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vasp-vtst过渡态计算过程

——课题组概况 vasp-vtst计算过渡态 1935年,Eyring,Evans和Polanyi在统计热力学和量子力学的基础上提出了过渡态理论,可以通过基本物性(分子震动频率、质量、核间距等)计算反应速率常数...当前过渡态、反应路径的计算方法有很多,限于精力不可能面面展开,本文针对常用的NEB算法进行简单介绍。...NEB方法:撒点,弹簧力 CL-NEB方法:其中一个点跑到势能面鞍点,即过渡态 vasp-vtst提供的NEB优化算法(IOPT参数) VASP计算过程 过渡态计算的收敛准则只与力相关,即设置EDIFFG...#通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知VASP使用vtst计算; IMAGES=7 #之前添加的图像数量N image number; IBRION =3...#specify that VASP does molecular dynamics; POTIM=0 #zero time step so that VASP does

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【Android 逆向】ELF 文件格式 ( ELF 文件简介 | ELF 文件结构 )

文章目录 一、ELF 文件简介 二、ELF 文件结构 一、ELF 文件简介 ---- ELF 文件是 Executable and Linkable Format ( 可执行 和 可链接 格式 ) 的文件...可执行文件 , 编译中间文件 , 都是 ELF 格式的文件 ; 在 Android 应用运行时 , ELF 文件的大部分内容 , 会被 映射到内存中 ; 这就意味着 Android 应用内存中的很多数据..., 会遵循 ELF 文件格式的规范 ; ELF 文件格式最常见的形式就是 .so 动态库 ; ELF 文件的特点 : ELF 文件是以 7F 45 4C 46 开头 , 其中 7F 是一个二进制标志..., 45 4C 46 是 ELF 字符对应的 ASCII 码 ; 二、ELF 文件结构 ---- ELF 文件由以下四部分组成 : ELF 文件头 ELF 程序头 : ELF 程序头 会告知 节区头部表的位置...; 节区或段 节区头部表 : 节区头部表 会告知 ELF 文件中有多少个 节区 , 一般 节区头部表 一般都在 ELF 文件尾部 ;

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【Android 逆向】ELF 文件格式 ( ELF 文件头 | ELF 文件头标志 | ELF 文件位数 | ELF 文件大小端格式 )

文章目录 一、ELF 文件简介 二、ELF 文件头 三、ELF 文件头标志 四、ELF 文件位数 五、ELF 文件大小端格式 一、ELF 文件简介 ---- 在上一篇博客 【Android 逆向】ELF...文件格式 ( 安装 010 Editor 二进制查看工具的 ELF.bt 插件模板 | 安装 ELF.bt 模板 | 打开 ELF 文件 ) 中 , 准备 ELF 文件解析环境 , 在 010 Editor...中安装了 ELF.bt 模板 ; 二、ELF 文件头 ---- ELF 文件头区域如下 : 前 16 字节是 ELF 的标志 , 三、ELF 文件头标志 ---- 0 ~ 3 字节 : 是 0x7F...和 ELF 的 ASCII 码 ; 这是 ELF 文件的特征 ; 四、ELF 文件位数 ---- 4 字节 : 表示该 ELF 文件的位数 32 位还是 64 位 ; 值为 01 , 表示该 ELF...文件是 32 位 文件 ; 五、ELF 文件大小端格式 ---- 5 字节 : 表示 有效位 格式 , 取值 LSB / MSB ; 此处值为 1 , LSB 格式 ; 这个值由编译器决定 ; 有些

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【Android 逆向】ELF 文件格式 ( 安装 010 Editor 二进制查看工具的 ELF.bt 插件模板 | 安装 ELF.bt 模板 | 打开 ELF 文件 )

文章目录 一、搜索并下载 ELF.bt 模板 二、安装 ELF.bt 模板 三、打开 ELF 文件 一、搜索并下载 ELF.bt 模板 ---- 进入 010 Editor 工具的插件模板下载页面 http.../010editor/repository/files/ELF.bt ; 可以在浏览器下载中 , 新建下载项 , 下载该 ELF.bt 文件 ; EXE.bt : 文件地址 https://www.sweetscape.com.../010editor/repository/files/DEX.bt 可以在浏览器下载中 , 新建下载项 , 下载该 ELF.bt 文件 ; 二、安装 ELF.bt 模板 ---- 选择 " 菜单栏.../ 模板 / 编辑模板列表 " 选项 , 在弹出的对话框中 , 新建一个模板 , 并指定模板对应文件 ; 三、打开 ELF 文件 ---- 选择打开 ELF 文件 : 打开文件后 , 选择 "...菜单栏 / 模板 / ELF 模板 " 选项 , 此时就可以在 模板结果 面板 , 看到 ELF 文件的四个组成部分 ;

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elf格式分析

大概包含编制好的计算机指令,数据,计算机在须要的时候把这个文件读取到内存中,cpu就能够从内存中一条一条的读取指令来运行了。...所以说想明确elf格式,我们应该了解一下计算机运行程序须要那些信息。所以这一节,我们补充一些计算机系统的基础知识。...事实上计算机的内存是没有那么大的,比方我们实际使用的计算机仅仅有2G,曾经更小,仅仅有几百M,并且一台计算机上不仅仅执行一个进程,一个占用4G,假设有10个进程,那就得着用40G了,哪有那么打的内存呢?...尽管在这个过程中,系统会多次切换到其它进程,但对用户程序来说没有影响,我们能够觉得计算机仅仅为我们服务。...通过以上我们多次看到计算机是依据文件指示这种语言,所以学习elf 首先要理解elf指示了那些信息。 二、可运行的elf文件。

