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主动推理的控制流:生物如何调控自身的资源

在这些条件下⽣存 需要⼀个控制系统,该系统可以以特定于上下⽂的⽅式激活或部署可⽤的感知和⾏动资源。...这样的系统,甚⾄细菌和其他基础 ⽣物体[20]-[23],都有多种⽅式观察和作⽤于其环境,并以上下⽂敏感的 ⽅式部署这些资源。...例如,在⼤肠杆菌等细菌中,不同代谢操纵⼦的基因调控⽹络(GRNs gene regulatory networks (GRNs)之间的相互抑制仅在检测到⽬标碳源时才允许特定碳源(例如糖)代谢途径的表达。...它还描述了背侧和腹侧 注意系统之间的竞争性相互作⽤,分别实现⾃上⽽下和⾃下⽽上的感觉 资源⽬标[38]。...将测量结果记 录到经典存储中以及从存储中读取先前记录的结果可以类似地由于 dom(Y ) 是 B 上的⼀个扇区,所以可以⽤ QRF Y 来表⽰ A 的记录存储 暴露于其中并因此受到修改由B,反之亦然

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【Mol Cell】解析顺式调控密码(五):从调控连接到调控环境

调控连接到调控环境 到目前为止,我们的关注点在于单个的增强子-启动子关系,但在基因组中,许多基因有多个同时活跃的增强子和附近的启动子,它们可以彼此合作或竞争。...上位性被定义为偏离独立性的零期望,即,扰动一个增强子应该具有相同的效果,无论是是否存在其他顺式调控元素。...展望 解读顺式调控代码是一项巨大的挑战。与遗传代码不同,遗传代码具有满意的、通用的、模块化的、确定的解决方案,而顺式调控代码是具有特定上下文的、复杂的、组合的,且充满了冗余和定量效应。...它包括几个相互依赖的层次,从转录因子结合DNA开始,到转录因子在顺式调控元素上与其他因子和辅助因子的相互作用,到复杂的调控领域和景观。...我们可以在报告者分析中测试数十到数百万个顺式调控元素或转录调控。即使是一些参与转录的最大的蛋白质复合体现在也可以被结构解析,从而提供无与伦比的机制洞察。

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YARN资源调度

这种作业要求有一定量的资源保证,如统计值计算、垃圾数据分析等 ---- 基本架构 资源调度是YARN中最核心的组件之一,且是插拔式的,它定义了一整套接口规范以便用户可按照需要实现自己的调度 YARN...自带FIFO、Capacity Scheduler和Fair Scheduler三种常用资源调度,当然,用户可按照接口规范编写一个新的资源调度,并通过简单的配置使它运行起来 YARN的资源管理实际上是一个事件处理...通常而言,资源管理需要为每个Application维护一个独立的数据结构,以便于统一管理和资源分配。...中的资源调度资源分配给各个ApplicationMaster 第二层中,ApplicationMaster再进一步将资源分配给它的内部任务 YARN的资源分配过程是异步的,也就是说,资源调度资源分配给一个应用程序后...资源管理和调度均由调度完成,管理员可在调度中设置每个队列的资源容量,每个用户资源量等信息,而调度则按照这些资源约束对应用程序进行调度 参考:《Hadoop 技术内幕:深入解析 YARN 架构设计与实现原理

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Yarn资源调度

一、Yarn资源调度 Yarn是一个资源调度平台,负责为运算程序提供服务运算资源,相当于一个分布式的操作系统平台,而MapReduce等运算程序则相当于运行于操作系统之上的应用程序。...Apache Hadoop3.1.3默认的资源调度是Capacity Scheduler。 CDH框架默认调度是Fair Scheduler。...公平调度—缺额 公平调度设计目标是:在时间尺度上,所有作业获得公平的资源。某一时刻一个作业应获资源和实际获取资源的差距叫“缺额”。...调度会优先为缺额大的作业分配资源 3.22 资源分配方式 有3种资源分配方式:FIFO策略、 Fair 策略、 DRF策略。...(1)、FIFO策略 公平调度每个队列资源分配策略如果选择FIFO的话,此时公平调度相当于上面讲过的容量调度

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PWM调控模式细谈

通过高分辨率计数的使用,方波的占空比被调制用来对一个具体模拟信号的电平进行编码。PWM信号仍然是数字的,因为在给定的任何时刻,满幅值的直流供电要么完全有(ON),要么完全无(OFF)。...振荡输出的锯齿波和参考值 进行比较,然后就可以输出PWM波形了; 50%的占空比 1.锯齿波(图中橙色波形)最大为10,然后我希望输出平均为5的波形(图1中红色的水平直线); 2.那么通过比较,当锯齿波小于...它必须直接或间接地得到转子磁链在空间上的位置才能实现定子电流解耦控制,在这种矢量控制系统中需要配置转子位置或速度传感。这也就是为什么有那么多传感知道位置的原因。

