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circNet:人类环状RNA数据库

circNet是一个环状RNA的数据库,不仅收录了cirRNA的基本信息,还提供了环状RNA在不同组织中的表达谱数据以及circRNA-miRNA-gene的ceRNA调控网络,网址如下 http://...syslab5.nchu.edu.tw/CircNet/ 数据库构建的流程如下所示 ?...从SRA数据库中收集了来自26个不同组织,共464个样本的RNA_seq数据,利用find_circ软件预测其中的环状RNA,共预测到212950个环状RNA,和circBase数据库相比,其中有53687...软件预测环状RNA只会给出连接点在基因组上的位置,意味着我们只能确定环状RNA的头尾,无法直接确定中间的序列信息,为此,该数据库根据下图所示策略去注释环状RNA的序列信息 ?...根据环状RNA的序列,通过targetScan软件预测与miRNA的相互作用,然后再结合miRTarBase和miRBase数据库中的miRNA与基因的调控关系,构建了circRNA-miRNA-gene

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数据库数据库分类

非关系型数据库: 支持的数据格式: 键值(Key-Value)储存数据库; 列储存(Column-oriedted)数据库; 面向文本文档(Document-Oriented...)数据库; 图型(Graph)数据库。...严格上它不是一种数据库,应该是一种数据结构化存储方法的集合。...非关系型数据库分类 由于非关系型数据库本身天然的多样性,以及出现的时间较短,因此非关系型数据库非常多,并且大部分都是开源的。...).面向可扩展性的分布式数据库:这类数据库想解决的问题就是传统数据库存在可扩展性上的缺陷,这类数据库可以适应数据量的增加以及数据结构的变化 发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处:https://javaforall.cn

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商业数据库,云数据库,国产数据库,云原生数据库 开源数据库 那个更有看头

数据库这个行业是越来越有意思,参与的PEOPLE 是人山人海,锣鼓喧天,鞭炮齐鸣。 商业数据库 ,开源数据库,国产的数据库, 云原生的数据库 ,云RDS 数据库,已经不是百花齐放的,是星空璀璨。...这样的数据库已经都快成,嘴上非主流的数据库产品。...到底,商业数据库,开源数据库,云原生,云数据库,国产数据库那些更有看头,这里来胡说八道,当然也是不负责的胡说八道。...所以就略过这样的产品,说说商业数据库,云数据库,云原生数据库,开源数据库这几类。...回到商业数据库,云原生数据库,开源数据库(云RDS),主流的数据库世界基本上被这三种数据库类型围绕,那么与其研究数据库本身,不如研究到底哪些人使用这些数据库,你就知道那种数据库有发展了。

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数据库|数据库入门(二)

问题描述 数据库是我们前后端不可缺少的东西,数据库中最多的就是数据,当我们初次插入数据时,在一个表中的数据相对较少时我们可以一行一行的插入,但当我们遇到有逻辑关联的数据时,我们插入就会报错,我们该怎么插入呢...解决方案 在某个数据库的一张course表中,有cno、cname、cpno、ccredit四个属性列,分别为课程号,课程名,先行课号和成绩,先给大家解释一下什么是先行课就例如我们很多课为基础课,我们必须要先学完基础课才能学习在此课程基础之上的课程...insert into course values('1','数据库','5',4),('2','数学','',2),('3','信息系统','',4),('4','操作系统','6',3),('5',...insert into course values('1','数据库','5',4);insert into course(cno,cname,ccredit) values('2','数学',2);insert...','python',null,'周老师','5'select '3','大学英语',null,'贺老师','4'select '2','信息安全','1','马老师','4'select '1','数据库

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数据库学习】数据库总结

1,概念 1)数据库 数据库是长期存储在计算机内、有组织的、可共享的大量数据的集合。 数据库中存储的是数据及数据之间的关系。...正常情况读写文件系统比数据库快一到两个数据级; 数据库的查询,大量并发的时候可能最浪费时间的是connect和close。 数据库的优势是体现的大量数据的查询、统计以及并发读写,不是在速度上。...2)数据库数据特点 永久存储、有组织、可共享。...(数据的最小存取单位是数据项) 3)数据库系统的特点 ①数据结构化 ②数据的共享性,冗余度,易扩充 ③数据独立性高 数据独立性包括:物理独立性和逻辑独立性 a)物理独立性(外模式\模式映像): 用户程序不需要了解...b)逻辑独立性(模式\内模式映像): 逻辑独立性是指用户的应用程序与数据库的逻辑结构是相互独立的,即,当数据的逻辑结构改变时,用户程序也可以不变。

