pwd=cnxr 提取码：cnxr 使用方法：下载代码包，修改“shiny.R”中的工作路径，正常就可以直接运行了。...output$variable_x <- renderUI({ selectInput("variableNames_x", label = "Variable_X", choices =...names(dataset())) }) output$variable_y <- renderUI({ selectInput("variableNames_y", label =...output$hist_variable_x <- renderUI({ selectInput("hist_variableNames_x", label = "Variable_X",...choices = names(dataset())) }) output$hist_variable_z <- renderUI({ selectInput("hist_variableNames_z
本次展示shiny的功能有： 1、读取本地数据； 2、交互展示数据（view） 3、动态交互作图（自动读取上传数据的列名） 体验网址：https://yanshenli.shinyapps.io...("variable_x"), uiOutput("variable_y")),...({ selectInput("variableNames_x", label = "Variable_X", choices = names(data())) }) output$...variable_y <- renderUI({ selectInput("variableNames_y", label = "Variable_Y", choices = names(data...来展示server计算返回的结果（图片、表格等）
be added to an input form numericInput A field to enter numbers radioButtons A set of radio buttons selectInput..."Choice 3" = 3),selected = 1)), column(3,#选择窗口 selectInput...image plotOutput plot tableOutput table textOutput text uiOutput raw HTML verbatimTextOutput text 输出函数需要放在...helpText("Create demographic maps with information from the 2010 US Census."), selectInput...printed output renderTable data frame, matrix, other table like structures renderText character strings renderUI
引言当我们想获得一个gse的matrix文件和补充文件, 一般情况下可以直接用网页下载, 用 R 的话也可以使用 getGEO(gse) 和 getGEOSuppFiles(gse)函数 , 但是如果在服务器或者网络非常不好的情况下..., 就必须依赖可以断点续传而又网速稳定的ftp链接, 那么如何方便的获得这些链接呢?...:图片基于此, 有大佬设计了基于文本替换和网页元素爬取的ftp链接获取代码, 我又稍加修改, 加入了GPL的注释信息链接获取....gseAcc, b[x] ) } merge <- c(unlist(ret)) print(merge) return(merge)}# 获取GSE166424的补充文件和...return(fnames) } # Determine file type options based on input type output$fileType <- renderUI
可以看到界面主要分成四个区域，分别完成上传，预览，设置作图参数和绘图的功能（绘图区是隐藏的，等按下 Plot 按钮后会显示）。 ? 若不上传数据，则默认使用示例数据作图。...点击 Plot 按钮即可出图，点击按钮后，右侧会出现绘图区域，每张图都为大家准备了下载 PDF 和 PNG 的按钮。 默认情况下绘图区会出现两张图。...下面给大家简单讲讲我的设计思路。 设计思路 网页界面（ui.R） 因为这个网站的主要目的是作图，那么其实不难想到我们大概要分成四个板块，分别完成上传，预览数据，设置作图参数和绘图的功能。 ?...，包括： •X 轴字体大小•Y 轴名称•Y 轴字体大小•第二张图的配色方案，这里用了 RColorBrewer 中的 qual 色板•输出图片的长宽•第三张图的自定义配色方案（使用了 uiOutput(...UI，这里也用到了一个批量生成 UI 元素的技巧，根据所需颜色的数量来自动生成相应数量的取色板： output$colourpickers <- renderUI({ if(input$
#安装Shiny程序包 install.packages("shiny") 2.学习目录 P-1:初步认识shiny app的结构 一个文件夹，加上包含Shiny命令的app.R文件，再加上用到的数据文件和...其中ui定义网页中对象的展示方式，包括文字的字体，字号，颜色，排列方式，以及各种组件的默认参数，可以选择的参数等。 server：计算。server函数读取组件中收集到的数据，计算后，再传递给UI。...shinyApp ：对函数的调用（运行）。shinyApp(ui, server)分别调用ui和server函数，生成网页。...() uiOutput() # ui <- fluidPage( # uiOutput("moreControls") # ) # # server <- function(input, output...) { # output$moreControls <- renderUI({ # tagList( # sliderInput("n", "N", 1, 1000, 500),
