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SMURF流程之q2-sidle（一）
html
php
前面说到Science封面文章用的16S数据分析流程有qiime2的插件版本，可以解决基于matlab MCR standalone版本的报错，于是实践一下！https://github.com/jwdebelius/q2-sidle。conda的安装就不表了，教程挺多的。
用户1075469
2021-03-11
523
0
宏转录组学习笔记（二）
https
html
网络安全
php
继续前面的学习，前面已经把软件安装完成，数据库准备好，下面就是分析的过程了，基本上按照原文的命令进行的，由于教程中没有给出tara_f135_full_megahit.fasta这个文件，这里我们就把这几个样本的组装提到了前面，自己组装获得这个序列，然后再进行物种注释。
用户1075469
2020-03-31
1.3K
0
qiime2-2019.4更新学习笔记
php
q2cli 1.在查看插件的详细信息时清理 –version 输出！ 2.将多个小时的血液、汗水和眼泪投入到清理q2cli体验中，变化包括： 1）--cmd-config 已经被删除了(它没有得到充分的记录，并且增加了很大的复杂性)。我们鼓励需要编程控制的QIIME2用户改用PythonAPI，这要灵活得多。 2）--py-packages从qiime info 中移除了(它已经坏了)，使用conda list代替。 3）--output-dir 和--o选项中，在执行命令之前，请确保路径是可写的。 4）
用户1075469
2020-03-03
849
0
QIIME2-CLI更新学习笔记
python
php
qiime1已经不更新的维护，虽然可以使用，毕竟已经有点过时。学习qiime2还是相当必要的，毕竟它是趋势。但qiime2更新是如此迅速，以至于许多翻译成中文的教程不少命令已然过时了，所以有必要学习一下两个月一更新的qiime究竟在命令上有哪些大的更改。
用户1075469
2020-03-02
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