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【科研热点】趋化因子/受体相关基因
腾讯云开发者社区
今天给大家介绍另外一个研究热点——趋化因子（chemokine）。趋化因子：是一类由细胞分泌的小细胞因子或信号蛋白。由于它们具有诱导附近反应细胞定向趋化的能力，因而命名为趋化细胞因子。
生信交流平台
2022-12-19
279
0
JCR1区，IF 5分+，自引率低，国人友好，无版面费！
今天，我们来分析：Journal of Physiology and Biochemistry
生信交流平台
2022-12-19
205
0
【R】getGEO运行报connection buffer错误
数据库
sql
缓存
最近在运行GEOquery包中的getGEO函数读取series_matrix.txt文件的时候报了如下错误。
生信交流平台
2022-12-19
503
0
如何从TCGA数据库下载DNA甲基化数据
数据库
sql
typescript
前面给大家介绍了新版的TCGA数据库，通过文字和视频给大家讲解了如何从TCGA数据库下载RNAseq数据，miRNAseq数据以及体细胞突变数据
生信交流平台
2022-09-21
3.4K
1
R官方整理的学习小抄—R cheatsheets
r 语言
机器学习
神经网络
深度学习
人工智能
不知道，大家读书的时候有没有做过小抄（cheatsheets）。小编在读书的时候是做过的，当然不是为了带进考场作弊，而是为了整理考点，方便记忆。今天小编要为大家介绍的R cheatsheets就是这样一个很好的方便大家记忆和学习的资料。
生信交流平台
2022-09-21
247
0
RStudio 改名 Posit，为了体现对 Python 和 VS code 社区的支持
python
开源
7月27日，RStudio宣布将RStudio更名为Posit，同时还表示，他们并没有放弃R，而是寻求扩展他们的开源模型。
生信交流平台
2022-09-21
1.2K
0
maftools包分析突变数据，绘制瀑布图
数据库
sql
腾讯云开发者社区
今天我们来讲讲，怎么用R的maftools包来分析MAF格式的突变数据，并用瀑布图来展示结果。maftools这个包的主要分为两部分功能，分析和可视化。下图列出了，这个包中相应的函数的名字。
生信交流平台
2022-09-21
919
0
MAF格式（mutation annotation format）
barcode
bi
format
gd
hugo
Mutation Annotation Format， 简称MAF, 是由TCGA制定的一种文件格式，用来存储突变注释信息。
生信交流平台
2022-09-21
1.3K
0
如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据（somatic mutation）
typescript
数据库
sql
前面给大家介绍了新版的TCGA数据库，通过文字和视频给大家讲解了如何从TCGA数据库下载RNAseq数据和miRNAseq数据
生信交流平台
2022-09-21
940
0
基因突变类型
数据分析
突变是指发生在遗传物质上的变异。广义上突变可以分为两类：染色体变异（chromosome aberration），即染色体数目和结构的改变；基因突变（genemutation），即基因的核苷酸顺序或数目发生改变。狭义突变通常特指基因突变，它包括单个碱基改变所引起的点突变（point mutation），或多个碱基的缺失、重复和插入。
生信交流平台
2022-09-21
1K
0
科研新热点——血管生成相关基因
腾讯云开发者社区
前面小编给大家分享了几个科研中经常用到的基因集，以及如何使用这些基因集进行相关分析。
生信交流平台
2022-09-21
404
0
血管生成的机制
营养物质、氧气、代谢物、化学介质和代谢废物可以通过细胞之间的血管运输，以维持免疫系统、体温和PH值的动态平衡。血管在胚胎发育、身体生长和伤口愈合中起着重要作用。尽管血管有利于组织生长和再生，但它会助长炎症和恶性疾病，并被肿瘤细胞利用来转移和杀死癌症患者。因为血管滋养着身体的几乎每一个器官，偏离正常的血管生长会导致许多疾病。仅举几个例子，血管生长或维持不足可导致中风、心肌梗死、溃疡性疾病和神经退化，以及血管异常生长或重塑导致癌症、炎症性疾病、肺动脉高压和盲眼疾病。
生信交流平台
2022-09-21
666
0
聊个天就把生信分析做了！！！
https
http
python
网络安全
NLP 服务
2020年9月24日看到美国MD安德森癌症研究中心梁晗老师实验室发表在Cencer Cell的Next-generation Analytics for Omics Data的评论文章，介绍了其团队基于自然语言和人工智能开发的组学数据分析平台——DrBioRight。
生信交流平台
2022-09-21
411
0
6分+单基因结合免疫发文思路，你值得拥有！
geo
na
大家好！今天给大家介绍一篇2022年2月发表在Cancer Science（IF:6.518）上的一篇文章。作者对GEO和TCGA数据集进行分析鉴定到CENPF对皮肤黑色素瘤发展和转移具有一定作用。
生信交流平台
2022-09-21
454
0
Rstudio关联本地不同版本的R
go
apply
global
tools
前面提到过Rstudio是一个很好的R集成开发环境，但实际上Rstudio本身是没有太多功能的，它只提供一个可视化的环境，实际上背后还是要调用你本地装的R和R包。那么Rstudio是如何跟本地的R关联起来的呢？
生信交流平台
2022-09-21
1.5K
0
细胞焦亡结合免疫发7分+2区SCI
数据分析
今天给大家介绍一篇2022年4月发表在frontiers in Immunology（7.561）上的一篇文章。作者基于TCGA数据集构建细胞焦亡相关的预后模型，可以准确预测MIBC患者的生存期和免疫治疗反应。
生信交流平台
2022-09-21
519
0
铁死亡相关基因集
数据库
sql
腾讯云开发者社区
铁死亡（Ferroptosis）最早由哥伦比亚大学Dr. Brent R.Stockwell在2012年提出，是一种铁依赖性的，区别于细胞凋亡、细胞坏死、细胞自噬的新型的细胞程序性死亡方式。铁死亡的的本质是谷胱甘肽的耗竭，谷胱甘肽过氧化物酶（GPX4）活性下降，脂质氧化物不能通过GPX4催化的谷胱甘肽还原酶反应代谢，之后二价的铁离子氧化脂质产生活性氧，从而促使铁死亡的发生。
生信交流平台
2022-09-21
569
0
利用转录组数据构建预后模型的8分+发文技巧
javascript
大家好！今天给大家介绍一篇2022年4月发表在eBioMedicine（IF:8.143）上的一篇文章。作者基于LGG患者的转录组数据构建可以准确预测患者预后的模型-APOLLO。
生信交流平台
2022-09-21
692
0
KEGG富集分析一直报错，粉丝拯救了我！
go
r 语言
最近小编在用R的clusterProfiler这个包进行KEGG富集分析的时候，遇到了下面这个错误
生信交流平台
2022-09-21
586
0
刷屏的铜死亡Science文章，还真的“图片重复”了
当时，处于好奇，我用免费的Figcheck图片查重平台查了下，竟然发现Fig.4c中的两图高度相似。
生信交流平台
2022-09-21
416
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