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Linux 网卡数据收发过程分析

一般来说,网卡主要有两个重要的功能:接收数据 和 发送数据。 所以,当网卡接收到数据包后,要通知 Linux 内核有数据需要处理。另外,网卡驱动应该提供让 Linux 内核把数据把发送出去的接口。...net_device 结构是 Linux 为了适配不同类型的网卡设备而抽象出来的对象,不同的网卡驱动只需要按 Linux 的规范来填充 net_device 结构的各个成员变量,Linux 内核就能够识别出网卡...下面我们将分析网卡设备接收和发送数据包的实现原理。...不过本文主要分析网卡设备收发数据的实现,所以不会分析 net_device 结构的所有成员。...当网卡从网络接收到数据包后,需要产生一个中断来通知 Linux 内核有数据包需要处理,而 irq 就是网卡驱动注册到内核中断服务的中断号。

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数据分析-cuttag分析流程分享1-linux代码流程分析

鉴于近期分析了大批量的3个不同物种的cuttag数据,准备分享一下相关的代码。 数据完整性检测 首先是需要对测序公司给的测序数据的完整性进行test,如果md5值不吻合,后面还需要让公司发一份。...txt文件,大致的知道自己测序文件的mapping率及数据质量,一般是mapping率大于80%,可以算是比较不错的测序数据,一般建议可以接着往下分析。...如果是用的linux系统的IGV,那就不需要考虑这些问题啦,最近发现了一个远程控制服务器的软件,MobaXterm,充分满足了我这个懒人,不想配置X11的想法,下载完了,就可以可视化了,后续用R出可视化的图...目前是通过这些shell脚本获得了可以可视化的bedgraph文件,可以初步确定自己做的蛋白与DNA的结合位置是否准确,同时还获得了一些峰值的结果,可以大致看到cuttag建库的背景情况,那下一篇对R语言可视化(数据分析...主要还是考虑我们的测序数据的结果,同时也问了几个做分析很厉害的师兄,目前也是不建议去重的,所以目前这个去重的流程分析还是需要针对项目的数据质量来进行后续分析的。

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Linux 性能分析工具 nmon for Linux

你只需在键盘键入若干字符即可启用/关闭各种各样的数据。 你可以显示 CPU、内存、网络、硬盘、文件系统、NFS、大进程、resources(Linux 版本和处理程序)以及功率微分区信息。...将数据保存到一个逗号分隔的文件以供分析,并进行长时间数据捕捉 配合使用 nmon Excel 2000 电子表格分析器,该分析器能够加载 nmon 输出文件并自动为你创建几十个图形,你可以基于这些图形研究或填写性能报告...将这些数据直接放到一个 rrd 或者其他类型的数据库以备你自己分析使用。...下载源码编译 - 点击 编译 nmon 数据分析 保存好 nmon 数据以后,你可以使用以下几种工具之一来对其进行分析并生成统计图。...,可以通过一个浏览器对分析情况进行查看 现在 - 开源了 nmon for Linux 是一个单一的 5000 行代码的源码文件和单一的 makefile。

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Linux 内核架构分析

进程间通信(IPC)子系统实现在单个Linux系统上进行进程间通信的多种机制。 从依赖性的角度分析: 进程调度程序子系统使用内存管理器为恢复特定进程的特定进程调整硬件内存映射。...最后,任务数据结构还包含指向数据结构的指针,该数据结构表示与每个任务关联的所有打开的网络连接。 3.各子系统架构分析 3.1 进程调度器架构 进程调度器是Linux内核中最重要的子系统。...3.2.1 模块结构分析 内存管理器主要由以下三个模块组成: 体系结构相关模块为内存管理硬件提供了虚拟接口 体系结构无关模块执行所有的每个进程映射和虚拟内存交换。...3.2.2 从数据表征的角度分析: 内存管理器存储物理地址到虚拟地址的每个进程的映射。该映射作为参考存储在流程调度程序的任务列表数据结构中。...3.3.1 模块结构分析 可分为四大模块: 公共驱动抽象模块 由于存在大量不兼容的硬件设备,因此存在大量的设备驱动程序。Linux系统最常见的扩展是添加了新的设备驱动程序。

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Linux 启动流程分析

我主要关心的是Linux操作系统,它是目前服务器端的主流操作系统。下面的内容针对的是Debian发行版,因为我对其他发行版不够熟悉。...它们在Windows叫做"服务"(service),在Linux就叫做"守护进程"(daemon)。 init进程的一大任务,就是去运行这些开机启动的程序。...Linux允许为不同的场合,分配不同的开机启动程序,这就叫做"运行级别"(runlevel)。也就是说,启动时根据"运行级别",确定要运行哪些程序。 ? Linux预置七种运行级别(0-6)。...Linux的解决办法,就是七个 /etc/rcN.d 目录里列出的程序,都设为链接文件,指向另外一个目录 /etc/init.d ,真正的启动脚本都统一放在这个目录中。...顺便提一下,除了Linux以外, Mac OS X 使用的shell也是Bash。但是,它只加载.bash_profile,然后在.bash_profile里面调用.bashrc。

