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文章/答案/技术大牛

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芒果先生聊生信

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免疫浸润：生信论文31多肿瘤思路分析

免疫是血液的一部分，也贯穿循环、呼吸、消化、泌尿，内分泌和神经等各大系统，尤其是T淋巴细胞抑制性分子，也是免疫治疗的靶点分子。肿瘤浸润免疫细胞表型，是研究热点，应用广泛，对于理解疾病也帮助很大。

芒果先生聊生信

2020-08-28

1.5K0

免疫浸润：生信论文31 方法写作（oncomine）

对于从数据库获得的处理和呈现，我们还要用语言进行描述，处理过程就是材料和方法（Materials and Methods），呈现就是结果（Results）。如何用地道的语言将其描述出来，也需要我们积累和学习。

芒果先生聊生信

2020-08-28

8010

免疫浸润：材料和方法写作（oncomine）

对于从数据库获得的处理和呈现，我们还要用语言进行描述，处理过程就是材料和方法（Materials and Methods），呈现就是结果（Results）。如何用地道的语言将其描述出来，也需要我们积累和学习。

芒果先生聊生信

2020-08-28

9190

免疫浸润：引文写作分享结束

发表论文是快乐的，因为那是对辛苦付出最好的奖赏。我们对引文写作的介绍和总结到今天就结束了，愿对果友们有帮助。

芒果先生聊生信

2020-08-28

3990

HEK293细胞系，最全总结

培养过细胞的小伙伴们，肯定听过293细胞 (全名HEK293)，但至于293细胞家族的其他衍生细胞却未必熟悉。293细胞的衍生细胞可分为数种，比如293T细胞，293A细胞，293E细胞，293FT细胞等等。有网友总结说，293A是用来包腺病毒的，293T是用来包慢病毒的。总体而言，293细胞容易转染，是实验室最常用的表达兴趣基因的细胞株。

芒果先生聊生信

2020-08-28

5.6K0

免疫浸润：生信论文43肝癌引文写作

引文的基本内容：介绍背景（一段或两段）、提出问题（一段），解决问题（一段或2段）。一般引文介绍3~5段。

芒果先生聊生信

2020-08-24

7110

免疫浸润：生信论文42乳腺癌引文写作

http linux 数据分析数据库

引文的基本内容：介绍背景（一段或两段）、提出问题（一段），解决问题（一段或2段）。一般引文介绍3~5段。

芒果先生聊生信

2020-08-21

5210

免疫浸润：生信论文40乳腺癌引文写作

express linux 数据分析

引文的基本内容：介绍背景（一段或两段）、提出问题（一段），解决问题（一段或2段）。一般引文介绍3~5段。

芒果先生聊生信

2020-08-21

5190

免疫浸润论文：生信论文36、37引文写作

引文的基本内容：介绍背景（一段或两段）、提出问题（一段），解决问题（一段或2段）。一般引文介绍3~5段。

芒果先生聊生信

2020-08-20

3960

免疫浸润论文：如何写好introduction（策略篇）

根据生信论文的套路总结，从oncomine、HPA分析基因的差异表达，km plotter分析差异表达与疾病分析、存活率的相关性，cBioPortal分析基因组学的突变。套路的科学依据是中心法则！我们分享论文的最终目的是掌握生信论文的套路或思路，发表自己的生信论文。

芒果先生聊生信

2020-08-20

4330

免疫浸润论文：生信论文40引文写作

express 数据分析 linux

引文的基本内容：介绍背景（一段或两段）、提出问题（一段），解决问题（一段或2段）。一般引文介绍3~5段。

芒果先生聊生信

2020-08-20

2390

免疫浸润论文：生信论文41引文写作

引文的基本内容：介绍背景（一段或两段）、提出问题（一段），解决问题（一段或2段）。一般引文介绍3~5段。

芒果先生聊生信

2020-08-20

3930

生信分析网站（基因组学分析）

http https 网络安全数据库 sql

根据我们的整理，差异分析是基础，生存分析和相关性分析是表型，免疫浸润分析是对表型的阐释，兼有表型和机制两种作用，但并不是真正意义上的机制探究。通常意义上的机制一般涉及信号通路，是一系列分子的级联反应。

