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Galaxy 生信平台(二):生产环境部署

在上一篇文章中,我们介绍了适合单个用户进行使用和开发的 Galaxy 在线平台,今天我们来聊一下在为多用户生产环境设置 Galaxy 时,我们应采取的一些可以让 Galaxy 获得最佳性能的额外步骤。...对于 Galaxy 自身的框架依赖项 Galaxy 可以自行进行管理,因此您不必担心。...例如,在 Debian 和基于 Redhat 的 Linux 发行版上,可能已经安装了一个。如果没有,它应该是 apt-get install 或 yum install 。...CentOS 下安装 PostgreSQL,请参考:《Linux 下 PostgreSQL 源码编译安装》。 安装后,创建一个新用户和该新用户所属的新数据库。...要配置 Galaxy,请在 Galaxy 的配置文件 config/galaxy.yml 中设置 database_connection 。

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    Galaxy Project | 一些尝试与思考

    最近在尝试内部 Galaxy 一些新工具的开发和 Galaxy 核心版本的升级测试,发现一些问题,简单记录和聊一下吧。...好用开源的在线 web 生信分析平台不多,Galaxy 算是一个。...出于需要,借助 Galaxy 的开源软件做了一些内外部团队使用的工具,对非编程背景的研究人员而言也算友好,至少学习的操作的难度曲线基本可以忽略。...想把 Galaxy 的一些 static 和 test-data 放到 gitee,很可惜这样会导致 test-data 直接 fetch 到 Galaxy 时出现 403 异常。...简单总结 在《Galaxy Project | 生信人最值得学习的开源项目之一 · 语雀》分享过个人和 Galaxy 的一些经历,兜兜转转才发现工具才是 Galaxy 的核心(Workflow、Visualize

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    Galaxy 生信平台(四):邮件与管理员配置

    ,这也算是国内为数不多的 Galaxy 研究中的一抹亮色了。...Galaxy 邮箱与管理员 Galaxy Project 是一个基于云计算背景下的开源生物信息分析项目,而 Galaxy 平台则是这个项目的集大成者。...lib/galaxy/util/init.py lib/galaxy/managers/users.py lib/galaxy/webapps/galaxy/controllers/user.py 所以...配置 Galaxy 邮件服务 有了上一步 python 发送邮件的经验,接下来我们只需要修改一下 Galaxy 的主配置文件 config/galaxy.yml 即可: galaxy: smtp_server...Galaxy 在账号未激活状态下,登录后的界面 Galaxy 用户注册,通过邮箱实现账号激活 通过邮箱实现 Galaxy 用户密码修改 到这里,Galaxy 的邮件服务和管理员设置就完成了,

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    Galaxy v-21.01 发布,新的流程和历史栏体验

    这里总结一下该版本一些主要的更新内容,为关注和从事 Galaxy 相关工作的中文用户提供参考。 1....重点更新 工作流(Workflows)是 Galaxy v21.01 版本中的绝对明星,它们已经有了巨大的改进。...Galaxy Climate 社区正在提供一个很好的测试案例;他们的大部分数据都公开发布在公共的 S3 存储桶上,这些数据不容易获得,现在他们可以直接从 Galaxy 系统获得。...Pull Request 10754 Galaxy 中的 GTN 覆盖层页面现在可以跟踪您正在查看的页面,如果 Galaxy 页面得到刷新。去学习吧,不要分心!...参考资料 [1] 完整的发行说明:January 2021 Galaxy Release (v 21.01) [2] 21.01 announce user:January 2021 Galaxy Release

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    Galaxy Release_20.09 发布,新增多个数据上传组件

    Galaxy Project(https://galaxyproject.org/)是在云计算背景下诞生的一个生物信息学可视化分析开源项目。...您将能够在 Galaxy 中轻松查看和加载文件! 如果要使用这些服务,管理员首先需要配置这些功能,然后,需要在 Galaxy 的用户首选项中提供这些服务的凭据。...1.2 在 Galaxy 中接入 GTN 在 BCC2020 CoFest 期间,@hexylena和@shiltemann共同增加了对从 Galaxy 内部访问 Galaxy 培训网络教程的支持。...现在,此 PR 已合并并可以在 Galaxy 中使用。另外,这些文件还包括针对这些文件的特定可视化效果,使您可以直接在 Galaxy 中查看音频或视频媒体。...本文章的所有链接,以及可用于 Galaxy 管理员、开发人员更加详细的更新文档,可以点击文章底部"阅读原文"进行查阅。

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