macOS系统改下docker可能部分功能(网络)不能正常运行
SliverWorkspace
2022-12-12
722
0
使用宏基因组的方法快速鉴定新冠病毒SARS-CoV2
容器镜像服务
html
ssh
生物基因
大数据可视交互系统
备注:docker运行的操作系统,推荐为Linux,windows,macOS系统改下docker可能部分功能(网络)不能正常运行
SliverWorkspace
2022-12-07
1.3K
0
新冠病毒分型和突变分析(SARS-CoV2_ARTIC_Nanopore)
容器镜像服务
网络安全
ssh
生物基因
大数据可视交互系统
备注:docker运行的操作系统,推荐为Linux,windows,macOS系统下docker可能部分功能(网络)不能正常运行
SliverWorkspace
2022-11-30
842
0
新冠病毒分型和突变分析(SARS-CoV2_ARTIC_Illumina)
容器镜像服务
生物基因
大数据可视交互系统
备注:docker运行的操作系统,推荐为Linux,windows,macOS系统改下docker可能部分功能(网络)不能正常运行
SliverWorkspace
2022-11-09
1K
0
靶向分析流程(Pipeline)中的数据质控
生物基因
从输出文件${sn}_fastp.json文件中获取过滤前后Q20,Q30比例,总的reads
SliverWorkspace
2022-08-28
615
0
NMPA已注册肿瘤小Panel试剂盒生物信息学内容对比
生物基因
Bwa 0.7 版本和GATK 3.4将fastq文件碱基比对至hg19(GRCh37)人类参考基因组上生成bam文件,并根据基因组坐标对bam文件进行排序,然后对基因组复杂区域进行序列比对优化。
SliverWorkspace
2022-08-13
524
0
基于docker的生信基础环境镜像构建
容器镜像服务
生物基因
这里参考snakemake的写法,每个分析步骤创建一个yaml文件,里面是用到的软件及版本。首次运行检测该步骤环境存在,不存在先安装软件初始化。
SliverWorkspace
2022-08-11
1.3K
0
生信分析整合IGV对结果可视化比对和审核
生物基因
1、编辑和加载参考基因组和需要比对的数据库文件,例子里用到了gnomad和clivar,还有refgene。
SliverWorkspace
2021-09-13
1.2K
0
分析流程设计器校验规则优化
生物基因
分析流程设计器校验规则优化,某些节点任务,作为终止任务不能有子任务,不能作为后续任务的输入节点。
SliverWorkspace
2021-08-31
550
0
使用Gatk Germline spns-indels Pipeline分析遗传病(耳聋)
云计算
生物基因
这是GATK Best Practice系列学习文章中的一篇,本文尝试使用Gatk Germline spns-indels Pipeline来分析遗传病(耳聋) 数据 这次没有拿到遗传病的室间质评的
SliverWorkspace
2020-09-11
1.1K
0
没有更多了
社区活动
腾讯技术创作狂欢月
“码”上创作 21 天,分 10000 元奖品池!
立即发文
Python精品学习库
代码在线跑,知识轻松学
立即查看
博客搬家 | 分享价值百万资源包
自行/邀约他人一键搬运博客,速成社区影响力并领取好礼
立即体验
技术创作特训营·精选知识专栏
往期视频·千货材料·成员作品 最新动态
立即查看
领券
问题归档
专栏文章
快讯文章归档
关键词归档
开发者手册归档
开发者手册 Section 归档