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基因表达调控概述

这些都是由于基因表达调控的差别。 一棵植物有一粒种子开始,开始发芽生长,开花结果,整个生命过程发生了重大的变化,这些也是以为基因表达调控的不同。...目前基因表达和调控已经是两个方向研究的,基因表达主要研究 mRNA 表达的差异,而调控则更加复杂,研究影响 mRNA表达差异的各种其他因素。...二、基因表达调控发展历史 其实在很早之前,研究人员就开始研究基因表达调控了。只不过受限于当时技术条件,无法完整的获取一次转录的全景图。下面我们简单介绍一些基因表达调控的历史。...三、为什么要做基因表达调控研究? 要想了解为什么要研究基因表达调控研究,首先要了解 DNA 研究与 RNA 研究的不同。...大家互动交流可以前去论坛,地址在下面,复制去浏览即可访问,弥补下公众号没有留言功能的缺憾。 bioinfoer.com 有些板块也可以预设为大家日常趣事的分享等,欢迎大家来提建议。

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资源服务被黑排查

一.简介 环境: 资源服务是Nginx和php组成的服务,用户可以http://192.168.1.100/one.jpg方式获取图片。...只有负载均衡服务才有外网地址,并且防火墙只允许80端口访问。 起因: 早上10点半,在查看资源服务的文件目录时,发现多了一个pc.php,问了一圈发现没人知道这个文件。...2.查看2台资源服务的日志,查看负载均衡的也行。...可以发现POST提交了脚本,GET去获取脚本,因为资源服务是安装了php的,访问pc.php,nginx会默认交给php-fpm去执行脚本,从而触发脚本,就像访问https://www.baidu.com...三.解决办法 这次只到资源服务也是因为大体策略做的没问题,对方顶多是传个脚本而没法做更多操作,本次问题很清晰是程序没有做上传限制导致的,禁用post传送文件即可,也可以在nginx上配置禁止执行php

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BigData--Yarn资源调度

Yarn资源调度 YARN主要由ResourceManager、NodeManager、ApplicationMaster和Container等组件构成 1、YARN架构 ?...4、资源调度 Hadoop作业调度主要有三种:FIFO、Capacity Scheduler和Fair Scheduler。 1)先进先出调度(FIFO) ?...2)容量调度(Capacity Scheduler) ? 1、支持多个队列,每个队列可配置一定的资源量,每个队列采用FIFO调度策略。...2、为了防止同一个用户的作业独占队列中的资源,该调度会对同一用户提交的作业所占资源量进行限定。...3)公平调度(Fair Scheduler) ? 支持多队列多用户,每个队列中的资源量可以配置,同一队列中的作业公平共享队列中所有资源。 在同一个队列中,job的资源缺额越大,越先获得资源优先执行。

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网盘资源_P2P资源搜索

网盘资源_P2P资源搜索 作者:matrix 被围观: 1,006 次 发布时间:2013-09-17 分类:兼容并蓄 零零星星 | 无评论 » 这是一个创建于 3271 天前的主题,其中的信息可能已经有所发展或是发生改变...网盘资源搜索 可以搜索百度网盘、快传、华为网盘、千军万马、115网盘、即得网盘的资源,可谓神器。...shareid=2982448600&uk=3238236832 p2p资源搜索 下载:http://www.400gb.com/file/43394730 http://pan.baidu.com/...s/1y5fnn 运行P2P Seacher.exe,如图注意右下角显示是否已连接 p2psearcher 资源搜索 4.0(这东东不定时抛锚,不建议使用) 下载: http://www.400gb.com...ps: 2013/12/11添加p2p资源搜索 此类神器的作用,呵呵  你娃晓得。

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Kubernetes | 资源控制 - ResourceController

什么是控制 在 Kubernetes 中,控制是一种状态机,用于控制 Pod 的具体状态和行为。...Kubernetes 中内置了很多种控制类型,包括: ReplicationController 和 ReplicaSet Deployment DaemonSet StatefulSet Job/CronJob...Ready 状态),基于 init containers 来实现 有序收缩,有序删除(即从 N-1 到 0) 部署顺序和终止顺序是相反的 Horizontal Pod Autoscaling 应用的资源使用率通常都有高峰和低谷的时候...Horizontal Pod Autoscaler 根据 CPU 使用率或者应用自定义的 metric(指标)来自动扩展或缩减 Pod 的数量,从而保持应用的资源使用率在一个可控制的范围内。...Pod 的分类 自主式 Pod Pod 退出了,此类型的 Pod 不会被创建 控制管理的 Pod 在控制的生命周期里,始终要维持 Pod 的副本数目 声明式编程 (Deployment) create

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chipBase:转录因子调控网络数据

首先对来自10个物种一万多个样本的chip_seq数据进行分析,通过peak caling得到转录因子在基因组上的结合区域,同时提供了UCSC基因组浏览可视化和motif分析。...最后根据来自TCGA数据库和GTEx项目约2万例样本的转录组结果,对转录因子和调控基因的相关性进行分析。该网站提供了以下几个主要功能 1....查看转录因子和基因间的调控网络 提供了转录因子与非编码RNA和蛋白编码基因之间的调控关系,以lncRNA为例,检索框如下 ?...Regulator 输入感兴趣的基因,查看有哪些转录因子可能调控该基因,以TP53为例,示意如下 ? 点击factor可以查看对应的详细结果,示意如下 ? 3....通过chip_base, 可以方便的查看转录因子与基因间的调控关系,还可以进一步结合转录组的共表达分析对结果进行筛选。

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