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一文解决线图(nomogram)

优势 线图将复杂的回归方程,转变为了简单且可视化的图形,使预测模型的结果更具有可读性,具有更高的使用价值。而这种优点使得线图在医学研究和临床实践中得到了更多的关注和应用。...线图的效果评价 在绘制线图后也需要对模型的预测能力进行评价。常用的效果评价方式有: 内部验证法 可采用Bootstrap自抽样法,利用建模自身的数据来验证模型的预测效果。...利用Bootstrap自抽样产生的新样本去评价线图模型的准确性,常用C-统计量来进行衡量,其值越接近于1说明线图的预测能力越准确。...理论上标准曲线是一条通过坐标轴原点、且斜率为1的直线,如果预测校准曲线越贴近标准曲线,则说明线图的预测能力越好。...外部验证法 使用一组研究对象去建立线图,再使用另外一组研究对象(即外部数据)来验证线图预测效果的准确性。

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基于R的竞争风险模型的线图

如何绘制竞争风险模型的线图?在这里,我们演示如何绘制基于R的线图。...主要原因是,如果哑变量出现在线图中,结果将难以解释清楚。 因此,应避免在线图中使用哑变量。 regplot包中的regplot()函数可以绘制更多美观的线图。...在线图中,将数据集中id = 31的患者的协变量值映射到相应的分数,并计算总分数,同时分别计算36个月和60个月的累积复发概率,即控制竞争风险的累积复发概率。...小结 本文详细描述了使用mstate和regplot 包来绘制竞争风险模型的线图。...实际上,这是一种灵活的方法,即首先对原始数据集进行加权处理,然后使用Cox回归模型基于加权数据集构建竞争风险模型,然后绘制线图。本文并未介绍对竞争风险模型的进一步评估。

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手把手教你绘制最基础的线图

在之前的文章中,我们介绍了线图的含义和构建方法,本文重点介绍下绘制线图的代码,经典的线图如下所示 当我们构建好一个预后模型之后,可以通过线图来可视化其公式,最常用的绘图方法是通过rms这个R包...time,status) ~ age + sex, data = pbc, dist='lognormal') > nom <- nomogram(f) > plot(nom) 效果图如下 和文献中的线图相比...对于生存模型,我们希望通过该模型预测患者的生存时间和生存概率,基础的线图显然并没有这样的信息,为此,我们需要自己写函数来添加我们想要的轴,用法如下 > f <- psm(Surv(time,status...c(0.6, 0.8, 0.9, 0.95)), + lp = F) > plot(nom) 效果图如下 综合使用以上3种方案,就可以得到一个文字标签不会重叠的线图

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Fine-Gray检验、竞争风险模型、线图绘制

本文目录: 加载数据和R包 Fine-Gray检验(单因素分析) 图形展示结果 ggplot2 竞争风险模型(多因素分析) 线图 参考资料 加载数据和R包 探讨骨髓移植和血液移植治疗白血病的疗效,结局事件定义为复发...线图 regplot包绘制线图。但是它目前只适用coxph()、lm()和glm()返回的对象。...因此我们需要对原数据集加权创建一个新数据集用于为竞争风险模型分析,使用mstate包中的crprep()创建加权数据集,然后使用coxph()对加权数据集进行竞争风险模型拟合,这样就可以画线图了。..."casebase") # 还是这个数据 library(mstate) # 加权用到的R包 bmtcrr$id <- 1:nrow(bmtcrr) # 创建id # phase变为2分类,不然线图不好解释...其实你可以绘制多种不同的线图,可以参考之前的推文:生存资料线图的4种绘制方法 library(regplot) regplot(m.crr, observation=df.w2[df.w2

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文献阅读|Nomograms线图在肿瘤中的应用

线图,也叫诺莫图,在肿瘤研究的文章中随处可见,只要是涉及预后建模的文章,展示模型效果除了ROC曲线,也就是线图了。...线图的定义 线图是肿瘤预后评估的常用工具,在医学和肿瘤相关的期刊杂志上随处可见。典型的做法是首先筛选患者的生物学特征和临床指标构建一个预后模型,然后用线图对该模型进行可视化。...所以线图是预后模型的可视化形式,是回归公式的可视化,一个典型的线图如下所示 在线图中,对于模型中的每一个自变量,不论是离散型还是连续型变量,都会给出一个表征该变量取值范围的坐标轴,在最上方有一个用于表征变量作用大小的轴...线图的限制 预后模型可以用于辅助决策,但也存在一定的局限性,比如 1)线图认为生存结局随着时间线性变化 2)线图的性能没有统一的接受标准 3)线图对临床决策的帮助和对患者满意度的提高的作用不清楚...只有这样,线图才能更好的应用于临床。 ·end·

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限制性立方样条(RCS)的线图怎么画?

