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STRING网站+Cytoscape软件制作精美蛋白互作网络图(PPI)

点击蓝字关注我们 之前小编为大家推送了利用DAVID网站进行差异基因的GO和KEGG分析,而基因功能注释后就可以寻找蛋白表达之间的关系了,在生信分析中,常常会使用STRING网站+Cytoscape软件来制作蛋白互作网络图...首先我们进入STRING网站的官网(网址为https://string-db.org/),界面很简单明了,左侧一栏是网站的输入方式,右侧一栏是我们的蛋白输入框。...选择好蛋白的输入方式后,输入一列差异基因,STRING网站对基因的限制条件是不超过2000个基因,格式也是每行一个基因名(或者说是蛋白名字吧,总之就是差异基因所表达的蛋白)。...保存好的TSV格式文件是Cytoscape软件数据的输入方式之一,当我们在STRING网站完成PPI制作之后,就可以打开Cytoscape软件了。...STRING网站是我们在生信分析中针对蛋白互相作用分析的一个重要工具,然而,它提供给我们的图形是十分粗犷的,但是当它结合了Cytoscape软件对PPI的美化功能后,我们的图形会出现脱胎换骨的气息!

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