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文章/答案/技术大牛

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Parsl-Python中的高效并行编程模块

python 编程并发函数教程

之前从qiime2的更新介绍中了解到了这个模块，这里再详细了解一下！哪天用起来呀！

2023-08-26

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脚本分享——对fasta文件中的序列进行排序和重命名

hello，hello！小伙伴们大家下午好，我是小编豆豆，时光飞逝，不知不觉来南京工作已经一年了，从2018年参加工作至今，今年是我工作最快乐的一年，遇到一群志同道合的小伙伴，使我感觉太美好了。

2023-01-11

5.6K1

R语言深度学习知多少

r 语言 python pytorch 开源

深度学习，一直在了解之中啦！不过由于数学基础的问题，始终在门口徘徊，最近发现了一些有趣的内容，分享一下，希望大家都能早日入门！

2022-11-08

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打包你的脚本，做成个有图形界面的程序吧！

https 网络安全 python gui

最近想把一个写的几百行的脚本封装成一个 App，方便使用，于是进行了一番探索，在这里记录一下！

2022-05-25

6290

GWAS流程知多少-Hail

https 网络安全 html python

Hail是一个用于可扩展数据探索和分析的开源库，特别是基因组学，‎为各种规模的基因组分析提供强劲支持，云原生的基因组数据框架和批处理计算‎。Hail需要Python 3和Java 8 JRE[1]， GNU/Linux 还需要 C 和 C++标准库（如果尚未安装）。有关库的高级用法，请参阅概述[2]，有关全基因组关联研究的简单示例，请参阅GWAS 教程[3]，以及安装页面[4]以开始使用 Hail。

2021-12-18

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《写给系统管理员的Python脚本编程指南》笔记

qt 数据库管理编程算法 python json

从南图借的这本书，已经拖了好几个月没有读完了，加紧阅读和学习一下！前面3章的笔记记在了纸上，如果有可能拍照记录一下，后面还是电子记录下，纸质的不方便和保存和查阅，也不方便分享。书的配套代码，来自异步社区：https://box.lenovo.com/l/o5OgDR

2021-11-02

1.8K0

QIIME 2 2021.4发布（qiime2支持galaxy啦）

腾讯云测试服务 python

2、q2-dada2 denoise-paired增加了一个新的参数，使这种方法的用户能够控制最小长度的前进/反向重叠。此方法的的默认值12，和先前版本保持不变。

2021-04-30

8410

qiime2+biom+qiime1获得16S物种丰度

python 容器镜像服务 excel mac sed

我们知道，不管是16S等扩增子测序，还是宏基因组，最后最重要的结果，就是物种的丰度情况了，qiime2给出的16S丰度结果是一个计数，对于许多软件来说这是可用的，那么如果我们想获得一个直接的百分比数据应该怎样做呢？

2020-06-23

1.5K0

生物信息学数据管理习题 Python3

r 语言 github git 开源 python

这是我两三年前学习过的一本书，我觉得这本书挺好，把生物学的问题直接在python学习中解决了，推荐给大家，之前还整理了习题代码，分享一下。之前分享在了github上，收获了10颗星，惭愧，已经是我最多星的一个。还有一两个习题记得没有解答出来，如果你解答出来了，欢迎交流！代码有的肯定不是最优的，只是一种解答方法，可能有错误，也欢迎指正，谢谢！我坚信分享使我们快乐，加油！我是用python3完成的，当然二者区别也很小（目前我基本只认识到了print函数的区别），除非遇上那种多年不遇的bug。

2020-05-18

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qiime2图形界面安装学习笔记

ubuntu linux npm python java

自从知道了qiime2有了图形界面，一直期待自己能安装测试一下，无奈安装了ubuntu和debian两个linux发行版都在npm安装包的过程中报错失败了，看官网的截图是ubuntu的，我却没有成功。于是我总觉得我的黑果应该可以安装成功。因为某果很封闭，软件统一性较高，我是这样觉得的，软件体验应该比较好（PS.我不是果粉，对苹果持中立态度，也坚信开源，所以我在大神的资料下装了黑果，也足够用了）。而各种linux发行版虽然比较自由，也存在着碎片化，虽然debian、ubuntu、cent等已经足够简单易用，并且兼容性不错了，但是linux/gnu生态仍需要加油啊！

2020-03-03

1.2K0

qiime2学习笔记（一）

最近学习肠道微生物方面的知识，有一部分测序数据需要学习分析。鉴于qiime已经升级为qiime2，还有了图形版本，真是越来越人性化了，但是图形版本还处于原型阶段，测试安装两次以失败告终，可能是我的系统是deepin，通用性不好，如果在原生的ubuntu或许可以安装成功。话说qiime2已经在今年1月份代替qiime1成为官方支持版本，qiime1已经停止维护了，我表示对于我这种几乎没有qiime1使用经验的人来说，直接上手qiime2也不错。

2020-03-03

6060

kindle dx当显示器，凑合着用吧

https 网络安全缓存 python

最近对大上科技的电纸书显示器很着迷，想着哪天可以来一台，但是那价格实在是感人，从4000多飙到5000多，文石有款3000多的，索尼大法更是只有信仰才会入手。

2020-03-03

2K0

QIIME2-CLI更新学习笔记

qiime1已经不更新的维护，虽然可以使用，毕竟已经有点过时。学习qiime2还是相当必要的，毕竟它是趋势。但qiime2更新是如此迅速，以至于许多翻译成中文的教程不少命令已然过时了，所以有必要学习一下两个月一更新的qiime究竟在命令上有哪些大的更改。

2020-03-02

4140

Nanopore牛津纳米孔测16S学习笔记

数据分析 python

身处这样一个互联网时代，应当感恩技术带来的便利，从在一个地方不远游就只能是井底之蛙，到今天互联网让我们不出门知天下事，当然，假消息也有。虽然现在许多事和技能仍然需要项目实践，但是不得不说，知识已经不再是一种稀缺的资源，需要时间训练的技能才是。我们应该充分利用好这个时代提供给我们的便利，努力学习和思考。

2020-03-02

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