关于临床预测模型的基础知识,小编之前已经写过非常详细的教程,包括了临床预测模型的定义、常用评价方法、线图、ROC曲线、IDI、NRI、校准曲线、决策曲线等。.... ---- 之前关于线图写了3篇推文,详细介绍了二分类资料和生存资料的线图绘制: Cox回归线图(nomogram)的4种绘制方法 Logistic回归线图的4种绘制方法 线图的本质 今天的这篇推文来自群友提问...,RCS(限制性立方样条)的线图怎么画?...下面分别演示logistic和COX的RCS的线图绘制。...Cox回归线图(nomogram)的4种绘制方法 Logistic回归线图的4种绘制方法 线图的本质 一文搞懂临床预测模型的评价!

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手把手掌握临床研究的必备绘图技能:线图

点击蓝字关注我们 今天我们学习一下临床研究中常见的图的绘制-线图。...正是由于线图这种直观便于理解的特点,使它在医学研究和临床实践中也逐渐得到了越来越多的关注和应用。 今天我们的主题便是如何借助R实现基于cox模型的线图的绘制。 欲画该图,必备该包rms 1....这个example数据包含一个示例数据,如下,该数据集包括300个病人样本,6数据,前两是病人存活时间和存活状态,后面四是年龄、性别、stage和血小板数四个指标,接下来的线图模型主要是从四个因素进行列线图绘制...绘制线图 ? #此处maxscale=100定义了单项分数刻度为100分,也可以设置10分;fun.at是要显示的横坐标轴,可以不设置,但可能出现数字重叠的情况。 6. 画出列线图: ? ?...Ok,至此我们的线图结束,我们继续推出列线图美化系列,今天就和大家分享到这。

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14-lncRNA signature构建线图预测胃癌患者预后发3分+

本文构建了包含lncRNA特征和临床因素的线图,以预测原发性胃癌患者的OS,结果表明,风险特征和线图均是GC患者的有效预后指标。...因此,作者旨在开发基于lncRNA的风险特征图和线图,以预测GC患者的总生存期(OS)。...这些结果表明,风险特征和线图均是GC患者的有效预后指标。 02 流程图 ? 03 结果简述 1....校准曲线表明,在所有三个队列中,线图在预测和实际操作系统之间具有较高的一致性,如下图B所示。在训练队列中,一年,三年和五年OS的线图的AUC-ROC分析分别为0.660、0.731和0.692。...内部验证队列中1年,3年和5年OS的线图的AUC-ROC为0.651、0.772和0.772。

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PBI-基础入门:添加与新建(计算

小勤:在Power BI里怎么增加一? 大海:在Power BI里增加列有2种方法,一种是咱们在学Power Query里的“添加”方法,还有一种是在PowerPivot里的新建“计算”方法。...具体操作方法如下: 在查询编辑中添加: 直接在Power BI Desktop界面中新建: 小勤:啊。Power BI真是两这个的完全组合啊。这两者之间有什么不同吗?...但在构造的时候是有以下差别的: 查询编辑器里添加用的是Power Query的知识,一般情况下,Power Query在这方面的功能比较强一些,尤其是做文本的相关处理时。...但是,新建计算的方法有个好处,是可以直接引用计算度量的相关结果,这一点是用PQ添加方法做不到的。 小勤:那该怎么决定到底用哪一种方法呢? 大海:我很少纠结这个问题,反正觉得哪个用起来方便就用哪个。...总的来说,我一般是除非要引用某些计算度量的结果或者是一些非常简单的计算,绝大部分的时候我都是用PQ进行处理的。 小勤:嗯。我大概知道了。

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怎样能自动按01 02 最大为99,来设置标题?

一、前言 前几天在Python最强王者交流群有个粉丝咨询了这个问题:获取到数据表的数比较简单,一般不超过99,怎样能自动按01 02 最大为99,来设置标题?...二、实现过程 针对这个问题,【群除我佬】给了一个代码,如下所示: ["0" + str(i) if len(str(i)) < 2 else "" + str(i) for i in range(1,100...)] 后来【~上善居士~ 郭百川】使用字符串格式化,也给了一个代码,如下所示: [f"{i:02d}" for i in range(1,100)] 后来【Eric】也给了一个可行的代码,如下所示...: columns = [] for i in range(10): columns.append(f"{i:02d}") print(columns) df.columns = ['00',...(str(i)) < 2 else "" + str(i) for i in range(1,df. shape[1]+1)] [f"{i:02d}" for i in range(1,df.shape

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