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转录数据分析- Raw data

图片 转录概述 图片 图片 图片 图片 图片 图片 图片 上机测序完成之后得到的测序数据为FASTQ文件 图片 Linux 复习 图片 准备工作-目录管理 图片 # 进入到个人目录 cd ~ ##...1.建立数据库目录:在数据库下建立参考基因数据库,注意命名习惯:参考基因版本信息 mkdir -p database/GRCh38.105 ## 2.建立项目分析目录 mkdir project...Mapping/Subjunc # 建立定量目录 mkdir -p Expression/featureCounts Expression/Salmon # 查看整个分析目录准备结构 tree ├── data.../rawdata ln -s /home/t_rna/data/airway/fastq_raw25000/*gz ./ 图片 图片 fastq数据第四行 图片 碱基识别出错的概率映射值Q值与FASTQ...70-33=37,对应图1 Q=37已经满足了 ) 图片 练习 图片 #题1: 方法1: (rna) Mar402 09:16:20 ~/project/Human-16-Asthma-Trans/data

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postman中 form-data、x-www-form-urlencoded、raw、binary的区别

1、form-data: 就是http请求中的multipart/form-data,它会将表单的数据处理为一条消息,以标签为单元,用分隔符分开。既可以上传键值对,也可以上传文件。...2、x-www-form-urlencoded: 就是application/x-www-from-urlencoded,会将表单内的数据转换为键值对,当模拟表单上传数据时,用此选项,但当然此表单不能上传文件...可以看到content-type是application/x-www-form-urlencoded ?...需要注意的是multipart/form-data与x-www-form-urlencoded区别: multipart/form-data:既可以上传文件等二进制数据,也可以上传表单键值对,只是最后会转化为一条信息...; x-www-form-urlencoded:只能上传键值对,并且键值对都是间隔分开的。

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Linux 配置WWW服务器全攻略

Linux 配置WWW服务器全攻略第一站 Apache的历史与前景 1995年,美国国家计算机安全协会(NCSA)的开发者创建了NCSZ全球网络服务软件,其最大的特点是HTTP精灵程序,它比当时的CERN...如果你对它感兴趣,你可以访问Apache的官方网站:http://www.apache.org。...一,使用源代码安装 (1) 获得源代码 # lynx http://www.apache.org/dist/httpd/httpd-2_0_NN.tar.gz NN表示当前所用的版本号。...我们可以直接修改httpd.conf文件也可以用redhat linux 9自带的图形化工具来配置。打开启动程序->系统设置->服务器设置->HTTP服务器,可以进行相关。...User apache #一般情况下,以nobody用户和nobody来运行web服务器,因为web Group apache # 服务器发出的所有的进程都是以root用户身份运行的,存在安全风险。

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Linux 调度浅析

cgroup 与调度 linux内核实现了control group功能(cgroup,since linux 2.6.24),可以支持将进程分组,然后按来划分各种资源。...cgroup支持很多种资源的划分,CPU资源就是其中之一,这就引出了调度。 linux内核中,传统的调度程序是基于进程来调度的(参阅《Linux 进程调度浅析》)。...在linux内核中,使用task_group结构来管理调度的。所有存在的task_group组成一个树型结构(与cgroup的目录结构相对应)。...(参见《linux内核SMP负载均衡浅析》。近期会推送给大家) 的调度策略 调度的主要数据结构已经理清了,这里还有一个很重要的问题。...实时进程的调度 从《Linux 进程调度浅析》一文可以看到,实时进程是对CPU有着实时性要求的进程,它的优先级是跟具体任务相关的,完全由用户来定义的。调度器总是会选择优先级最高的实时进程来运行。

