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Cytoscape插件1:Centiscape

为了进一步证实以上,作者又分析了centroid。画了centroid vs centroid图,以显示其线性分布 ,和degree一样,也不是一致的。Ucco用自己的数据画了这个图,看上面右图。...平均centroid是-393,242个点(206个激酶,36个磷酸化酶)比平均centroid高。Top10的centroid值的是(-79-18)全是激酶,还是MAPK1最高(18)。...PTPN1在所有磷酸化酶里有最高的centroid值(-154)(它在所有节点里排名22)。...由此,不管degree分析还是centroid分析,都显示无尺度分布,并且MAPK1和PTPN1是最关键的激酶和磷酸化酶。这个结论也可以通过话degree vs centroid图来证明。...从分析中可以看出,nodes非线性的分布非常明显,非常少的nodes在plot的第一象限(高degree高centroid)。这些nodes可以代表最重要的调节作用的激酶和磷酸化酶。

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