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ggplot2绘制环状正负堆砌条形

❝「今天VIP群里有观众老爷询问如何绘制环状堆砌条形」例如下所示,既然观众老爷们有需求,那小编就来简单写篇文档进行介绍;下面来看具体案例「数据代码已经上传VIP群,请自行下载」 ❞ 例 图形解读...❝可以看到就是一张普通的堆砌条形只不过改为了圆形展示,通过图形我们可以看到数据分为两组,并且每一个样本数值有正负之分,因此与常见的条形绘制方法无二,只是在于构建极坐标并合理的添加文本;由于小编手里没有合适的数据因此使用...R内置数据集来进行展示,下面来看具体细节 ❞ 加载R包 library(tidyverse) 构建数据 ❝由于例有正负之分,「mtcars」数据集没有,因此我们人为构建一份数据 ❞ data1 <-

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「R」数据可视化19:环状条形

之前我们已经讲过很多条形啦,但是今天我们再来讲一种条形——环状条形(Circular barplot)。当厌倦普通的条形的时候或者空间有限但是要展示较多样本的时候,都可以考虑使用环状条形。...什么是环状条形(Circular barplot) 条形是科研中常用的,但是有时候可能你会觉得普通的条形过于平平无奇。...还有些时候展示的空间有限,数据却很庞大,这时再用普通的条形可能就不利于展示信息了。那么要怎么办呢?不如考虑一下使用环状条形。我们先来看几个关于环状条形的例子。...森林覆盖率与人口密度 通过上面两个例子可以发现环状条形是一种明明很简单,但是却让你眼前一亮,觉得好像很华丽的数据展现方式。那么要如何作图呢?...如何作环状条形 1)需要什么样的数据 我们这次使用的数据以及代码来源Azandis的博客[1]。我根据最终的图片,整理了所需要的数据。

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环状RNA芯片简介

研究环状RNA除了高通量测序外,还有一种常见的手段就是环状RNA芯片,两种产品之间各有优劣,只有了解其对应的特点,才能更好的做出选择。...在物种的适用范围上,高通量测序适用范围广,由于采用的是从头预测的策略,只需要这个物种有基因组序列就可以进行环状RNA分析; 环状RNA芯片依赖已知的环状RNA数据,由于需要根据已知的环状RNA来设计探针...在环状RNA的种类上,高通量测序采用软件预测的方式,不仅能够识别已知环状RNA,还能够发现新的环状RNA;芯片只能够检测到已知的环状RNA。...在环状RNA的数量上,理论上来说测序的数据量越大,其能够识别的环状RNA数量会越多,而芯片在设计之初就规定了能够检测到的环状RNA数量上限。...在环状RNA的可靠性上,高通量测序采用的是软件预测的手段,结果中必然存在一定的假阳性率;环状RNA芯片从各个数据库中收集整理,筛选出高可信度的环状RNA来设计探针,所以芯片检测到的环状RNA可信度高。

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circRNA:环状RNA简介

circRNA即环状RNA,顾名思义这种RNA是一个闭合的环状结构,经过反向剪切backsplicing形成的 ,示意图如下 ?...目前针对环状RNA的研究,有两种建库方式,一种就是去rRNA的文库,这种文库中同时包含了mRNA,lncRNA,circRNA等多种RNA分子,一次可以获得多种RNA分子的信息,缺点就是circRNA占比较低...,如果想要挖掘更多的circRNA,需要更大的测序量;另外一种是用RNA酶消化线性RNA,从而实现环状RNA的富集,这种方式适用于只研究cicrRNA的情况。...拿到测序数据之后,首先要做的就是去预测其中的环状RNA分子,目前主流的软件有以下几种 find_circ CIRI CIRCexplorer MapSplice circRNA_finder 环状RNA...近几年有科学家发现了部分circRNA具有编码潜能,通过IRES元件实现翻译过程,打开了环状RNA研究的新视角。

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