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ELF文件程序表头和代码实现ELF文件加载

前面章节我们了解了ELF文件的头部结构,这次我们深入了解另一个非常重要的数据结构,那就是程序表头。操作系统严重依赖该结构来加载ELF文件或是实现动态链接。...程序表头反映的是当ELF加载到内存后所形成的“视图”或结构,也就是说ELF文件存在硬盘上或者被加载到内存,它展现出来的形态不一致。...最后p_align表示内存对齐方式,它的取值为2的指数,同时p_vaddr必须等于(p_offset % p_align) 了解了ELF二进制内部原理后,我们需要实现手动加载ELF文件,实现这个目标,我们需要依赖一个库叫...Binary类用于对整个elf文件的抽象,通过它可以访问ELF文件相关信息,Section是对前面章节描述的段对象的抽象,Symbol是对前面章节符号表对象的抽象。...load_binary是来自libbfd库提供的函数,它将elf文件加载到内存中。

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【Android 逆向】ELF 文件格式 ( ELF 程序头入口大小 | ELF 程序头入口个数 | ELF 文件节区头入口大小 | ELF 文件节区头入口个数 | 字符表序号 )

文章目录 一、ELF 程序头入口大小 二、ELF 程序头入口个数 三、ELF 文件节区头入口大小 四、ELF 文件节区头入口个数 五、字符表序号 一、ELF 程序头入口大小 ---- ELF 文件头 第...32 字节 ; 二、ELF 程序头入口个数 ---- ELF 文件头 第 44 ~ 45 字节 : ELF 程序头入口个数 ; 这里是 7 个 ; 07 00 小端格式 , 低位在低地址 , 值为...7 ; 如下图所示 , 程序头是由 7 个入口组成 , 每个入口大小是 32 字节 ; 三、ELF 文件节区头入口大小 ---- ELF 文件头 第 46 ~ 47 字节 : ELF 文件节区头入口大小字节数...文件节区头入口个数 ---- ELF 文件头 第 48 ~ 49 字节 : ELF 文件节区头入口个数 ; 这里是 21 个 ; 15 00 小端格式 , 低位在低地址 , 值为 21 ; 下图选中的部分..., 就是一个节区头入口的大小 , 有 21 个节区头入口 , 每个节区头入口大小 40 字节 ; 五、字符表序号 ---- ELF 文件头 第 50 ~ 51 字节 : ELF 文件 字符表序号 ;

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ELF文件结构描述

ELF目标文件格式最前部ELF文件头(ELF Header),它包含了描述了整个文件的基本属性,比如ELF文件版本、目标机器型号、程序入口地址等。...ELF文件头结构及相关常数被定义在“/usr/include/elf.h”,因为ELF文件在各种平台下都通用,ELF文件有32位版本和64位版本的ELF文件的文件头内容是一样的,只不过有些成员的大小不一样...Elf32_Word e_version; Elf32_Addr e_entry; Elf32_Off e_phoff; Elf32_Off e_shoff; Elf32..._Word e_flags; Elf32_Half e_ehsize; Elf32_Half e_phentsize; Elf32_Half e_phnum; Elf32...段表 段表就是保存ELF文件中各种各样段的基本属性的结构。段表是ELF除了文件以外的最重要结构体,它描述了ELF的各个段的信息,ELF文件的段结构就是由段表决定的。

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ELF文件-逆向工具

ELF文件-逆向工具 转载一篇逆向工具的文章: 原文 1、ELF文件内容解析 readelf: 可解析ELF文件的所有内容; strings: 查看ELF文件中的字符串; file : 查看ELF...文件的信息; nm : 查看ELF文件中的符号信息; ldd : 查看ELF文件所依赖的库文件; 2、objdump 用于对ELF文件进行反汇编; objdump -d ;反汇编部分可执行的二进制代码...; hexdump -C elf_file_name 4、od 以指定的进制格式查看ELF格式的二进制可执行文件的内容;默认是八进制; od -t x4 ;-t指定格式化的字节单元单位; ;x4...; xxd -s -10 ;以ELF文件尾处的第1个字节为参照,从第10个字节处开始显示; 6、编辑ELF文件使用vi/vim与命令xxd配合完成;STEP1:使用vi/vim以二进制模式打开ELF文件...xxd"表示把当前文件中的所有行传递给外部命令xxd; 7、动态调试工具 ltrace: 跟踪ELF文件或进程对库函数的调用(library_function_call); strace: 跟踪ELF

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ELF 64 格式详解

, 包含代码和数据,是可以执行运行的程序,代码和数据都有固定的地址 ELF文件内容 一个ELF文件需要包含以下部分: elf文件头,必须出现在elf文件的开头 节头表(Section header table...ELF节 节包含了ELF文件中除了文件头,程序段头表,节头表之外的所有内容。...举一个例子,上图中第一项的名字是".note.android.ident",看看是如何计算的。...内容如下: image.png 按照上述的结构定义,可以看到sh_offset 的偏移是0xD4EADC, 再加上字符串偏移 0x0B,位置就是0xD4EAE7 image.png 这样就字符串位置计算出来了...(s, t)(((s) << 32) + ((t) & 0xf f f f f f f f L)) r_addend 计算重定向位置时候需要额外加的常数项 程序段头表 对于可执行和共享库,为了加载方便,

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