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Linux 启动流程分析

我主要关心的是Linux操作系统,它是目前服务器端的主流操作系统。下面的内容针对的是Debian发行版,因为我对其他发行版不够熟悉。...它们在Windows叫做"服务"(service),在Linux就叫做"守护进程"(daemon)。 init进程的一大任务,就是去运行这些开机启动的程序。...Linux允许为不同的场合,分配不同的开机启动程序,这就叫做"运行级别"(runlevel)。也就是说,启动时根据"运行级别",确定要运行哪些程序。 Linux预置七种运行级别(0-6)。...Linux的解决办法,就是七个 /etc/rcN.d 目录里列出的程序,都设为链接文件,指向另外一个目录 /etc/init.d ,真正的启动脚本都统一放在这个目录中。...你向 Mysql 数据库插入 100w 条数据用了多久? 架构师必备技能:教你画出一张合格的技术架构图 一般电商应用的订单队列架构思想 我的天!

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Linux 启动流程分析

我主要关心的是Linux操作系统,它是目前服务器端的主流操作系统。下面的内容针对的是Debian发行版,因为我对其他发行版不够熟悉。...它们在Windows叫做"服务"(service),在Linux就叫做"守护进程"(daemon)。 init进程的一大任务,就是去运行这些开机启动的程序。...Linux允许为不同的场合,分配不同的开机启动程序,这就叫做"运行级别"(runlevel)。也就是说,启动时根据"运行级别",确定要运行哪些程序。 ? Linux预置七种运行级别(0-6)。...Linux的解决办法,就是七个 /etc/rcN.d 目录里列出的程序,都设为链接文件,指向另外一个目录 /etc/init.d ,真正的启动脚本都统一放在这个目录中。...顺便提一下,除了Linux以外, Mac OS X 使用的shell也是Bash。但是,它只加载.bash_profile,然后在.bash_profile里面调用.bashrc。

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Linux提权分析

前言 之前 红队视角下Linux信息收集 中提到过提权的信息收集命令,但没有细讲。本篇文章将着重于各种linux提权手段,总结提权的条件和原理。...列出所有建立的网络连接 正在运行的程序 查找并列出进程二进制文件和关联的权限 列出inetd.conf / xined.conf内容和关联的二进制文件权限 列出init.d二进制权限 信息的命令都可以在之前的 红队视角下Linux...容器中 软件版本信息 查看版本的命令一般都是 -V sudo -V mysql -V [4.png] [5.png] 弱认证 select User, host from mysql.user; 查询数据库用户比较简单...dmidecode -s system-product-name [8.png] systemd-detect-virt virt-what [9.png] --- 总结 本文从软件和系统两个方面梳理了linux

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Linux进程调度分析

linux在缺页异常的处理代码中试图分配内存时,又可能由于系统内存紧缺而分配失败,导致进程进入睡眠; 2、代码执行过程中硬件产生中断,linux进入中断处理程序而搁置当前进程。...有兴趣的朋友可以参考下面的链接: 《Linux 调度器发展简述》 《鼠眼看Linux调度器》 《鼠眼再看Linux调度器[1]》 《鼠眼再看Linux调度器[2]》 调度程序的效率 “优先级”明确了哪个进程应该被调度执行...那么,为什么从linux 2.6早期到近期linux 2.6版本,调度程序选择进程时的复杂度反而增加了呢?...比如执行read系统调用时,磁盘高速缓存里没有所需要的数据,从而睡眠等待磁盘IO; 进程响应信号而变为非可执行状态。比如响应SIGSTOP进入暂停状态、响应SIGKILL退出、等等; 2、抢占。...这使得一个进程在一段时间内总是在同一个CPU上执行,那么很可能这个CPU的各级cache中都缓存着这个进程的数据,很有利于系统性能的提升。

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Linux内核Crash分析

在工作中经常会遇到一些内核crash的情况,本文就是根据内核出现crash后的打印信息,对其进行了分析,使用的内核版本为:Linux2.6.32。...对每一个进程来说,Linux内核都会把两个不同的数据结构紧凑的存放在一个单独为进程分配的存储空间中:一个是内核态的进程堆栈,另一个是紧挨进程描述符的数据结构thread_info,叫线程描述符。...在Linux-2.6.32内核中thread_info.h文件中有对内核堆栈的定义: #define THREAD_SIZE 8192 在Linux内核中使用下面的联合结构体表示一个进程的线程描述符和内核栈...,在内核中文件include/linux/sched.h。...堆栈数据是从栈底+8K的地方开始向下存的。SP指向的是当前的栈顶。

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