宏基因组学分析简介

宏基因组分析使用宏基因组测序技术来产生数据并完成后续一系列数据处理和挖掘。相比于基于16S基因测序的研究方法，宏基因组研究方法可以全面的分析微生物的物种、基因组成。

下图是宏基因组分析的一般流程：

相关名词解释

基因集（Gene Catalog）：由所有样本中检测到的基因构成的集合。非冗余基因集（Non-redundant Gene Catalog）：将所有样本的基因以一定的阈值进行聚类，每个类别取最长的基因作为代表序列。物种分类学注释：将基因集序列与参考数据库比对，并根据分类学谱系系统得到该序列的物种分类地位，从而分析得到整个基因集的物种信息；COG功能注释：将基因集序列与COG参考数据库比对，获得基因集的同源聚类蛋白群的相应功能注释信息；KEGG功能注释：将基因集序列与KEGG的基因组数据库比对，获得基因集在代谢、酶、反应和功能模块方面的注释信息。CAZy、CARD数据库注释：将基因集序列与特殊数据库比对，如 CAZy数据库（Carbohydrate-Active enZYmes Database，碳水化合物活性酶）、 CARD数据库（Comprehensive Antibiotic Resistance Database，抗生素抗性基因）， 获得基因集特殊的功能信息

KEGG

COG

CAZy数据库注释

CARD数据库注释

市场部李朦 文案

市场部潘旭兰 编辑

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