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MySQL数据库——数据库操作

1.登入、登出数据库 #登入数据库 mysql -u"用户名" -p "密码" #查看当前时间 select now(); #登出数据库 quit; exit; ctrl + d 2.创建、查看、...选择、删除、修改数据库 创建数据库时,设置数据库的编码方式 CHARACTER SET:指定数据库采用的字符集,utf8不能写成utf-8 COLLATE:指定数据库字符集的排序规则,utf8的默认排序规则为...general_ci; #查看数据库 show databases(); #选择数据库 use 数据库名; #删除数据库 drop databases 数据库名; #修改数据库字符集 alter...database 数据库名 default character set utf8 collate utf8_general_ci; #修改数据库名字 rename database 数据库名 to...新数据库名; 3.导入、导出数据库 #导入数据库 source /路径/xxx.sql; #导出数据库 mysql -uroot -p密码 数据库名<file.sql

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关系数据库数据库的设计(数据库学习)

当时SQL server数据库准备考试了,我花了两个星期把整本书看了,这些是当时做的笔记(针对老师划得重点),现在学习Java做了几个项目后,发现有很多东西不是特别理解,特地再次复习一下,并且自己再思考思考...(前提:R∈3NF) 5.数据库设计的6个阶段是什么?...按照规范设计方法,数据库设计分为六各阶段 -|需求分析:分析用户(对象)的要求 -|概念结构设计:将需求分析得到的数据抽象为反映用户观点的概念模型(事物联系)。...-|数据库物理设计:将逻辑设计阶段成型的数据库逻辑模型结合制定的DBMS,设计适合的物理结构。...-|数据库实施:根据逻辑和物理设计的结果,在计算机上建立起实际的数据库结构,并转入数据,进行试运行和评价。 -|数据库运行和维护:数据库实施阶段试运行结果符合设计目标后。

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实时数据库 内存数据库_实时数据库产品

性能和可靠性,更短的产品开发周期等需求,驱使开发者在他们的设计中,考虑采用经验证的、成熟的商业数据库系统组件来,来满足应用层的这些需求。   ...McObject公司的eXtremeDB嵌入式数据库系列产品是将高性能、稳定性和简单易用性等特性同时融入了工业基的数据库引擎。   了解eXtremeDB产品系列或eXtremeDB特性。...每个产品的页面,包含了eXtremeDB如何满足各个行业中的应用需求,例如内存数据库系统的超快性能,容错系统中高可用性的应用,SQL/ODBC,混合存储(内存和磁盘混合存储模式),64位系统的支持等等。...• 最快的内存数据库,   • 几乎牢不可破:了解我们如何避免数据库破坏   • 多种应用接口: 两种 SQL, 两种更快的原始接口   • 非常灵活的数据存储:内存式、磁盘式或混合式   • ...高可用性–组合选项 多种索引支持   • 极小尺寸和极小的内存消耗 eXtremeDB内存实时数据库把优异的性能、可靠性和开发效能与高效的实时数据库引擎完美结合。

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【Redis】Redis 数据库操作 ② ( 数据库操作 | 切换数据库 | 查询当前数据库键个数 | 清空当前数据库 | 清空所有数据库 )