一些 Logstash 实现可能具有多行代码，并且可能处理来自多个输入源的事件。 为了使此类实现更具可维护性，我将展示如何通过从模块化组件创建管道来提高代码的可重用性。...写这篇文章的动机 Logstash 通常有必要将通用的处理逻辑子集应用于来自多个输入源的事件。...通常通过以下两种方式之一来实现： 在单个管道中处理来自多个不同输入源的事件，以便可以将通用逻辑轻松应用于来自所有源的所有事件。在这样的实现中，除了通用逻辑之外，通常还有大量的条件逻辑。...1.png 执行一个唯一的管道来处理来自每个唯一输入源的事件。这种方法需要将通用功能复制和复制到每个管道中，这使得难以维护代码的通用部分。...结论 使用全局表达式可以使 Logstash 管道由模块化组件组成，这些组件存储为单独的文件。 这样可以提高代码的可维护性，可重用性和可读性。
嵌入表格和图表 这也是rmarkdown吸引人的地方，通过R代码直接输出表格和图！这有赖于益辉大神写的knitr包。...下面说说如何嵌入图。 一般的图非常简单，和平常写R代码一样，不过不在.R中写，而是在.Rmd中写，将你的代码写入如下的代码框中，使用Control+Alt+i可以直接插入一个代码框。...grViz(" digraph rmarkdown { A -> B B -> C C -> A }") 这个包使用Graphviz描述图的结构和样式...下面我们看一个复杂有用的例子：可视化几何布朗运动的许多路径，几何布朗运动常用于股票价格建模，运动的结果取决于初始值、预期增长率、波动率、持续时间和周期数。..." #> [7] "passwordInput" "restoreInput" #> [9] "selectInput
那么，在数据分析进入下游之后，如何给自己的研究增加更多可交付的内容呢？Shiny会是一个不错的选择。 ?...你可以在网页上托管独立的应用程序，或者将它们嵌入R Markdown文档或构建仪表盘。您还可以使用CSS主题、htmlwidgets和JavaScript动作来扩展您的应用程序。...image 根据自己的喜好，我选择的是Multiple File（ui.R/server.R），主要是给人一种前端和后端分开的感觉，其实app.R也是一样的通过两个函数来分别控制，我起的名字是seuratreport...所以我们也来看看如何把我们的SeuratReport部署到“云上”。...image 基本上和Windows上面安装软件一样，只要一步一步 next就好了。注册好之后： ? image 其实这很像一个微信公众号的后台，有用户的基本设置，还可以我们的程序的应用情况： ?
首先看你需要的数据是哪几类，把网址里的文件名放在一个列表里。...这里数据文件名和含义的对应关系是： gene expression RNAseq(HTSeq)--htseq_counts survival--survival phenotype--GDC_phenotype...#titlePanel("TCGA下载地址获取工具"), fluidPage( titlePanel("TCGA下载地址获取工具"), sidebarPanel( selectInput...Cancer" = "THCA", "Uterine Carcinosarcoma" = "UCS" )), selectInput...various variables against mpg shinyServer( function(input, output, session) { output$mySite <- renderUI
image.png 当然最常用的是reactive() 还有其他两种类型的reactive函数： 由 reactiveVal() 创建的单个响应式值。...什么时候会用到 reactive 以下是一个简单的 Shiny 应用程序，演示了如何使用 reactive() 函数。该应用程序根据用户输入的两个数字，计算它们的和并显示结果。...最后，renderUI() 函数会根据项目列表，生成一个项目列表的 UI 输出。由于响应式变量的值可以在任何时候更新，因此使用 reactiveVal() 函数更为方便。...shiny") library(DT) data <- as.data.frame(ggplot2::diamonds) data$comment <- NA ui <- fluidPage( selectInput...imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/2/w/1200/format/webp 当然大家可能会遇到错误Error ： 这里具体问题，具体对待，后续会更新，如何解决这些问题
前言 Render props作为共享组件逻辑的一种有效模式，此模式借助state和辅助参数，可以提供ui的更好的灵活性。...() } 优化renderUI为纯函数 不依赖于组件，参数全部依赖传入 const renderUI = ({on, toggle}) => <Switch on={on} onClick={toggle...} 移出外部使用仍然是可以的 // 组件外 const renderUI = ({on, toggle}) => // 组件...static defaultProps = {renderUI} render(){ return this.props.renderUI({ on:this.state.on,...你也可以通过children的方式来自定义使用render的部分。
