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小明的数据分析笔记本

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R语言ComplexHeatmap包做热图：热图每隔三行分开一小段

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热图每隔三行分开一小段怎么实现？我最开始的想法是用ggplot2来做，将数据拆分，每三行数据做一个图，最后采取拼图的方式来实现。

2023-01-06

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使用python的streamlit模块搭建一个简易的网页版blast

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https://docs.streamlit.io/library/get-started/create-an-app

2023-01-06

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跟着Nat. Biotechnol.学作图:R语言ComplexHeatmap热图展示TCGA-BRCA数据集概况

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https://www.nature.com/articles/s41587-022-01440-w#data-availability

2023-01-06

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推荐一个非常好用的文件分享神器gofile

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我试了下文件上传速度非常快，可以达到10M，下载速度也非常快，可以达到5M，不用注册，直接就可以使用，或者可以直接用邮箱登录，非常方便。不知道在国内的网络能不能使用，感兴趣的可以测试一下

2023-01-06

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R语言利用转录组基因表达矩阵做基因共表达分析的学习资料推荐

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https://github.com/cxli233/SimpleTidy_GeneCoEx/tree/v1.0.1

2023-01-06

3390

跟着Oncogene学作图：R语言gggenomes画桑基图（共线性图）

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https://www.nature.com/articles/s41388-021-02054-3

2023-01-06

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跟着BioRxiv学作图：R语言ggalluvial包绘制桑基图

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https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.08.29.505745v1

2023-01-06

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生信分析走向临床，科研的难题不应该是不会写代码！

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随着社会经济的迅速发展和科学技术的全面进步，计算机事业的飞速发展，以计算机与通信技术为基础的信息系统正处于蓬勃发展的时期。随着人类基因组计划顺利实施，产生了大量的生物分子数据。只有充分利用这些数据，揭示数据内涵，才能得到对人类有用的信息，生物信息学正是在这种背景下发展起来的。

2023-01-06

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泛基因组文献007~Genome Biology 玉米泛基因组

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https://link.springer.com/article/10.1186/s13059-022-02742-7#availability-of-data-and-materials

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跟着Molecular Plant学作图：R语言circlize包画圈图展示基因组的一些特征

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论文 A telomere-to-telomere gap-free reference genome of watermelon and its mutation library provide

2023-01-06

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推荐很好的R语言ggplot2科研数据可视化参考资料

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https://z3tt.github.io/beyond-bar-and-box-plots/

2023-01-06

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跟着Nature Communications学数据分析：R语言做随机森林模型并对变量重要性排序

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https://www.nature.com/articles/s41467-022-31833-z#data-availability

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跟着Nature Communications学作图：R语言ggplot2做堆积柱形图展示群体基因组学的结果

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https://www.nature.com/articles/s41467-022-34206-8#Sec23

2023-01-06

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跟着Nature Communications学作图：R语言ggplot2散点加误差线展示响应比（Response ratio）

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https://www.nature.com/articles/s41467-020-16881-7#Sec15

2023-01-06

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跟着Nature Biotechnology学作图:R语言pca分析并使用ggplot2可视化结果

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2023-01-06

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跟着NatureCommunications学作图：R语言ggtree根据分组给进化树上色

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https://www.nature.com/articles/s41467-022-29438-7

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跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2画世界地图并用md语法添加文字标签

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跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2热图（heatmap）并添加文字标签

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跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2散点图及添加文字标签

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跟着Nature Plants学数据分析：R语言WGCNA分析完整示例

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https://www.nature.com/articles/s41477-021-00897-y#data-availability

2023-01-06

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