文章目录 一、Redis 数据库操作 1、切换数据库 2、查询当前数据库键个数 3、清空当前数据库 4、清空所有数据库 一、Redis 数据库操作 ---- 在之前的博客 【Redis】Redis...数据库 安装、配置、访问 ( Redis 简介 | 下载 Redis 安装包 | 安装 Redis 数据库 | 命令行访问 Redis | 使用可视化工具访问 Redis ) 中 , 创建了数据库 ,...本篇博客基于该数据库进行讲解 ; 1、切换数据库 执行 select 1 命令 , 可以切换到 db1 数据库 ; 脚本示例 : 先切换到 db1 数据库 , 查看 keys 键 , 发现是空的 , 再切换回..., 清空当前数据库 ; 脚本示例 : 原来数据库中有 name2 键 , 执行清空命令后 , 再次查询数据库 , 发现 键 个数为 0 ; 127.0.0.1:6379> keys * 1) "name2...执行 flushall 命令 , 可以清空所有数据库内容 ; 脚本示例 : 先在 db0 插入 name=Tom 键值对 , 然后切换到 db2 数据库 , 执行 清空所有数据库内容的命令 ,

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数据库PostrageSQL-管理数据库

管理数据库 每个正在运行的PostgreSQL服务器实例都管理着一个或多个数据库。因此,在组织SQL对象(“数据库对象”)的层次中,数据库位于最顶层。...本章描述数据库的属性,以及如何创建、管理、删除它们。 22.1. 概述 一个数据库是一些SQL对象(“数据库对象”)的命名集合。...通常每个数据库对象(表、函数等) 属于并且只属于一个数据库(不过有几个系统表如pg_database属于整个集簇并且对集簇中的每个数据库都是可访问的)。...当连接到数据库服务器时,客户端必须在它的连接请求中指定它要连接的数据库名。每次连接不能访问超过一个数据库。不过,一个应用能够在同一个或者其他数据库上打开的连接数并没有受到限制。...有时候你想为其他人创建一个数据库,并且使其成为新数据库的拥有者, 这样他们就可以自己配置和管理这个数据库

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数据库PostrageSQL-数据库角色

数据库角色 PostgreSQL使用角色的概念管理数据库访问权限。一个角色可以被看成是一个数据库用户或者是一个数据库用户组,这取决于角色被怎样设置。...更多角色权限在多个数据库对象上的效果可以在Section 5.6中找到。 21.1. 数据库角色 数据库角色在概念上已经完全与操作系统用户独立开来。...数据库角色在一个数据库集簇安装范围内是全局的(而不是独立数据库内)。...为了引导数据库系统,一个刚刚被初始化好的系统总是包含一个预定义角色。这个角色总是一个“superuser”,并且默认情况下(除非在运行initdb时修改)它的名字和初始化数据库集簇的操作系统用户相同。...每一个到数据库服务器的连接都是使用某个特定角色名建立的,并且这个角色决定发起连接的命令的初始访问权限。要使用一个特定数据库连接的角色名由客户端指示,该客户端以一种应用相关的风格发起连接请求。

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数据库学习笔记-数据库简介

数据库系统(DBS):由硬件系统、数据库数据库管理系统、数据库应用程序、数据库用户等组成的系统。...用户或应用程序发出操作数据库中数据的命令都要通过数据库管理系统来执行 数据的查询是通过数据库管理系统,而并非从数据库直接查询 数据库管理系统的功能: 存储、检索、更新数据:用户通过数据库管理系统访问数据库...实现流程 数据库实现流程主要分为系统设计阶段以及系统实现两个部分: 系统设计:又分为3个阶段 概念数据库设计:所用方法为E-R建模模型 逻辑数据库设计:所用方法为规范化模式 物理数据库设计 系统实现:...依靠数据库语言来实现 建立数据库的方法:数据库定义语言(DDL) 操作数据库的方法:数据库操作语言(DML) 数据库设计 数据库设计要分为三个层次(三层体系结构 The Three-level ANSI-SPARC...不同的数据库结构,对应不同的数据库模型。

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「文档数据库数据库深度探索:MongoDB,最强文档数据库

欢迎回到数据库深度探索,在这里我们将与数据库领域的工程师、构建者和领导者进行一对一的交流。最近,我们采访了来自MongoDB的Richard Kreuter。...我是一名软件工程师,在过去的十年里,我从事的项目确实需要一个比市场上现有的数据库更灵活的数据库。当我第一次看到MongoDB时,我想,“哇,我希望我以前的项目也有这样的功能。”...我们最近还收购了一家移动数据库公司,Realm,它有一种非常类似mongodb的灵活方式来处理移动设备中的数据。...对多文档事务的技术需求始于MongoDB的第一次收购,一个名为WiredTiger的数据库存储引擎,它是由创建BerkeleyDB嵌入式数据库(世界上最流行的数据库引擎之一)的人创建的。...在这方面,它使从传统的表格数据库到MongoDB更容易一些。 你认为在Mongo堆栈中哪里有改进的空间?