selectInput() 是让用户可以选择的输入控件。...verbatimTextOutput() 和 tableOutput() 是告诉 Shiny 对输出进行渲染的控件，前者展示代码，后者展示表格。...包 library(shiny) ui = fluidPage( ## UI 控件一般使用 ## xxInput：用于用户输入 ## 或 ## xxOutput：用于结果展示 selectInput..."table") ) server = function(input, output, session) { ## input 指代输入命名空间 ## 如 input$dataset 指代来自用户输入...行为一般使用 ## renderXXX 告诉服务器如何输出结果 ## output$ID <- renderTYPE({ ## # 生成输出的表达式 ## }) output
我们假定大家对对 Shiny (web apps) 和 plotly (interactive plot) 有一个基本的了解，下面我们只需要通过简单的复制粘贴就可以构建一个功能完备的 app。...date：开始和结束日期。 输出。 covid19plot：显示交互式图形的 plotly 输出。...下面的代码片段显示了如何呈现交互式绘图 ，当任何输入发生更改时，交互式绘图会自动更新。...注意，因为 covid19() 函数使用了内部的缓存系统（memory caching system），因此数据不会被下载两次。多次调用这个函数是非常高效和用户友好的。...： 简单总结 我们构建了一个简单的应用程序，将 Shiny 与 COVID19 的 R 包连接起来，呈现了一个可重用的通用体系结构。
(注水)，server 输出(response)后浏览器端可以得到数据(脱水)，浏览器开始进行渲染和节点对比，然后执行组件的 componentDidMount 完成组件内事件绑定和一些交互，浏览器重用了服务端输出的...同构才是核心 react ssr 的核心就是同构，没有同构的 ssr 是没有意义的。 所谓同构就是采用一套代码，构建双端（server 和 client）逻辑，最大限度的重用代码，不用维护两套代码。...文章走到这里，相信你已经知道了路由同构，所以上面的第一个问题 ：【双端路由如何维护？】 解决了。 数据同构（预取同构） 这里开始解决我们最开始发现的第二个问题 - 【获取数据的方法和逻辑写在哪里？】...SPA模式下大部分都会实现组件分包和按需加载，防止所有代码打包在一个文件过大影响页面的加载和渲染，影响用户体验。 那么基于 SSR 的组件按需加载如何实现呢？.../xx.js'),当然实现的效果和 require.ensure是相同的。 咱们这里只说如何借助这个规范实现按需加载的路由，关于动态导入的实现原理先按下不表。
这些属性定义widget公开的状态和API。然后根据不同职责实现initializer、destructor、renderUI、bindUI、syncUI方法，以及属性状态修改的处理函数和API。...插件和扩展 除了可以基于任意Widget类创建子类，实现自定义widget外，YUI3还提供两个代码重用机制。...这两个机制可以用来打包可重用的widget功能的代码，不需要将这些功能绑定到一个静态的类层级中。...这两个代码重用机制就是插件（plugins）和扩展（extensions），可以从Base类获得这两种机制的支持。...，但是这些功能是按照“便于在其他的类中重用”的方式来实现的。
如下是两个小控件，分别用来展示 variable to display和Range of interest，此时选中是没有响应式输出。...."), selectInput("var", label = "Choose a variable to display",...在ui中设置Shiny在哪里显示对象后，接下来，需要告诉Shiny如何构建对象。为此，需要在server函数中构建对象。server会建立一个output的list，其中包含更新R对象的代码。...server函数包含2个参数，input和output，output作为一个类似列表的对象，存储了在应用程序中构建R对象。input是也是一个类似列表的对象。它存储控件的当前值。...这些值来自ui中小控件的名称。
在这里，和国际同行一起学习单细胞数据分析。 数据可视化是数据分析中关键的一步，相比于静态绘图，交互（界面）图可以给我们更多的调节空间。...思考：如何查一个R包中哪些函数有某一参数？ 先载入R包和数据，并执行简单的降维。...那我们肯定想知道它是如何实现的了，我们选择用debug的方式来查看原函数： debug(FeaturePlot) FeaturePlot(anterior1,feature= "Cd4",interactive...风格很Seurat，有详细的教程和贴心的FAQ。 地址：https://satijalab.org/azimuth/ ? 教程区： ?...界面版和命令行版针对的是不同条件的选择，看自己的实验室的编程条件和人员背景来选择。但是做单细胞数据分析迟早都要会R语言。
目标：通过数据的股票代码获取中国股票信息 这个项目以利用shiny获取和展示股票信息为目标。...symbol=sh600000&end_date=20121231&begin_date=20111231") 5 raw 6 do.call(rbind, xmlToList(raw)) 但是来自新浪的数据格式并不规范...，我们需要花大量的时间去清洗和整理。...inputId = "stock4", label = "股票4"), 10 textInput(inputId = "stock5", label = "股票5")), 11 selectInput...以前我常常提出这样的问题，怎么样才能为我整理好的数据建立一个规范的端口，然后让用户在各个方向上灵活地分析。Shiny和R恰好是一个好的解决方法，但是我依然需要找到一个将shiny应用于用户的便捷方法。
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