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图解|Linux 调度

为了解决这个问题,Linux 实现了 调度 这个功能。那么什么是 调度 呢? 调度 的实质是:调度时候不再以进程作为调度实体,而是以 进程 作为调度实体。...如下图所示: cgroup 相关的知识点可以参考文章:《cgroup介绍》 和 《cgroup实现原理》 在 Linux 系统启动时,会创建一个根进程 init_task_group。...# 在进程A中创建进程C $ echo 1923 > /sys/cgroup/cpu/A/cgroup.procs # 向进程A中添加进程ID为1923的进程 Linux 在调度的时候,首先会根据...在分析之前,为了对 完全公平调度算法 有个大体了解,建议先看看这篇文章:《Linux完全公平调度算法 》。 1. 进程Linux 内核中,使用 task_group 结构表示一个进程。...Linux 调度的时候,就是从上而下(从根进程开始)地筛选出最优的进程进行运行。 2.

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Linux 用户和

Linux 用户和 1、用户和的概念 用户的作用: Authentication:认证 Authorization:授权 Accouting:审计 用户存在的最终目的: 为了实现资源的分派 的作用...: 将具有相同特征的用户放在一起组成一个整体 当用户过多时方便管理 1.1Linux安全上下文 Linux通过安全上下文的概念完成用户权限的指派。...---- 2 用户分类 Linux分为root用户、系统用户、普通用户: 用户分类 用户ID(uid) root用户 0 系统用户 1~499(为守护类进程获取系统资源而完成权限指派的用户) 普通用户...500~65535(为了完成交互式登录使用的用户) ---- 3 的分类 用户组分类 特性 基本组 用户的默认 附加组(额外) 基本组以外的其它 ---- 4、用户和相关的配置文件 4.1...第二字段 密码 第三字段 GID 第四字段 以当前为附加组的用户列表 /etc/gshadow root::: 字段 意义 第一字段 用户 第二字段 用户密码 第三字段 用户管理者 第四字段

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把宝塔面板linux版装在www以外的目录

这里就为大家分享一下将面板安装到别的目录的方法,把宝塔面板linux版装在/www以外的目录。...本人在饱受重装系统折磨之后,终于忍无可忍将宝塔面板安装到 home 下(home 分区一般都很大) 宝塔面板官方的安装脚本是强制安装到系统根目录下的 www 目录的,而官方也明确表示过…...但是并不代表不允许修改,以下是修改方法,本人原创亲测: 如果是纯净系统还没安装宝塔面板,直接连接终端不墨迹,命令搞起来: 1、进入 home 目录 cd /home 2、创建宝塔面板安装需要用的 www...目录 mkdir www 3、建立/home/www 的软连接到/www (也就是给系统根目录建立一个 www 的“快捷方式”指向/home/www) ln -s /home/...www /www

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linux怎么创建用户和用户_linux查看用户

1、linux里查看所有用户 (1)在终端里.其实只需要查看 /etc/passwd文件就行了. (2)看第三个参数:500以上的,就是后面建的用户了.其它则为系统的用户..../shadow和 /etc/passwd 创建/etc/passwd ,然后会删除 /etc/shadow 文件; finger 注:查看用户信息工具 id 注:查看用户的UID、GID及所归属的用户...visodo 是编辑 /etc/sudoers 的命令;也可以不用这个命令,直接用vi 来编辑 /etc/sudoers 的效果是一样的; sudoedit 注:和sudo 功能差不多; 3、管理用户(...group)的工具或命令; groupadd 注:添加用户; groupdel 注:删除用户; groupmod 注:修改用户信息 groups 注:显示用户所属的用户 grpck grpconv...etc/gshadow 不存在则创建; grpunconv 注:通过/etc/group 和/etc/gshadow 文件内容来同步或创建/etc/group ,然后删除gshadow文件 首先创建用户

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linux用户与管理

linux用户管理 linux用户分类 超级用户:root uid=0 用户身份user identify 普通用户:可以登录系统 uid 500-60000 程序用户:程序依托一个用户的权限,权限非常小...字段9:目前没有定义 每一个用户都必须拥有一个基本组,多个附加组(公共) /etc/group 存储着账号信息 /etc/group文件格式: root:x:0:root 字段1:名 字段2:密码占位符...符号 -U 解锁用户 linux管理 查看信息 cat /etc/group /etc/group文件格式 root:x:0:root 字段1:名 字段2:密码占位符 字段3:id(gid)...字段4:组成员 管理命令 创建 groupadd 名 -g 指定id 修改gid groupmod -g 1500 名 添加成员 gpasswd -a 用户名 名 删除 groupdel...