芒果先生聊生信

2020-08-12

2.9K0

生信分析网站（免疫浸润分析）

http 数据库 sql https 网络安全

生存分析是非常常见的表型分析。与生存分析相比，相关性分析是另外一个常见的表型分析。相关性包括表达与病理分期、治疗手段、年龄、种族、吸烟、突变、性别、共表达等因素的相关情况，通常用相关系数R表示，其差异也是用p值判断。

芒果先生聊生信

2020-08-12

6.5K0

生信分析网站（生存分析）

数据库 sql http https 网络安全

差异分析，无论是Oncomine，GEPIA，还是UALCAN、HPA数据库，都不需要R语言编写代码，容易上手，基本上一个星期甚至更短的时间就可以搞定，属于菜鸟级别生信操作。并没有想象中那么难。fold change＞2（起码1.5），p<0.05是差异分析的基本标准。但是表达的差异≠表型的差异，而这两者关系又密不可分。

芒果先生聊生信

2020-08-11

3.7K0

生信分析网站（相关性分析）

数据库 sql http https 网络安全

在差异分析的前提下，表型分析成为重点内容，也是可以玩出花样的地方。生存分析是非常常见的表型分析。与生存分析相比，相关性分析是另外一个常见的表型分析。相关性包括表达与病理分期、治疗手段、年龄、种族、吸烟、突变、性别、共表达等因素的相关情况，通常用相关系数R表示，其差异也是用p值判断。严谨的生信论文还对分析结果做出ROC曲线，以提高数据的可信度和说服力。

芒果先生聊生信

2020-08-11

4.4K0

生信分析网站（欢迎收藏）

数据库 sql r 语言 https http

生信分析，无论是Oncomine，GEPIA，还是KM Plotter数据库，都不需要R语言编写代码，容易上手，基本上一个星期甚至更短的时间就可以搞定，属于菜鸟级别生信操作。并没有想象中那么难。但是简单容易不代表不重要，也不说明水平高低，而是反应了一种思路，这才是最最重要的。p<0.05就是我们前期做分析想要的结果，即使用GEO数据库、TCGA数据库做分析，甚至做芯片或测序，没有差异也是枉然。

芒果先生聊生信

2020-08-10

2.6K0

生信分析44.肿瘤免疫浸润与乳腺癌（TIMER+oncomine)）

第44篇生信论文的分享。已经很久没有做生信论文的分享，类似思路的生信论文我们已经分享过很多次。从侧面反映，肿瘤的免疫浸润分析，仍然是热点，还有发表论文的机会和潜力。

芒果先生聊生信

2020-08-07

1.9K0

肺癌：早期治疗快过感冒？是真的！

根据国家癌症中心最新发布的《2015年中国恶性肿瘤流行情况分析》，肺癌高居恶性肿瘤发病率榜首，在392.9万例新发恶性肿瘤病例中，约有1/5都是肺癌患者（全球发病率为11.6%，死亡率18.4%）。肺癌多发生于40岁以后，高峰发病年龄在70～79岁之间。男性多于女性，在我国男、女性比例为2.13：1。但是，胸外科大咖何建行却表示肺癌并不可怕，关键是要早期发现，做好这些事，治愈早期肺癌甚至快过感冒！（本文综合整理自南山呼吸公众号——钟南山院士团队的科普公众号）

芒果先生聊生信

2020-08-05

6230

肺癌：流行病学和生信病理

根据国家癌症中心最新发布的《2015年中国恶性肿瘤流行情况分析》，肺癌高居恶性肿瘤发病率榜首，在392.9万例新发恶性肿瘤病例中，约有1/5都是肺癌患者（全球发病率为11.6%，死亡率18.4%）。肺癌多发生于40岁以后，高峰发病年龄在70～79岁之间。男性患者多于女性，在我国男、女性比例为2.13：1。

芒果先生聊生信

2020-08-05

6730

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