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python比较两个文件的差异

使用python脚本比较两个文件的差异内容并输出到html文档中,可以通过浏览器打开查看。...fromlines和tolines,用于比较的内容,格式为字符串组成的列表 fromdesc和todesc,可选参数,对应的fromlines,tolines的差异化文件的标题,默认为空字符串 context...显示全文,numlines默认为5, 当context为True时,控制展示上下文的行数,当context为false时,控制不同差异的高亮之间移动时“next”的开始位置 3.使用argparse传入两个需要对比的文件...        return text     except IOError as e:         print("Read file Error:", e)         sys.exit() # 比较两个文件并输出到...,使用格式-f1 filename1 -f2 filename     parser = argparse.ArgumentParser(description="传入两个文件参数")     parser.add_argument

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比较两个vcf文件的多种实现方法

有粉丝邮件求助,给了我两个vcf文件,旧的vcf文件走的是标准的bwa+gatk流程,参考基因组是hg19,新的文件参考基因组是hg38,也是gatk标准流程。...想有比较它们,首先得保证两个vcf文件的参考基因组一致,因为版本不一致,所以需要使用CrossMap等软件进行参考基因组版本转换,然后里使用 SnpSift 软件的 Concordance 命令比较它们...image-20200711195600818 最后看专业的软件进行两个vcf文件比较 这里使用 SnpSift 软件的 Concordance 命令,代码如下: java -Xmx1g -jar...但是可以继续细致的探索 comp.results.txt 文件,拆分染色体后,继续统计上面提到的6种情况发生的频次。那就出一个学徒作业吧,比较两个vcf文件,然后区分染色体绘制韦恩图。...这两个vcf文件可以是不同人的,也可以是同一个人的不同批次测序或者不同数据分析流程拿到的vcf文件

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.NET 下最快比较两个文件内容是否相同

最近项目有个需求,需要比较两个任意大小文件的内容是否相同,要求如下: 项目是.NET Core,所以使用C#进行编写比较方法 文件大小任意,所以不能将文件内容全部读入到内存中进行比较(更专业点说,...需要使用非缓存的比较方式) 不依赖第三方库 越快越好 为了选出最优的解决方案,我搭建了一个简单的命令行工程,准备了两个大小为912MB的文件,并且这两个文件内容完全相同.在本文的最后,你可以看到该工程的...下面我们开始尝试各个比较方法,选出最优的解决方案: 比较两个文件是否完全相同,首先想到的是用哈希算法(如MD5,SHA)算出两个文件的哈希值,然后进行比较....而我们的需求中,两个文件都是不固定的,那么每次都要计算两个文件的哈希值,就不太合适了. 所以,哈希比较这个方案被PASS....试验到此,比较两个900多MB的文件耗时1.5秒左右,读者对于该方法是否满意呢? No!我不满意!我相信通过努力,一定会找到更快的方法的!

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.NET CORE下最快比较两个文件内容是否相同的方法

最近项目有个需求,需要比较两个任意大小文件的内容是否相同,要求如下: 项目是.NET CORE,所以使用C#进行编写比较方法 文件大小任意,所以不能将文件内容全部读入到内存中进行比较(更专业点说,需要使用非缓存的比较方式...) 不依赖第三方库 越快越好 为了选出最优的解决方案,我搭建了一个简单的命令行工程,准备了两个大小为912MB的文件,并且这两个文件内容完全相同.在本文的最后,你可以看到该工程的Main方法的代码....下面我们开始尝试各个比较方法,选出最优的解决方案: 比较两个文件是否完全相同,首先想到的是用哈希算法(如MD5,SHA)算出两个文件的哈希值,然后进行比较....而我们的需求中,两个文件都是不固定的,那么每次都要计算两个文件的哈希值,就不太合适了. 所以,哈希比较这个方案被PASS....试验到此,比较两个900多MB的文件耗时1.5秒左右,读者对于该方法是否满意呢? No!我不满意!我相信通过努力,一定会找到更快的方法的!

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如何比较两个JavaScript对象

两个月以前在公众号发过一个图片消息,标题是 How to compare two objects in JavaScript,有一个关注了我的同事第二天告诉我说看不懂。...如何比较? 说了这么多废话,到底如何比较呢?...===大法好 能想到的第一个方法必然是全等比较,如果obj_1 === obj_2这条表达式返回的结果是 true 的话,则说明两个对象的内存地址相同,即:本就是一个对象。...接下来就要凭借着对 Object 对象的了解,手动比较了。 函数比较 在 JavaScript 中,函数也是对象的一种,所以我们先考虑一下,如果要比较的是两个函数该怎么办。...回忆一下你是如何区分两个函数的。 看函数名,看参数,看函数中的语句。如果我们能把函数转换成所有内容组成的字符串,是不是就很直观了?

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linux 文件比较

Creating new file" date > $HOME/testing fi else echo "sorry .you do not have a home directory" fi 第一个检查用-e比较来判断用户是否有...如过有,下一个-e比较会检查并判断testing文件是否存在与$home目录中。如果不存在,shell脚本会用单个大于号(输出重定向符号)来用date命令的输出创建一个新文件。...第二次运行这个shell脚本时,他会使用双大于号,这样他就能将date的输出追加到已经存在的文件后面。 '>'表示如果文件不存在 则创建文件,如果文件存在 则清空文件并输出。'...>>'表示 如果文件存在 则追加输出到文件后。 检查文件 -e比较适用于文件和目录。要确定指定的对象是个文件,必须用-f比较: #!...-r比较判断出我没有这个文件的读权限,所以test 命令失败了,而且bash shell 执行了if-then语句的else部分。 检查空文件 #!

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使用Rsync同步备份两个web服务器文件

同步Web服务器的优势 使用rsync创建Web服务器备份的主要优点如下: Rsync仅同步那些已更改的字节和数据块。 Rsync能够检查和删除备份服务器上已从主Web服务器中删除的那些文件和目录。...如何同步两个Web服务器 设置rsync以创建Web服务器的镜像。我将使用两台服务器。...我用过了 /var/www 转移;你可以根据需要更改文件夹位置。 第 4 步:使用SSH无密码登录自动同步 已经完成了 rsync 设置,现在是时候设置一个cron对于 rsync。...要设置 cron,请使用以下命令打开 crontab 文件。 [root@backup ~]# crontab –e 它将打开 /etc/crontab 文件以使用你的默认编辑器进行编辑。...相关文章 linux之rsync远程同步文件 linux中rsync命令的10个实际示例

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