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「R」dplyr 计算

「原文来自:dplyr 文档」 上一篇:「R」dplyr 列式计算 通常 dplyr 和 R 更适合对列进行操作,而对操作则显得更麻烦。...本文将讨论 3 种常见的使用案例: 按聚合(例如,计算 x, y, z 的均值)。 多次以不同的参数调用同一个函数。 处理列表列。...> #> 1 1 3 5 3 #> 2 2 4 6 4 如果你使用 mutate() 操作一个常规的数据框,它计算所有的...而如果你只应用到一个式数据框,它计算每一的均值。...但如果你要考虑计算的速度,寻找能够完成任务的内置的式汇总函数非常值得。它们的效率更高,因为它们不会将数据切分为,然后计算统计量,最后再把结果拼起来,它们将整个数据框作为一个整体进行操作。

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计算与推断思维 四、数据类型

四、数据类型 原文:Data Types 译者:飞龙 协议:CC BY-NC-SA 4.0 自豪地采用谷歌翻译 每个值都有一个类型,内建的type函数返回任何表达式的结果的类型: type(3)...type(abs) builtin_function_or_method 这一章会探索其他实用的数据类型。 字符串 世界上大部分的数据都是文本,计算机中表示的文本被称为字符串。...train" t = s.replace('t', 'ing') u = t.replace('in', 'de') u 'degrade' 注意t = s.replace('t', 'ing')的一,...例如,sum函数计算集合中所有值的和,len函数计算其长度。 (这是我们放入的值的数量。)一起使用它们,我们可以计算一个集合的平均值。...让我们计算莱布尼茨的无穷和的前 5000 个项,看它是否接近 π。

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1代码计算肿瘤突变负荷TMB

而且还有人找到了一串巨长的代码计算TCGA的TMB...大可不必!...本文目录: 准备数据 使用maftools计算TMB 生存分析 准备数据 肿瘤突变负荷(TMB, tumor mutation burden)的计算非常简单,你不用费心去找各种代码,找到了估计初学者也看不懂...如果你是生信类、计算机类的专业我能理解,你一个学临床的为什么总是喜欢自己重新造轮子呢?就一个TMB计算还要写几十代码,真没必要!...加载临床数据,临床数据的下载可以参考推文: 新版TCGA数据库学习:批量下载数据 1代码提取6种TCGA表达矩阵2.0版 1代码提取TCGA的6种表达矩阵是有视频教程的 我更推荐1代码系列获取的临床信息...可能是最适合初学者的TCGA官网下载和表达矩阵整理教程 新版TCGAbiolinks包学习:可视化 1代码提取6种TCGA表达矩阵和临床信息 1代码提取6种TCGA表达矩阵2.0版 1代码提取TCGA

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Linux 删除文本中的重复

在进行文本处理的时候,我们经常遇到要删除重复的情况。那怎么解决呢? 下面就是三种常见方法? 第一,用sort+uniq,注意,单纯uniq是不行的。...shell> sort -k2n file | uniq 这里我做了个简单的测试,当file中的重复不再一起的时候,uniq将服务删除所有的重复。...经过排序后,所有相同的行都在相邻,因此unqi可以正常删除重复。 第二,用sort+awk命令,注意,单纯awk同样不行,原因同上。...P; D' 最后附一个必须先用sort排序的文本的例子,当然,这个需要用sort排序的原因是很简单,就是后面算法设计的时候的“局部性”,相同的可能分散出现在不同的区域,一旦有新的相同行出现,那么前面的已经出现的记录就被覆盖了...参考推荐: 删除文本中的重复(sort+uniq/awk/sed)

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FPGA计算3同列数据之和

实验:FPGA计算3同列数据之和 实验要求:PC机通过串口发送3数据(一有56个数据,3共有56*3=168个数据)给FPGA,FPGA计算3同一列数据的和,并将结果通过串口返回给上位机。...FIFO IP Core,将串口接收到的数据进行缓存,当第一个FIFO1的数据存满后,将FIFO1的数据读出来给FIFO2,当FIFO2的数据存满时,当前两个FIFO的数据和串口正在接收的数据就可以看做为三数据了...我们将3数据同时读出,进行求和,然后用串口发送到上位机,这里要注意的是三个数据必须对齐,要不然是最终结果是不正确的。我这里为了验证方便,只生成了一16个数据。 ? ?   ...)//串口信号输出 21 );   然后是写激励,在工程代码中我们尽量少用for循环,但是在测试文件中便可以使用for循环来减少激励的书写量,提高仿真效率,这里的#7040是我在上面仿真的时候计算出来的...最后下载板子进行功能验证,发送3组00-0f的数据,最后由串口返回上位机的数据查看,三数据一列求和的结果是完全正确的。至此实验结束,下面要进入基于FPGA的Sobel边缘检测实验了。

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代码加快pandas计算速度

使用pandas,当您运行以下行时: # Standard apply df.apply(func) 得到这个CPU使用率: 标准pandas适用 - 仅使用1个CPU 即使计算机有多个CPU,也只有一个完全专用于您的计算...Pandaral·lel 的想法是将pandas计算分布在计算机上所有可用的CPU上,以显着提高速度。...请注意如果不想并行化计算,仍然可以使用经典apply方法。 也可以通过将显示每个工作CPU一个进度条progress_bar=True的initialize功能。...基准 对于此处提供的四个示例,请执行以下配置: https://github.com/nalepae/pandarallel/blob/master/docs/examples.ipynb 操作系统:Linux...@ 3.40 GHz - 4核 4核上的标准与并行(越低越好) 除了df.groupby.col_name.rolling.apply速度仅增加x3.2因子之外,平均速度增加约x4因子,即使用过的计算机上的核心数

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