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数据库专题(一) ——数据库优化

数据库专题(一) ——数据库优化 (原创内容,转载请注明来源,谢谢) 一、概述 数据库的优化通常分为三个方面:数据库DML、DQL的优化(即增删改查等SQL语句优化);数据库设计优化(如索引设置、索引类型...二、数据库语句优化 程序对数据库的操作,绝大部分来自查询,因此查询的优化至关重要,而大部分情况下,查询的优化在于索引命中率。网络上有很多查询优化的例子,在此主要说几点。...4、避免使用数据库的rand()函数 当需要查询表中的随机x条数据,避免使用rand,因为其无法使用索引。可以使用PHP将需要查询的随机条件提取出来,则在数据库中只要执行查询即可。...三、数据库设计优化 数据库设计阶段非常重要,当数据库表里面有大量数据,且有大量的程序对此表有操作时,再进行修改,就是一个灾难。...四、数据库服务器及配置优化 除了上述条件外,在数据库服务器和配置上也有需要进行优化的地方。 1、读写分离 通常大的系统中,都会进行读写分离操作。

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数据库PostrageSQL-数据库配置

数据库配置 回顾一下Chapter 19,PostgreSQL服务器提供了大量的运行时配置变量。你可以为其中的许多设置数据库相关的默认值。...例如,如果由于某种原因,你想禁用指定数据库上的GEQO优化器,正常情况下你不得不对所有数据库禁用它,或者确保每个连接的客户端小心地发出了SET geqo TO off。...要令这个设置在一个特定数据库中成为默认值,你可以执行下面的命令: ALTER DATABASE mydb SET geqo TO off; 这样将保存该设置(但不是立即设置它)。...在后续建立的到该数据库的连接中它将表现得像在会话开始后马上调用SET geqo TO off;。注意用户仍然可以在该会话中更改这个设置,它只是默认值。

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Oracle 数据库实例和数据库

本文参考自oracle数据库实例,数据库的理解,纯属读书笔记,用于加深记忆。 先看Tom关于这二者的解释: 1、数据库 物理操作系统文件或磁盘的集合(我觉得可以理解为数据文件等)。...3、RAC集群数据库模式 一般来说,我们的一个数据库对应一个实例,但在集群RAC情况下,共享数据库文件时,一个数据库是可以被多个实例同时使用的。...4、实例的作用 实例是我们向数据库读写数据或读数据的媒介,在Oracle单实例数据库中,只有一个实例,只能通过当前实例访问数据库,但是在RAC数据库中,一个数据库可以产生多个实例,当前数据库就能被所有的当前的实例所打开...因为xxx就是实例的名字,而xxx.ora中的db_name,则记录相应数据库的名字。 下面演示启动xxx实例,挂接数据库,打开数据库,关闭数据库、卸载数据库、关闭实例的过程。   ...9、输入命令 shutdown,则关闭数据库、卸载数据库、关闭实例。

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数据库-腾讯云数据库

数据库-腾讯云数据库主要分为:云数据库MySQL,云数据库Redis,云数据库MongoDB以及SQL Server 腾讯云数据库地址 http://cloud.tencent.com/act/pro.../voucherslist 页面上部是服务器,下面就是各种数据库。...云数据库MySQL三年只需1400多元,平均一年不到500元,非常的优惠。还有其它各种类型的云数据库都非常便宜 1、云数据库MySQL高可用版: 双节点架构,自动容灾。...提供备份回档、监控、快速扩容、数据传输、安全审计、只读实例等运维全套 2、云数据库Redis 采用主从节点架构,提供数据持久化和备份,亚毫秒级延迟,最高内存可支持4T,提供恢复,监控,按需升级等运维全套解决方案...4、云数据库MongoDB 适用于海量数据存储场景,支持三副本、集群,兼容DynamoDB 协议,提供备份,恢复,监控,权限管理等运维全套解决方案 1.jpg

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