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Linux用户和管理

伪用户一般和系统或者程序服务相关,比如bin,daemon,shutdown ,halt等,linux默认都有这些伪用户,伪用户通常不需要或无法登陆系统(nologin),可以没有宿主目录 用户和的配置文件...UID:Linux系统中惟一的用户标识,用于区别不同的用户。在系统内部管理进程和文件保护时使用 UID字段。...564404 用户密码文件:/etc/shadow vim /etc/shadow 在该文件中每一行密码记录的各个数据段也是用‘:’分隔,一共有九位, 这九个位的含义参考网址: https://www.cnblogs.com.../zhousir1991/archive/2011/07/25/2116520.html 配置文件 vim /etc/group 字段解释参考如下网址: https://www.cnblogs.com...#将mingxing的名称改为mingxing1 删除 groupdel mingxing 查看 cat /etc/group #查看所有 groups liuyifei #查看用户所在的

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Linux用户及管理

Linux下用户及管理 系统中的文件都有一个所属用户及所属 使用id命令可以显示当前用户的信息 使用passwd命令可以修改当前用户密码 每个用户拥有一个UserID,操作系统实际使用的是用户ID,...环境 linux实现权限隔离机制(多用户) 操作系统识别用户: 用户:UID :GID(逻辑容器,包含用户;实现多个用户对于某个文件或者应用程序分配相同的权限) 用户ID为32位,从0开始,但是为了和老式系统兼容...,用户ID限制在60000以下 用户分类: 管理用户:ROOT UID:0 普通用户:500-65535 程序(系统)用户:1-499 组分类: 管理员/普通 基本组:Linux中,新建用户时,没有指定隶属于的...sbin/nologin admin #建立admin用户并设置uid为544 [root@localhost ~]# useradd admin -u 544 #创建yangxz用户并加入到www...钟,加到附属admin,admin1中 [root@localhost ~]# useradd -g www yangxz -G admin,admin1

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Linux用户及管理

Linux下用户及管理 系统中的文件都有一个所属用户及所属 使用id命令可以显示当前用户的信息 使用passwd命令可以修改当前用户密码 每个用户拥有一个UserID,操作系统实际使用的是用户ID,...环境 linux实现权限隔离机制(多用户) 操作系统识别用户: 用户:UID :GID(逻辑容器,包含用户;实现多个用户对于某个文件或者应用程序分配相同的权限) 用户ID为32位,从0开始,但是为了和老式系统兼容...,用户ID限制在60000以下 用户分类: 管理用户:ROOT UID:0 普通用户:500-65535 程序(系统)用户:1-499 组分类: 管理员/普通 基本组:Linux中,新建用户时,没有指定隶属于的...sbin/nologin admin #建立admin用户并设置uid为544 [root@localhost ~]# useradd admin -u 544 #创建yangxz用户并加入到www...钟,加到附属admin,admin1中 [root@localhost ~]# useradd -g www yangxz -G admin,admin1

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NAR| 表观关联分析数据库 - EWAS Data Hub

近年来, 表观关联分析(Epigenome-wide Association Study,EWAS)已成为探索复杂性状表观遗传基础的有效策略。...为了解决这些问题,国家中心开发了EWAS Data Hub数据库。 ?...近日,由中国科学院北京基因研究所国家基因科学数据中心(以下简称国家中心)开发的人类表观关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。...该项研究成果以“EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata”为题在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic...同时,EWAS Data Hub 还提供了高效的查询方式。 ? 以探针“cg16867657”为例: ? 图A 该探针的基本信息,包括基因位置、相关基因、与年龄性别等表型的相关性 ?

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